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本研究では、1)無顎類(メクラウナギ、ヤツメウナギ)に焦点を当てて、MHC(主要組織適合遺伝子複合体)パラロガス群の解析をおこなうことにより、2回のゲノム重複が系統発生のどの段階で起きたのかを実験的に推定するとともに、2)無顎類白血球cDNAライブラリーのEST解析によって同定されたvariable lymphocyte receptor遺伝子群について詳細な解析をおこない、以下の成果を得た。1. MHCアンカー遺伝子をコードするBACクローンをメクラウナギから単離し、BACクローンを用いたfluorescence in situ hybridizationをおこなった。その結果、メクラウナギ・ゲノムには少なくとも2個のMHCパラロガス領域が存在することを示唆する結果を得た。2.ヤツメウナギにはleucine rich repeatモジュールの再構成によって、著しい多様性を生み出す抗原レセプター遺伝子VLRが存在する。従来から知られていたVLRとは異なる新しいVLR遺伝子を同定し、このレセプターを特異的に認識するモノクロナル抗体を作製した。新規VLR遺伝子は、既知のVLR遺伝子のいずれとも異なるゲノム構造を有していること、VLR-B遺伝子の発現を誘導する抗原刺激を与えても、発現が誘導されないこと、などが明らかになった。3. ナメクジウオのドラフトゲノム配列を使用して、LLR moduleを有する遺伝子族の網羅的解析をおこなった。その結果、ナメクジウオゲノムにはVLRと類似した構造を有するintronless LRR-containing genesがきわめて多数存在することが明らかになった。
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