• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2019 年度 実績報告書

クロマチン構成因子DEKによるクロマチン構造制御機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 19K21177
配分区分基金
研究機関東京大学

研究代表者

鯨井 智也  東京大学, 定量生命科学研究所, 助教 (70823566)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2020-03-31
キーワードクロマチン / DEK / 癌
研究実績の概要

ヒトをはじめとする真核生物に置いては、遺伝情報の担体であるゲノムDNAは、クロマチン構造をとって細胞核内に収納されている。クロマチンは、弛緩した状態や凝縮した状態など、ダイナミックに構造変換する。この構造変換によって、DNAと転写や複製、DNA修復装置との相互作用が調節されることで、生物の発生や、分化が実現される。また、その破綻は、癌化をはじめ、生活習慣病、精神疾患など、多岐にわたる疾病を引き起こす。
本研究では、細胞核内にユビキタスに存在するクロマチン結合因子DEKが、クロマチン構造に与える影響を明らかにすることを目的としている。DEKは、様々な臓器の癌化、また関節リウマチに関与することが知られており、その機能解明が急務である。DEKによるクロマチン構造の解明のためには、DEKのクロマチン結合ドメインを同定し、そのドメインの詳細な性状情報を得ることが重要である。そのため本年度は、DEK変異体を調製し、生化学的解析によってDEKのクロマチン結合ドメインを同定した。そして、X線結晶解析に向けてクロマチン結合ドメインを大量調製し、結晶化ロボットを用いて大規模な結晶化スクリーニングを行った。研究期間全体を通して、DEKによる特徴的なクロマチン制御機構の分子基盤情報と、転写やDNA修復へ与える影響の知見が得られた。本知見は、細胞核内におけるクロマチン制御機構の知識を深化するものであると同時に、癌において見いだされているDEK変異体の作用機序についての知見を提供する。

  • 研究成果

    (12件)

すべて 2020 2019

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (6件) (うち国際学会 1件、 招待講演 4件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Transcription through the nucleosome2020

    • 著者名/発表者名
      Kujirai Tomoya、Kurumizaka Hitoshi
    • 雑誌名

      Current Opinion in Structural Biology

      巻: 61 ページ: 42~49

    • DOI

      10.1016/j.sbi.2019.10.007

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Biochemical and structural analyses of the nucleosome containing human histone H2A.J2019

    • 著者名/発表者名
      Tanaka Hiroki、Sato Shoko、Koyama Masako、Kujirai Tomoya、Kurumizaka Hitoshi
    • 雑誌名

      The Journal of Biochemistry

      巻: 167 ページ: 419~427

    • DOI

      10.1093/jb/mvz109

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure determination of the nucleosome core particle by selenium SAD phasing2019

    • 著者名/発表者名
      Saotome Mika、Horikoshi Naoki、Urano Kazuki、Kujirai Tomoya、Yuzurihara Hidetaka、Kurumizaka Hitoshi、Kagawa Wataru
    • 雑誌名

      Acta Crystallographica Section D Structural Biology

      巻: 75 ページ: 930~936

    • DOI

      10.1107/S2059798319012713

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure-based design of an H2A.Z.1 mutant stabilizing a nucleosome in?vitro and in?vivo2019

    • 著者名/発表者名
      Horikoshi Naoki、Kujirai Tomoya、Sato Koichi、Kimura Hiroshi、Kurumizaka Hitoshi
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      巻: 515 ページ: 719~724

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2019.06.012

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Biochemical analysis of nucleosome targeting by Tn5 transposase2019

    • 著者名/発表者名
      Sato Shoko、Arimura Yasuhiro、Kujirai Tomoya、Harada Akihito、Maehara Kazumitsu、Nogami Jumpei、Ohkawa Yasuyuki、Kurumizaka Hitoshi
    • 雑誌名

      Open Biology

      巻: 9 ページ: 190116~190116

    • DOI

      10.1098/rsob.190116

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Structural insight into the nucleosomal DNA transcription by RNA polymerase II2019

    • 著者名/発表者名
      Kujirai T, Ehara H, Fujino Y, Shirouzu M, Sekine S, Kurumizaka H.
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Laboratory meeting, Mechanisms of Eukaryotic Transcription
    • 国際学会
  • [学会発表] Structural transition of nucleosome during RNA polymerase II transcription revealed by cryo-EM2019

    • 著者名/発表者名
      Tomoya Kujirai, Haruhiko Ehara, Yuka Fujino, Mikako Shirouzu, Shun-ichi Sekine, Hitoshi Kurumizaka
    • 学会等名
      第57回生物物理学会年会
    • 招待講演
  • [学会発表] 試験管内転写系によるクロマチン構造変換機構の生化学的、構造生物学的解析2019

    • 著者名/発表者名
      鯨井智也、江原晴彦、藤野優佳、白水美香子、関根俊一、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第92回生化学会大会
  • [学会発表] クロマチン構造における転写反応の構造基盤の解明2019

    • 著者名/発表者名
      鯨井智也
    • 学会等名
      第92回生化学会大会
    • 招待講演
  • [学会発表] クロマチンによる転写制御の構造生物学的解析2019

    • 著者名/発表者名
      鯨井智也、江原晴彦、藤野優佳、白水美香子、関根俊一、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第19回日本蛋白質科学会年会 第71回日本細胞生物学会大会 合同年次大会
    • 招待講演
  • [学会発表] Structural study of transcription on chromatin2019

    • 著者名/発表者名
      鯨井智也、江原晴彦、藤野優佳、白水美香子、関根俊一、胡桃坂仁志
    • 学会等名
      第13回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 招待講演
  • [図書] イメージング時代の構造生命科学2020

    • 著者名/発表者名
      鯨井智也, 滝沢由政, 胡桃坂仁志
    • 総ページ数
      5
    • 出版者
      羊土社
    • ISBN
      978-4-7581-0385-5

URL: 

公開日: 2021-01-27  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi