研究課題
本国際共同研究では、胃癌におけるクロマチン構造解析により、胃癌分子サブタイプとクロマチン構造異常との関連を明らかにし、癌化・癌悪性化メカニズムを解明する。新型コロナにより渡航が叶わなかったが、新たにEBV陰性胃癌臨床検体、EBV陽性胃癌臨床検体を用いたHi-C解析を進めた。また、胃癌Patient-derived xenograft(PDX)を用いて全エクソン解析、RNA-seq解析、InfiniumによるDNAメチル化解析を進め、データを取得した。同じ胃癌PDXサンプルを用いたHi-C解析を進め、クロマチン構造データの取得を進めている。更に国際共同研究としてARID1A欠失細胞、MSH2変異細胞でのHi-C法によるクロマチン構造解析を進め、それぞれ国際共著論文としてGut誌、Cancer Research誌に報告した。
4: 遅れている
新型コロナウイルスの世界的な蔓延により、渡航が難しく、計画が進展しなかった。しかしながら、可能な範囲で国際共同研究を進めるため、国内で取得可能なデータの取得と解析を進めた。また、ZoomによるWeb会議によりディスカッションを進めている。
これまでに取得した胃癌細胞株でのクロマチン構造解析データ、胃癌PDXサンプルでのクロマチン構造解析データを遺伝子変異、遺伝子発現、DNAメチル化データと統合的に解析を進める。また、新型コロナの状況も落ち着いたことから、シンガポール渡航を進め、胃癌臨床サンプルを用いたクロマチン構造のデータ取得と、統合解析を進めていきたい。
すべて 2023 2022
すべて 雑誌論文 (10件) (うち国際共著 3件、 査読あり 8件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件)
Gut
巻: 0 ページ: 1-13
10.1136/gutjnl-2022-328332
International Journal of Cancer
巻: 152 ページ: 1847~1862
10.1002/ijc.34439
Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Basis of Disease
巻: 1869 ページ: 166598~166598
10.1016/j.bbadis.2022.166598
iScience
巻: 25 ページ: 105194~105194
10.1016/j.isci.2022.105194
Cancer Research
巻: 82 ページ: 2538~2551
10.1158/0008-5472.CAN-21-2072
Methods Mol Biol
巻: 2519 ページ: 127~140
10.1007/978-1-0716-2433-3_15
Chemico-Biological Interactions
巻: 360 ページ: 109936~109936
10.1016/j.cbi.2022.109936
Cancer Letters
巻: 532 ページ: 215587~215587
10.1016/j.canlet.2022.215587
Chiba Medical J
巻: 98E ページ: 1-7
10.20776/S03035476-98E-1-P1
病理と臨床
巻: 40 ページ: 19-25