がんの個性の分子診断のための人工機能性核酸

2009 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 20014030
• 研究種目: 特定領域研究
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 独立行政法人理化学研究所
• 研究代表者: 岡本 晃充 独立行政法人理化学研究所, 岡本独立主幹研究ユニット, ユニットリーダー(独立主幹研究員) (60314233)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2009
• キーワード: オスミウム / 一塩基多型 / メチルシトシン / 蛍光 / 人工核酸

研究概要

がん遺伝子研究に役立つ塩基識別型蛍光性核酸セットとシトシンメチル化検出プローブセットを開発した。とくに、メチル化シトシン特異的反応プローブ「ICONプローブ」をわれわれが開発し、これをシトシンメチル化検出プローブセットに応用した。また、次のステップとして、シトシンメチル化部位の可視化に向けて、メチル化部位に対して効果的に色づけするための手法の開発も進めた。

研究成果

• [雑誌論文] Chemical approach toward efficient DNA methylation analysis (2009)
  • 著者名/発表者名: Okamoto, A.
  • 雑誌名: Org. Biomol. Chem. 7(1) ページ: 21-26
  • 査読あり
• [雑誌論文] Synthesis and Use of Osmium-DNA Complexes (2009)
  • 著者名/発表者名: Okamoto, A.
  • 雑誌名: J. Synth. Org. Chem. Jpn. 67(7) ページ: 680-686
  • 査読あり
• [雑誌論文] Hybridization-Sensitive Fluorescent Probe for Long-Term Monitoring of Intracellular RNA (2009)
  • 著者名/発表者名: Kubota, T.; Ikeda, S.; Yanagisawa, H.; Yuki, M.; Okamoto, A.
  • 雑誌名: Bioconjugate Chem. 20(6) ページ: 1256-1261
  • 査読あり
• [雑誌論文] Exciton-Controlled Hybridization-Sensitive Fluorescent Probes: Multicolor Detection of Nucleic Acids Angew. (2009)
  • 著者名/発表者名: Ikeda, S.; Kubota, T.; Yuki, M.; Okamoto, A.
  • 雑誌名: Chem., Int. Ed. 48(35) ページ: 6480-6484
  • 査読あり
• [雑誌論文] Doubly thiazole orange-labeled cytidine for functional expansion of a hybridization-sensitive probe (2009)
  • 著者名/発表者名: Ikeda, S.; Yuki, M.; Yanagisawa, H.; Okamoto, A.
  • 雑誌名: Tetrahedron Lett 50(51) ページ: 7191-7195
  • 査読あり
• [雑誌論文] Hybridization-Sensitive On-Off DNA Probe: Application of the Exciton Coupling Effect to Effective Fluorescence Quenching Chem. (2008)
  • 著者名/発表者名: Ikeda, S.; Okamoto, A.
  • 雑誌名: Asian J. 3(6) ページ: 958-968
  • 査読あり
• [雑誌論文] Synthesis and characterization of the 5-methyl-2'-deoxycytidine glycol-dioxoosmium-bipyridine ternary complex in DNA Org. (2008)
  • 著者名/発表者名: Umemoto, T.; Okamoto, A.
  • 雑誌名: Biomol. Chem. 6(2) ページ: 269-271
  • 査読あり
• [雑誌論文] Synthesis of Bipyridine-Adenine Conjugates for Methylation Analysis Coll. (2008)
  • 著者名/発表者名: Tainaka, K.; Okamoto, A.
  • 雑誌名: Symp. Ser. 10 ページ: 146-149
  • 査読あり
• [雑誌論文] Sequence Dependence of Fluorescence Emission and Quenching of Doubly Thiazole Orange-Labeled DNA (2008)
  • 著者名/発表者名: Ikeda, S.; Kubota, T.; Kino, K.; Okamoto, A.
  • 雑誌名: Effective Design of a Hybridization-Sensitive Probe Bioconjugate Chem. 19(8) ページ: 1719-1725
  • 査読あり
• [雑誌論文] Heterogeneity of osmium oxidation efficiency at consecutive thymines (2008)
  • 著者名/発表者名: Nomura, A.; Okamoto, A.
  • 雑誌名: Org. Biomol. Chem. 6(21) ページ: 3905-3907
  • 査読あり
• [学会発表] ICON probe: Osmium complexation for pinpoint detection of methylated cytosines (2009)
  • 著者名/発表者名: 岡本晃充
  • 学会等名: B IT 2nd Annual Congress and Expo of Molecular Diagnostics (CEMD-2009)
  • 発表場所: Beijing International Convention Center, China
  • 年月日: 2009-11-21
• [学会発表] Doubly Dye-Labeled Nucleotide: Toward Efficient RNA Imaging (2009)
  • 著者名/発表者名: 岡本晃充
  • 学会等名: T he 13th Asian Chemical Congress
  • 発表場所: Shanghai International Convention Center, China
  • 年月日: 2009-09-14
• [学会発表] Exciton-controlled probes for live cell RNA imaging (2009)
  • 著者名/発表者名: 岡本晃充
  • 学会等名: 4 2nd IUPAC Congress "Chemistry for Solving Biological Problems"
  • 発表場所: The Scottish Exhibition and Conference Centre, Glasgow, UK
  • 年月日: 2009-08-06
• [学会発表] Addition of Osmium to DNA Pyrimidine Bases (2009)
  • 著者名/発表者名: 岡本晃充
  • 学会等名: 1 4th International Conference on Biological Inorganic Chemistry (ICBIC 14)
  • 発表場所: Nagoya Congress Center, Nagoya
  • 年月日: 2009-07-28
• [学会発表] Excitonic interaction: New photochemical control for nucleic acid imaging (2009)
  • 著者名/発表者名: 岡本晃充
  • 学会等名: i CeMS Biomaterials at the interface of chemistry, physics, and biology
  • 発表場所: Kyoto University Clock Tower Centennial Hall, Kyoto
  • 年月日: 2009-07-27
• [学会発表] メチル化したDNAを高効率検出する新しい化学 (2009)
  • 著者名/発表者名: 岡本晃充
  • 学会等名: 大阪大学蛋白質研究所セミナー「疾患の基盤としてのエピジェネティクス」
  • 発表場所: 大阪大学蛋白質研究所
  • 年月日: 2009-06-29
• [学会発表] 細胞内RNAの可視化技術 (2009)
  • 著者名/発表者名: 岡本晃充
  • 学会等名: 私立大学戦略的研究基盤形成支援事業「細胞光計測・制御のための新規バイオ技術形成クラスター」講演会
  • 発表場所: 慶應義塾大学
  • 年月日: 2009-02-25
• [学会発表] 化学設計DNAによる核酸簡易解析の一例 (2008)
  • 著者名/発表者名: 岡本晃充
  • 学会等名: 先端生命コロキウム2008
  • 発表場所: 東京大学
  • 年月日: 2008-11-12
• [学会発表] Doubly Thiazole Orange-Labeled Nucleotide: Application to Hybridization-Sensitive DNA Probe (2008)
  • 著者名/発表者名: 岡本晃充
  • 学会等名: 2 008 Korea-Japan Symposium on Frontier Photoscience (KJFP 2008)
  • 発表場所: Ramada Hotel in Jeju Island, Korea
  • 年月日: 2008-09-26
• [学会発表] DNA-Osmium Complex for DNA Methylation Analysis (2008)
  • 著者名/発表者名: 岡本晃充
  • 学会等名: 3 1st National Medicinal Chemistry Symposium
  • 発表場所: University of Pittsburgh
  • 年月日: 2008-06-18
• [備考]
  • URL: http://www.riken.jp/lab-www/okamotoiru/indexj.htm