| 研究課題/領域番号 |
19K20663
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| 研究機関 | 東京大学 |
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研究代表者 |
波田野 明日可 東京大学, 大学院工学系研究科(工学部), 講師 (20707202)
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| 研究期間 (年度) |
2019-04-01 – 2023-03-31
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| キーワード | 心筋細胞 / 機械学習 / 形状抽出 / 数値解析 |
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| 研究実績の概要 |
マウス心筋細胞電子顕微鏡画像からミトコンドリアを個として自動抽出することに成功した．畳み込みニューラルネットワークで電子顕微鏡画像に特化したCDeep3Mを利用して領域と境界を抽出後，画像処理を重ねることで個々のミトコンドリアを3次元的に分離した．体積や形状を文献データと比較し妥当な結果が得られていることを確認した．
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
2: おおむね順調に進展している
理由
本研究では，第一ステップとして機械学習・画像処理を用いて心筋細胞電子顕微鏡画像から細胞内小器官を個として自動抽出することを初期目標としている．細胞の電子顕微鏡画像の認識で実績があるCDeep3Mをベースにミトコンドリアの個別抽出に成功し，次ステップのメッシュ作成に取り掛かっている．
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| 今後の研究の推進方策 |
ミトコンドリア以外の細胞内小器官の自動抽出を進めると同時に，統合シミュレーターの実形状モデル適用を進めていく．ミトコンドリアはメッシュ作成に取り掛かっており，まずは体積の多くを占めるミトコンドリアと筋原線維をモデリングし，その形状の影響を解析する．
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| 次年度使用額が生じた理由 |
他研究費によりサーバー代が賄われたため残額が生じた．次年度の国際学会での発表費用として用いることとした．
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