研究課題/領域番号 |
19K23980
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研究機関 | 筑波大学 |
研究代表者 |
鈴木 敏夫 筑波大学, 医学医療系, 講師 (70771856)
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研究期間 (年度) |
2019-08-30 – 2023-03-31
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キーワード | 肺オルガノイド / シングルセル解析 / Pulmosphere / SIRT3 / ヒト肺検体 |
研究実績の概要 |
肺線維症合併肺がんヒト肺検体よりPulmosphereを作成し、2019年と同様の実験系を試みた。シングルセル化した後に血管内皮細胞だけCD31のpositive selectionでsortingし、CRISPR/Cas9にてSIRT3ノックアウトを実施/非実施した群にて比較検討を実施した。invasion assayでは有意な差を得ることができ、それぞれの構成細胞(特に繊維芽細胞)の質的変化についてRNAseqにて解析を実施した。血管内皮細胞においてはEndMT関連のtranscriptional markersが有意に変動していることが明らかになった。Sirt3が脂質過酸化を介して肺血管内皮細胞のEndMTを抑制することを検証するべく、脱アセチル化能に与える影響についての検討をタンパク発現解析によって実施した。 その後、血管内皮特異的Sirt3ノックアウトマウス及びSirt3過剰発現マウスを用いた解析を実施する予定だったが、血管内皮特異的なマウスモデルの作成がうまく行かず、Pulmosphereのsingle cell RNA seq、空間的トランスクリプトーム解析を実施することで、間接的な証明を実施する方針となった。現在その解析途中であるが、同時に、Sirt3活性化を誘導するジヒドロミリセチン(DHM)の投与を各種動物モデルで実施して臨床応用が可能かどうかについてpreclinical studyを追加検討している。
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現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
4: 遅れている
理由
Pulmosphereから回収したRNAのsingle cell RNA seqで手技上の問題が発生しており、その解決に難渋している。
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今後の研究の推進方策 |
single cell suspensionの際に特定の細胞腫のダメージが強くなってバイアスが発生している状態であり、Visium解析の導入を検討している。
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次年度使用額が生じた理由 |
新型コロナウイルス流行に伴い各種研究機材備品の搬入、解析が遅れているため。
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