| 研究課題/領域番号 |
20017013
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| 研究機関 | 金沢大学 |
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研究代表者 |
西山 智明 金沢大学, 学際科学実験センター, 助教 (50390688)
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| 研究分担者 |
関本 弘之 日本女子大学, 理学部, 准教授 (20281652)
坂山 英俊 東京大学, 総合文化研究科, 助教 (60391108)
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| キーワード | シャジクモ藻類 / 世代交代 / ヒメミカヅキモ / シャジクモ / イヌカタヒバ / 完全長cDNA / EST |
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| 研究概要 |
陸上植物の2倍体多細胞体制進化について解明するため、陸上植物に近縁で単細胞性のシャジクモ藻類のヒメミカヅキモおよび、一倍体のみが多細胞体制をつくるシャジクモのゲノム解析を進めている。まず、発現している遺伝子をとらえるため、それぞれ生活環上異なるステージ5ステージ及び4ステージ設定し完全長cDNAライブラリーを作製しEST解析を進行させている。
ヒメミカヅキモNIES-66株及びNIES67株の栄養増殖ステージの完全長cDNAライブラリーを作製し1万9200クローンについて両端からのESTシークエンスを行った。これにより約3万5千配列のESTが得られた。この配列を以前からえられていたESTとともにアセンブルし6980個のcontigを得た。
シャジクモについては、2つのステージのRNAを抽出完了しcDNAライブラリー作製中である。
ヒメツリガネゴケ、イヌカタヒバの全ゲノムショットガンデータにもとづいて相同遺伝子推定と系統解析を行ってデータについてイヌカタヒバの全ゲノムアセンブリーと対応させ、ほぼ一致する推定ができていることを確認するとともに約1500のイヌカタヒバ遺伝子についてアノテーションを行った。
この解析で得られる情報は陸上植物の進化解明の他、有性生殖システムの解明や、シャジクモを利用した電気生理的解析、細胞運動の解明にも資する。
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