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2021 年度 実施状況報告書

エンテロウイルスD68の世界規模での流行に関与する要因の解析

研究課題

研究課題/領域番号 19K22733
研究機関東北大学

研究代表者

押谷 仁  東北大学, 医学系研究科, 教授 (80419994)

研究期間 (年度) 2019-06-28 – 2023-03-31
キーワードエンテロウイルスD68 / エンテロウイルス / EV-D68 / インフルエンザ / RSウイルス
研究実績の概要

エンテロウイルスD68(EV-D68)は2014年から2015年にかけて世界的に大きな流行を起こしたが、その主流となっていたのはClade Bのウイルスであった。その後、Calde Dのウイルスが世界的にも主流となったことが示されている。フィリピンにおいても2018年にはClade Dのウイルスが数多く検出された。どのような遺伝子の変化がClade Dのウイルスに起きたのかを確認する目的で2008年からフィリピンで検出されていたClade DのウイルスのFull Genome Sequencingを行った。この結果、フィリピンで検出されたClade Dのウイルスにも2016年以降に多くのアミノ酸変異が蓄積されていたことがわかった(Microbiol Resour Announc. 2021 Sep 30;10(39):e0070921)。またClade BからClade Dに主流株が変わっていった背景に抗原性の違いが関与している可能性が考えられたために、フィリピンの一地域でそれぞれの株の流行後のClade BとClade Dに対する抗体価をELISAと中和試験で検討したところ、それぞれのCladeの株の流行後にはその株に対する抗体価が上昇する傾向が確認された。このことはCladeの置き換わりに、抗原性の違いが関与している可能性を示唆するものである。またCalde BとClade Dのウイルスについてフィリピンの株と他の国の株のシークエンスの比較を行った。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

新型コロナウイルスのパンデミックのためにフィリピンへの渡航が困難な状態が続いており、さらにフィリピンでの新たな検体採取は中断している。しかしこれまで収集した検体の解析は順調に進んでおり、特に2016年以降フィリピンにおいても主流株となったClade Dのウイルスの解析を中心に行った。

今後の研究の推進方策

これまでに得られた遺伝子や疫学情報の解析をさらに進め、EV-D68の進化と流行の関係について最終的な解析を進めていく予定としている。

次年度使用額が生じた理由

新型コロナウイルス流行によりフィリピン側の共同研究機関での新たな検体収集が困難な状況となり、当初予定していた解析の一部ができなかった。また試薬なども手に入りにくく使用期限もあるため消耗品等も含め購入を控える必要があった。
今後はフィリピンへの渡航が可能となった場合に備え現地で可能か限り試薬などの消耗品の購入を進め解析を進め、学術論文化を進めていく予定である。

  • 研究成果

    (3件)

すべて 2021 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (1件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件、 オープンアクセス 1件)

  • [国際共同研究] Research Institute of Tropical Medicine(フィリピン)

    • 国名
      フィリピン
    • 外国機関名
      Research Institute of Tropical Medicine
  • [国際共同研究] The University Teaching Hospital(ザンビア)

    • 国名
      ザンビア
    • 外国機関名
      The University Teaching Hospital
  • [雑誌論文] Complete Genome Sequences of Enterovirus D68 Clade A and D Strains in the Philippines2021

    • 著者名/発表者名
      Okamoto Michiko、Sakamoto Masahiro、Dapat Clyde、Saito Mayuko、Saito-Obata Mariko、Tamaki Raita、Lupisan Socorro P.、Quiambao Beatriz P.、Oshitani Hitoshi
    • 雑誌名

      Microbiology Resource Announcements

      巻: 10(39) ページ: e0070921

    • DOI

      10.1128/MRA.00709-21

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著

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公開日: 2022-12-28  

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