研究成果の概要 |
本研究では、養殖マダイ5系統からGRAS-Di解析により一塩基多型(SNP)を取得した。各集団98,047から187,568個のSNPが得られ、欠損率やマイナーアリル頻度、ハーディーワインベルグの法則からの逸脱などを指標としたフィルタリングを行い、各集団に共通したSNPを選択したところ、全集団に共通した2,536個のSNPを得ることができた。また、これらの中から、1Mbp以上の間隔をとっているSNPのみを選び、連鎖不平衡の影響が少ない255個のSNPを選び出した。それらSNPについてプライマーを設計し、マルチプレックスPCR系を開発した。
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