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2020 年度 実績報告書

細胞外小胞のRNAメチル化計測によるがんバイオマーカーの最高性能化と実用化

研究課題

研究課題/領域番号 19K22658
研究機関大阪大学

研究代表者

石井 秀始  大阪大学, 医学系研究科, 特任教授(常勤) (10280736)

研究分担者 土岐 祐一郎  大阪大学, 医学系研究科, 教授 (20291445)
江口 英利  大阪大学, 医学系研究科, 教授 (90542118)
今野 雅允  大阪大学, 医学系研究科, 寄附講座講師 (80618207)
浅井 歩  大阪大学, 産業科学研究所, 特任助教(常勤) (40783262)
研究期間 (年度) 2019-06-28 – 2021-03-31
キーワードRNAメチル化 / エピトランスクリプトーム / シークエンス
研究実績の概要

マイクロRNAのM6Aを正確に計測するために、TS法とMS法による計測法を開発し、その精度を最大化するために開発研究を行ってきた。その結果、血液中に含まれるエクソゾーム(EV)の外側の形状とその中身のシークエンスを高い精度で行う事に成功した。第1に、EVの選別から外側の形状のみで高い精度で由来する臓器を診断する技術を確立した。第2にEVの中身から核酸の修飾を含めた全プロファイリングを実施し、未診断疾患における新たな診断ツールとして性能を確立した。
得られた技術は大阪大学の知的財産として特許化を進めている。最終年度は、これまでの解析で得られたEVの内外の情報を統合して臨床材料を用いたバイオマーカーの性能の最適化を実施した。新しいシーズに関しては知的財産を整備し、将来のベンチャー化に向けたわが国発の基盤技術として整備した。
特に、RNAメチル化に関して、大阪大学発の新しい技術を用いて高い精度で計測を行い、得られた結果のデータを標準的な他の次世代シークエンス技術と比較して、両者が相補的でありかつ大阪大学のTS法とMS法が一分子一塩基レベルでの情報の取得と疾患のプロファイリングにおいて優れていることが明らかとなった。このプロファイリングの結果を参照して、新たな医薬品であるエピトランスクリプトームを標的とした創薬に向けて基盤を構築することができた。
得られた成果はコンパニオン診断技術として応用することが可能である。最近海外の研究グループから報告されたエピトランスクリプトームの阻害化合物であるSTMシリーズを例とするような医薬品に対してもその診断性能が発揮できることが明らかとなった。

  • 研究成果

    (14件)

すべて 2020

すべて 雑誌論文 (9件) (うち国際共著 5件、 査読あり 9件、 オープンアクセス 9件) 学会発表 (2件) 産業財産権 (3件) (うち外国 3件)

  • [雑誌論文] Theoretical analyses and experimental validation of the effects caused by the fluorinated substituent modification of DNA2020

    • 著者名/発表者名
      Koseki Jun、Konno Masamitsu、Asai Ayumu、Horie Naohiro、Tsunekuni Kenta、Kawamoto Koichi、Obika Satoshi、Doki Yuichiro、Mori Masaki、Ishii Hideshi
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 10 ページ: 1138

    • DOI

      10.1038/s41598-020-57899-7

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] One-carbon metabolism for cancer diagnostic and therapeutic approaches2020

    • 著者名/発表者名
      Asai Ayumu、Konno Masamitsu、Koseki Jun、Taniguchi Masateru、Vecchione Andrea、Ishii Hideshi
    • 雑誌名

      Cancer Letters

      巻: 470 ページ: 141~148

    • DOI

      10.1016/j.canlet.2019.11.023

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Convolutional Neural Network Can Recognize Drug Resistance of Single Cancer Cells2020

    • 著者名/発表者名
      Yanagisawa Kiminori、Toratani Masayasu、Asai Ayumu、Konno Masamitsu、Niioka Hirohiko、Mizushima Tsunekazu、Satoh Taroh、Miyake Jun、Ogawa Kazuhiko、Vecchione Andrea、Doki Yuichiro、Eguchi Hidetoshi、Ishii Hideshi
    • 雑誌名

      International Journal of Molecular Sciences

      巻: 21 ページ: 3166~3166

    • DOI

      10.3390/ijms21093166

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] State-of-the-Art Technology of Model Organisms for Current Human Medicine2020

    • 著者名/発表者名
      Konno Masamitsu、Asai Ayumu、Kitagawa Toru、Yabumoto Masami、Ofusa Ken、Arai Takahiro、Hirotsu Takaaki、Doki Yuichiro、Eguchi Hidetoshi、Ishii Hideshi
    • 雑誌名

      Diagnostics

      巻: 10 ページ: 392~392

    • DOI

      10.3390/diagnostics10060392

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Immuno-Surgical Management of Pancreatic Cancer with Analysis of Cancer Exosomes2020

    • 著者名/発表者名
      Takeda Yu、Kobayashi Shogo、Kitakaze Masatoshi、Yamada Daisaku、Akita Hirofumi、Asai Ayumu、Konno Masamitsu、Arai Takahiro、Kitagawa Toru、Ofusa Ken、Yabumoto Masami、Hirotsu Takaaki、Vecchione Andrea、Taniguchi Masateru、Doki Yuichiro、Eguchi Hidetoshi、Ishii Hideshi
    • 雑誌名

      Cells

      巻: 9 ページ: 1645~1645

    • DOI

      10.3390/cells9071645

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Genome-wide association meta-analysis identifies GP2 gene risk variants for pancreatic cancer2020

    • 著者名/発表者名
      Lin Yingsong、et al
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 11 ページ: 3175

    • DOI

      10.1038/s41467-020-16711-w

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] A Four-Dimensional Organoid System to Visualize Cancer Cell Vascular Invasion2020

    • 著者名/発表者名
      Yanagisawa Kiminori、Konno Masamitsu、Liu Hao、Irie Shinji、Mizushima Tsunekazu、Mori Masaki、Doki Yuichiro、Eguchi Hidetoshi、Matsusaki Michiya、Ishii Hideshi
    • 雑誌名

      Biology

      巻: 9 ページ: 361~361

    • DOI

      10.3390/biology9110361

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] COVID-19 Drug Discovery Using Intensive Approaches2020

    • 著者名/発表者名
      Asai Ayumu、Konno Masamitsu、Ozaki Miyuki、Otsuka Chihiro、Vecchione Andrea、Arai Takahiro、Kitagawa Toru、Ofusa Ken、Yabumoto Masami、Hirotsu Takaaki、Taniguchi Masateru、Eguchi Hidetoshi、Doki Yuichiro、Ishii Hideshi
    • 雑誌名

      International Journal of Molecular Sciences

      巻: 21 ページ: 2839~2839

    • DOI

      10.3390/ijms21082839

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Hereditary pancreatitis model by blastocyst complementation in mouse2020

    • 著者名/発表者名
      Asai Ayumu、Konno Masamitsu、Kawamoto Koichi、Isotani Ayako、Mori Masaki、Eguchi Hidetoshi、Doki Yuichiro、Arai Takahiro、Ishii Hideshi
    • 雑誌名

      Oncotarget

      巻: 11 ページ: 2061~2073

    • DOI

      10.18632/oncotarget.27595

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] miRNAメチル化2020

    • 著者名/発表者名
      石井秀始
    • 学会等名
      第79回日本癌学会学術総会
  • [学会発表] RNA Expression and Methylation in Liquid Biopsy2020

    • 著者名/発表者名
      石井秀始
    • 学会等名
      第79回日本癌学会学術総会
  • [産業財産権] トンネル電流を使用したマイクロRNA解析2020

    • 発明者名
      谷口正輝、石井秀始、大城敬人、今野雅允
    • 権利者名
      谷口正輝、石井秀始、大城敬人、今野雅允
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      PCT/JP2020/ 017654
    • 外国
  • [産業財産権] miR302核酸改変体2020

    • 発明者名
      石井秀始、今野雅允、小比賀聡、森正樹
    • 権利者名
      石井秀始、今野雅允、小比賀聡、森正樹
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      PCT/JP2020/ 017659
    • 外国
  • [産業財産権] エピジェネティックスを標的とした新規医薬2020

    • 発明者名
      石井秀始、他7名
    • 権利者名
      石井秀始、他7名
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      PCT/JP2020/017607
    • 外国

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公開日: 2021-12-27  

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