| 研究課題/領域番号 |
19K21203
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| 補助金の研究課題番号 |
18H06080 (2018)
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| 研究種目 |
研究活動スタート支援
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| 配分区分 | 基金 (2019)
補助金 (2018) |
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| 審査区分 |
0703:個体レベルから集団レベルの生物学と人類学およびその関連分野
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| 研究機関 | 国立研究開発法人海洋研究開発機構 |
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研究代表者 |
平岡 聡史 国立研究開発法人海洋研究開発機構, 海洋機能利用部門(生命理工学センター), 特任研究員 (70824423)
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| 研究期間 (年度) |
2018-08-24 – 2020-03-31
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| キーワード | メタエピゲノム解析 / メタゲノム解析 / 海洋細菌 / バイオインフォマティクス |
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| 研究成果の概要 |
本研究では、深海熱水噴出孔に生息する細菌叢を対象に、DNAメチル化修飾の多様性やそのシステムの進化解析を予定していた。ところが、おそらく夾叉物等の影響により、深海熱水噴出孔からのDNA抽出やシーケンスが困難であることが判明した。このため、研究対象を熱水細菌叢から海洋細菌叢に変更した。海洋微生物のDNAを十分量採取し、DNAの大量調製とPacBioシーケンサーを用いたショットガンシーケンシング、そしてバイオインフォマティクスによるデータ解析を行った結果、新規のものを含む複数の多様なメチル化モチーフを検出できた。本研究から、海洋環境における微生物エピゲノムに関する新規な知見を得ることができた。
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| 自由記述の分野 |
バイオインフォマティクス
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| 研究成果の学術的意義や社会的意義 |
新型のゲノム解析技術を用いることで、環境中の細菌叢（微生物集団）のエピゲノムを直接解明することを可能にする「メタエピゲノム解析」を、世界で初めて海洋水中の細菌叢に適用した。結果、既存の研究からは想像できないほど多様で普遍的なDNAメチル化モチーフを検出することに成功し、海洋環境中の細菌が持つエピゲノムの包括的な評価のための足がかりとすることができた。
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