• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2019 年度 実施状況報告書

細胞外小胞のRNAメチル化計測によるがんバイオマーカーの最高性能化と実用化

研究課題

研究課題/領域番号 19K22658
研究機関大阪大学

研究代表者

石井 秀始  大阪大学, 医学系研究科, 特任教授(常勤) (10280736)

研究分担者 土岐 祐一郎  大阪大学, 医学系研究科, 教授 (20291445)
江口 英利  大阪大学, 医学系研究科, 教授 (90542118)
今野 雅允  大阪大学, 医学系研究科, 寄附講座講師 (80618207)
浅井 歩  大阪大学, 産業科学研究所, 特任助教(常勤) (40783262)
研究期間 (年度) 2019-06-28 – 2021-03-31
キーワードRNAメチル化 / エピトランスクリプトーム / シークエンス
研究実績の概要

マイクロRNAのM6Aを正確に計測するために、TS法とMS法による計測法を開発し、その精度を最大化するために開発研究を行ってきた。その結果、血液中に含まれるエクソゾーム(EV)の外側の形状とその中身のシークエンスを高い精度で行う事に成功した。第1に、EVの選別から外側の形状のみで高い精度で由来する臓器を診断する技術を確立した。第2にEVの中身から核酸の修飾を含めた全プロファイリングを実施し、未診断疾患における新たな診断ツールとして性能を確立した。得られた技術は大阪大学の知的財産として特許化を進めている。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

当初の計画にしたがって進めるとともに、大阪大学産業科学研究所の人工知能(AI)の技術を投入することによって解析速度が格段に向上した。さらに、産学連携による質量分析計測法の技術革新によるスピード向上も加わり、ハイスルプットなデータを獲得することができた。現在大阪大学の高速計算機と統計学者の協力を頂きながら当初の計画以上に進捗しているところである。

今後の研究の推進方策

機械学習によるデータの集積と解析を進めることにより細胞外小胞のRNAメチル化計測によるがんバイオマーカーの性能を最大限に向上させるべく産学連携を深め、機械学習におけるアルゴリズムの構築とそのアカデミア発の知財化を進めて行く計画である。また平行して企業化も積極的に進めていく計画である。

  • 研究成果

    (15件)

すべて 2020 2019

すべて 雑誌論文 (8件) (うち国際共著 1件、 査読あり 8件、 オープンアクセス 8件) 学会発表 (7件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] Theoretical analyses and experimental validation of the effects caused by the fluorinated substituent modification of DNA2020

    • 著者名/発表者名
      Koseki Jun、Konno Masamitsu、Asai Ayumu、Horie Naohiro、Tsunekuni Kenta、Kawamoto Koichi、Obika Satoshi、Doki Yuichiro、Mori Masaki、Ishii Hideshi
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 10 ページ: 1138

    • DOI

      10.1038/s41598-020-57899-7

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] One-carbon metabolism for cancer diagnostic and therapeutic approaches2020

    • 著者名/発表者名
      Asai Ayumu、Konno Masamitsu、Koseki Jun、Taniguchi Masateru、Vecchione Andrea、Ishii Hideshi
    • 雑誌名

      Cancer Letters

      巻: 470 ページ: 141~148

    • DOI

      10.1016/j.canlet.2019.11.023

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] CD44/CD133-Positive Colorectal Cancer Stem Cells are Sensitive to Trifluridine Exposure2019

    • 著者名/発表者名
      Tsunekuni Kenta、Konno Masamitsu、Haraguchi Naotsugu、Koseki Jun、Asai Ayumu、Matsuoka Kazuaki、Kobunai Takashi、Takechi Teiji、Doki Yuichiro、Mori Masaki、Ishii Hideshi
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 9 ページ: 14861

    • DOI

      10.1038/s41598-019-50968-6

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Distinct methylation levels of mature microRNAs in gastrointestinal cancers2019

    • 著者名/発表者名
      Konno Masamitsu、Koseki Jun、Asai Ayumu、Yamagata Akira、Shimamura Teppei、Motooka Daisuke、Okuzaki Daisuke、Kawamoto Koichi、Mizushima Tsunekazu、Eguchi Hidetoshi、Takiguchi Shuji、Satoh Taroh、Mimori Koshi、Ochiya Takahiro、Doki Yuichiro、Ofusa Ken、Mori Masaki、Ishii Hideshi
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 10 ページ: 3888

    • DOI

      10.1038/s41467-019-11826-1

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Computational analyses for cancer biology based on exhaustive experimental backgrounds2019

    • 著者名/発表者名
      Koseki Jun、Konno Masamitsu、Ishii Hideshi
    • 雑誌名

      Cancer Drug Resistance

      巻: 2 ページ: 419-427

    • DOI

      10.20517/cdr.2019.33

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Application of C. elegans cancer screening test for the detection of pancreatic tumor in genetically engineered mice2019

    • 著者名/発表者名
      Ueda Yuji、Kawamoto Koichi、Konno Masamitsu、Noguchi Kozo、Kaifuchi Satoru、Satoh Taroh、Eguchi Hidetoshi、Doki Yuichiro、Hirotsu Takaaki、Mori Masaki、Ishii Hideshi
    • 雑誌名

      Oncotarget

      巻: 10 ページ: 5412-5418

    • DOI

      10.18632/oncotarget.27124

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A Hydrogen Peroxide Activatable Gemcitabine Prodrug for the Selective Treatment of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma2019

    • 著者名/発表者名
      Matsushita Katsunori...19名略...Ishii Hideshi、Obika Satoshi
    • 雑誌名

      ChemMedChem

      巻: 14 ページ: 1384~1391

    • DOI

      10.1002/cmdc.201900324

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Significant Epitranscriptomes in Heterogeneous Cancer2019

    • 著者名/発表者名
      Konno Masamitsu、Taniguchi Masateru、Ishii Hideshi
    • 雑誌名

      Cancer Science

      巻: 110 ページ: 2318-2327

    • DOI

      10.1111/cas.14095

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] RNA metabolism can be a novel new bio marker for malignant gastrointestinal cancer2019

    • 著者名/発表者名
      M. Konno, H. Ishii
    • 学会等名
      Cell Symposia: Regulatory RNAs
    • 国際学会
  • [学会発表] RNA 塩基修飾を指標とした早期膵がんの新規バイオマーカー2019

    • 著者名/発表者名
      今野 雅允、小関 準、島村 徹平、浅井 歩、石井 秀始
    • 学会等名
      第21回日本RNA学会年会
  • [学会発表] 転移とEMT・がん幹細胞2019

    • 著者名/発表者名
      石井 秀始
    • 学会等名
      第28回 日本がん転移学会学術集会・総会
  • [学会発表] 代謝を利用した診断2019

    • 著者名/発表者名
      石井 秀始、曽我 朋義
    • 学会等名
      第7回がんと代謝研究会in仙台
  • [学会発表] がんエピトランスクリプトームを活用した新しい診断と治療2019

    • 著者名/発表者名
      石井 秀始
    • 学会等名
      第11回日本RNAi研究会(The 11th JARI Annual Meeting)
  • [学会発表] Innovative technology for next generation liquid biopsy 次世代リキッドバイオプシーのための新技術2019

    • 著者名/発表者名
      石井 秀始、Chwee Teck Lim
    • 学会等名
      第78回日本癌学会学術総会
  • [学会発表] エピトランスクリプトーム ー消化器がんの新規バイオマーカー2019

    • 著者名/発表者名
      今野 雅允、石井 秀始
    • 学会等名
      第78回日本癌学会学術総会

URL: 

公開日: 2021-01-27  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi