研究課題
本研究では陸上植物に共通するオーキシン応答遺伝子ファミリーであるWIPに着目している。コケ植物ゼニゴケをモデルにWIP遺伝子のA) 発現パターンの解析、B) 機能改変株の表現型解析、C) 下流遺伝子の同定と機能解析に取り組み、本年度はA）、C）について下記の成果を得た。A) WIPの発現組織を細胞レベルで解析するため、WIPプロモーター下流でWIPタンパク質と蛍光タンパク質の融合タンパク質を発現するコンストラクトを作成しwip変異体への導入を試みた。蛍光タンパク質の種類（Citrine、eGFP、tagRFP、mNeonGreen）、WIPとの融合の仕方（C末端、N末端）、ゲノムへの組み込み方法（T-DNA挿入、騒動組み換え）、それぞれについて複数の手法を試みたものの、表現型を完全に相補する株が得られなかったため、蛍光タンパク質をレポーターとする発現組織解析を断念した。C) 前年度に薬剤依存的なWIP過剰発現株を用いたRNA-seqを行い、WIPの下流候補遺伝子を同定していた。このデータと、2020年に公開された被子植物シロイヌナズナのWIP過剰発現株を用いたRNA-seqデータを比較することで、ゼニゴケとシロイヌナズナの間で共通してWIPに制御される遺伝子ファミリーの同定を試みた。その結果、オーキシン生合成、ROPシグナリングを含む先端成長、杯状体及び腋芽の発生に関わる転写因子などの遺伝子が同定された。またクロマチン免疫沈降実験によるWIPの直接の標的遺伝子同定のため、薬剤依存的にGFP付きWIPタンパク質を発現する株の作出を試みたが表現型を示す株は得られなかった。
すべて 2021
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Cold Spring Harbor Perspectives in Biology
巻: 13 ページ: a040048～a040048
10.1101/cshperspect.a040048
