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2010 年度 研究成果報告書

細胞分化における遺伝子発現のゆらぎとその制御

研究課題

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研究課題/領域番号 20200006
研究種目

新学術領域研究(研究課題提案型)

配分区分補助金
研究分野 生体生命情報学
発生生物学
研究機関広島大学

研究代表者

山本 卓  広島大学, 大学院・理学研究科, 教授 (90244102)

研究分担者 鈴木 厚  広島大学, 大学院・理学研究科, 准教授 (20314726)
西川 正俊  理化学研究所, 発生再生科学総合研究センター, 研究員 (30444516)
連携研究者 鈴木 賢一  広島大学, 大学院・理学研究科, 助教 (90363043)
柴田 達夫  広島大学, 大学院・理学研究科, 准教授 (10359888)
研究期間 (年度) 2008 – 2010
キーワードゆらぎ / 細胞分化 / 発生・分化 / 遺伝子 / ゲノム
研究概要

細胞分化過程での遺伝子発現を定量的にとらえるために、人工酵素ジンクフィンガーヌクレーアーゼ(ZFN)を用いたレポーター遺伝子のゲノム標的遺伝子への挿入システムの確立を行った。この方法を用いて、ウニ胚一次間充織細胞の分化遺伝子であるHpEts遺伝子の発現レベルを、発生過程を通して1細胞レベルで定量化し、分化に伴って細胞間の発現のゆらぎが増大することを明らかにした。

  • 研究成果

    (59件)

すべて 2011 2010 2009 2008 2006 その他

すべて 雑誌論文 (15件) (うち査読あり 15件) 学会発表 (41件) 図書 (2件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Targeted mutagenesis in the sea urchin embryo using zinc-finger nucleases.2010

    • 著者名/発表者名
      Ochiai H, Fujita K, Suzuki K, Nishikawa M, Shibata T, Sakamoto N, Yamamoto T.
    • 雑誌名

      Genes to Cells 15(8)

      ページ: 875-885

    • 査読あり
  • [雑誌論文] HpSulf, a heparan sulfate 6-O-endosulfatase, is involved in the regulation of VEGF signaling during sea urchin development.2010

    • 著者名/発表者名
      Fujita K, Takechi E, Sakamoto N, Sumiyoshi N, Izumi S, Miyamoto T, Matsuura, S, Akasaka K, Yamamoto T.
    • 雑誌名

      Mechanisms of Development 127(3-4)

      ページ: 235-245

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mammalian arlysulfatase A functions as a novel component of the extracellular-matrix.2010

    • 著者名/発表者名
      Fujita K, Teramura N, Hattori S, Irie S, Mitsunaga-Nakatsubo K, Akimoto T, Sakamoto N, Yamamoto T, Akasaka K.
    • 雑誌名

      Connective Tissue Research 51(5)

      ページ: 388-396

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Implication of HpEts in gene regulatory networks responsible for specification of sea urchin skeletogenic primary mesenchyme cells.2010

    • 著者名/発表者名
      Yajima M, Umeda R, Fuchikami T, Kataoka M, Sakamoto N, Yamamoto T, Akasaka K.
    • 雑誌名

      Zoological Science 27(8)

      ページ: 638-646

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Dicer is required for the normal development of sea urchin, Hemicentrotus pulcherrimus.2010

    • 著者名/発表者名
      Okamitsu Y, Yamamoto T, Fujii, T., Ochiai, H.and Sakamoto, N.
    • 雑誌名

      Zoological Science 27(6)

      ページ: 477-486

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Nonadaptive fluctuation in an adaptive sensory system : bacterial chemoreceptor.2010

    • 著者名/発表者名
      Nishikawa M, Shibata T.
    • 雑誌名

      PLoS One 5(6)

      ページ: e11224

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Suppressor of Hairless (Su(H)) is required for foregut development in the sea urchin embryo.2009

    • 著者名/発表者名
      Karasawa K, Sakamoto N, Fujita K, Ochiai H, Fujii T, Akasaka K, Yamamoto T.
    • 雑誌名

      Zoological Science 26(10)

      ページ: 686-690

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Role of the nanos homolog during sea urchin development.2009

    • 著者名/発表者名
      Fujii T, Sakamoto N, Ochiai H, Fujita K, Okamitsu Y, Sumiyoshi N, Minokawa T, Yamamoto T.
    • 雑誌名

      Developmental Dynamics 238(10)

      ページ: 2511-2521

    • 査読あり
  • [雑誌論文] The Ars insulator facilitates I-SceI meganuclease-mediated transgenesis in the sea urchin embryo.2008

    • 著者名/発表者名
      Ochiai H, Sakamoto N, Suzuki K, Akasaka K, Yamamoto T.
    • 雑誌名

      Developmental Dynamics 237(9)

      ページ: 2475-2482

    • 査読あり
  • [雑誌論文] RSF Governs Silent Chromatin Formation via Histone H2Av Replacement.2008

    • 著者名/発表者名
      Hanai K, Furuhashi H, Yamamoto T, Akasaka K, Hirose S
    • 雑誌名

      PLoS genetics 4(2)

      ページ: e1000011

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Analysis of cis-regulatory elements controlling spatiotemporal expression of T-brain gene in sea urchin2008

    • 著者名/発表者名
      Ochiai H, Sakamoto N, Momiyama A, Akasaka K, Yamamoto T.
    • 雑誌名

      Hemicentrotus pulcherrimus.Mechanisms of Development 125(1-2)

      ページ: 2-17

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification and characterization of nucleoplasmin 3 as a histone-binding protein in embryonic stem cells.2008

    • 著者名/発表者名
      Motoi N, Suzuki K, Hirota R, Johnson P, Oofusa K, Kikuchi Y, Yoshizato K.
    • 雑誌名

      Development, Growth and Differentiation 50(5)

      ページ: 307-320

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Noise generation, amplification and propagation in chemotactic signaling systems of living cells.2008

    • 著者名/発表者名
      Shibata T, Ueda M.
    • 雑誌名

      BioSystems 93(1-2)

      ページ: 126-132

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mutual interaction in network motifs robustly sharpens gene expression in developmental processes2008

    • 著者名/発表者名
      Ishihara S, Shibata T.
    • 雑誌名

      Journal of Theoretical Biology 252(1)

      ページ: 131-144

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Fluctuation analysis of mechanochemical coupling depending on the type of biomolecular motors2008

    • 著者名/発表者名
      Nishikawa M, Takagi H, Shibata T, Iwane AH, Yanagida T.
    • 雑誌名

      Physical Review Letter 101(12)

      ページ: 128103

    • 査読あり
  • [学会発表] 人工酵素ZFNタンパク質の発現と機能解析2011

    • 著者名/発表者名
      日高大佑
    • 学会等名
      日本動物学会中国四国支部・広島県例会
    • 発表場所
      東広島
    • 年月日
      2011-03-05
  • [学会発表] 胚発生初期に背腹と頭尾のパターン形成が連動するしくみ2011

    • 著者名/発表者名
      竹林-鈴木公子
    • 学会等名
      日本動物学会中国四国支部・広島県例会
    • 発表場所
      東広島
    • 年月日
      2011-03-05
  • [学会発表] Targeted gene modification via viaon viaon vian viaation viaiaiaon viaaon viaahomologous end-joining-mediated and homology-directed repairs of ZFN-induced DNA double-stranded breaks2011

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto Takashi
    • 学会等名
      1st international symposium on Genome damage and Non -cancerous diseased
    • 発表場所
      Hiroshima.
    • 年月日
      2011-03-03
  • [学会発表] Targeted manipulation of genes with zinc finger nucleases in the cricket, Gryllus bimaculatus2010

    • 著者名/発表者名
      Watanabe Takahito
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2010-12-07
  • [学会発表] Genetic manipulation in sea urchin embryo using zinc-finger nucleases.2010

    • 著者名/発表者名
      Ochiai Hiroshi
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2010-12-07
  • [学会発表] A mechanism coordinating the establishment of the dorsal-ventral and anterior-posterior axes during early Xenopus embryogenesis2010

    • 著者名/発表者名
      Takebayashi-Suzuki Kimiko
    • 学会等名
      The 16th International Society of Differentiation Conference
    • 発表場所
      Nara
    • 年月日
      2010-11-15
  • [学会発表] バフンウニ初期発生におけるHpNanosmRNAの翻訳調節機構の解析2010

    • 著者名/発表者名
      吉田隆也
    • 学会等名
      第81回日本動物学会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2010-09-23
  • [学会発表] Self-organization of chemotactic signaling system for spontaneous motion of Eukaryotic cells.2010

    • 著者名/発表者名
      Takebayashi-Suzuki Kimiko
    • 学会等名
      13th International Xenopus Conference
    • 発表場所
      Calgary, Canada
    • 年月日
      2010-09-12
  • [学会発表] Targeted mutagenesis in the sea urchin embryo using zinc-finger nucleases2010

    • 著者名/発表者名
      Ochiai Hiroshi
    • 学会等名
      Society for Developmental Biologist 69th Annual meeting
    • 発表場所
      New Mexico, USA
    • 年月日
      2010-08-08
  • [学会発表] Targeted mutagenesis in the sea urchin embryo using zinc-finger nucleases2010

    • 著者名/発表者名
      落合博
    • 学会等名
      第43回日本発生生物学会
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2010-06-20
  • [学会発表] A mechanism coordinating the establishment of the dorsal-ventral and anterior-posterior axes during early Xenopus embryogenesis2010

    • 著者名/発表者名
      竹林-鈴木公子
    • 学会等名
      第43回日本発生生物学会
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2010-06-20
  • [学会発表] 適応反応のゆらぎと応答2010

    • 著者名/発表者名
      西川正俊
    • 学会等名
      理研シンポジウム「細胞システムの動態と論理II」
    • 発表場所
      埼玉
    • 年月日
      2010-04-08
  • [学会発表] 胚発生初期に背腹と頭尾のパターン形成が調和するしくみ2010

    • 著者名/発表者名
      竹林-鈴木公子
    • 学会等名
      日本動物学会中国四国支部・広島県例会
    • 発表場所
      東広島
    • 年月日
      2010-03-13
  • [学会発表] Mammalian arylsulfatase A as a novel component of the extracelluar matrix2009

    • 著者名/発表者名
      藤田和将
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2009-12-10
  • [学会発表] Cloning and analysis of Dnmt3 homolog of sea urchin (Hemicentrotus pulcherrimus)2009

    • 著者名/発表者名
      山下香
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2009-12-10
  • [学会発表] Cloning and analysis of Scc1 homolog of sea urchin, Hemicentrotus pulcherrimus (HpScc1)2009

    • 著者名/発表者名
      山口真央
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2009-12-10
  • [学会発表] Bacterial chemotaxis is enhanced by nonadaptive fluctuation in sensory system2009

    • 著者名/発表者名
      西川正俊
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島
    • 年月日
      2009-10-30
  • [学会発表] What determines the accuracy of bacterial chemotaxis?2009

    • 著者名/発表者名
      難波利典
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島
    • 年月日
      2009-10-30
  • [学会発表] XOct-25下流因子による BMP応答の制御と外胚葉のパターニング2009

    • 著者名/発表者名
      竹林-鈴木公子
    • 学会等名
      第3回日本ツメガエル研究集会
    • 発表場所
      広島
    • 年月日
      2009-10-06
  • [学会発表] Nonadaptive fluctuation in adaptive sensory system of bacterial chemotaxis2009

    • 著者名/発表者名
      Nishikawa Masatoshi
    • 学会等名
      International Symposium on Complex Systems Biology
    • 発表場所
      Tokyo
    • 年月日
      2009-09-29
  • [学会発表] バフンウニ胚におけるNanosの機能2009

    • 著者名/発表者名
      藤井孝吉
    • 学会等名
      第79回日本動物学会
    • 発表場所
      静岡
    • 年月日
      2009-09-19
  • [学会発表] バフンウニSulfは骨片形成におけるVEGFシグナルの調節に関与する2009

    • 著者名/発表者名
      藤田和将
    • 学会等名
      第79回日本動物学会
    • 発表場所
      静岡
    • 年月日
      2009-09-19
  • [学会発表] Stochastic signal transduction of bacterial chemotaxis2009

    • 著者名/発表者名
      柴田達夫
    • 学会等名
      第19回日本数理生物学会年会・企画シンポジウム
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2009-09-09
  • [学会発表] 多細胞生物の発生過程における遺伝子発現のゆらぎ2009

    • 著者名/発表者名
      山本卓
    • 学会等名
      数理生命科学の形成と発展
    • 発表場所
      東広島
    • 年月日
      2009-09-03
  • [学会発表] バクテリアの適応反応で生じるノイズと走化性2009

    • 著者名/発表者名
      西川正俊
    • 学会等名
      数理生命科学の形成と発展
    • 発表場所
      東広島
    • 年月日
      2009-09-03
  • [学会発表] Nonadaptive fluctuation in adaptive sensory system of bacterial chemotaxis2009

    • 著者名/発表者名
      西川正俊
    • 学会等名
      数理生命科学の形成と発展
    • 発表場所
      東広島
    • 年月日
      2009-09-03
  • [学会発表] BMP阻害とFGFシグナルの協調による後方神経形成機構2009

    • 著者名/発表者名
      竹林-鈴木公子
    • 学会等名
      第42回日本発生生物学会大会
    • 発表場所
      新潟
    • 年月日
      2009-05-30
  • [学会発表] Ars insulator facilitates the meganuclease-mediated transgenesis in the seaurchin embryo2009

    • 著者名/発表者名
      Ochiai Hiroshi
    • 学会等名
      41st Annual meeting for the Japanease society of developmental biologists
    • 発表場所
      Tokushima
    • 年月日
      2009-05-28
  • [学会発表] バクテリアの適応反応で生じるノイズと走化性2009

    • 著者名/発表者名
      西川正俊
    • 学会等名
      理研シンポジウム・細胞システムの動態と論理
    • 発表場所
      埼玉
    • 年月日
      2009-04-09
  • [学会発表] Relationship between the noise in adaptation reaction and the chemotactic performance in bacterium2009

    • 著者名/発表者名
      Nishikawa Masatoshi
    • 学会等名
      Gordon Research Conference on Gradient Sensing & Directed Cell Migration
    • 発表場所
      Galveston, Texas, USA
    • 年月日
      2009-04-02
  • [学会発表] 多細胞生物における細胞間の遺伝子発現のゆらぎ2009

    • 著者名/発表者名
      落合博
    • 学会等名
      定量生物学の会第1回年会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2009-01-10
  • [学会発表] 生物学にとっての理論、理論にとっての生命現象2009

    • 著者名/発表者名
      柴田達夫
    • 学会等名
      定量生物学の会第1回年会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2009-01-10
  • [学会発表] バクテリアの走化性とセンシングのノイズ2009

    • 著者名/発表者名
      西川正俊
    • 学会等名
      定量生物学の会第1回年会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2009-01-10
  • [学会発表] 細胞性粘菌の走化性シグナル伝達系における自己組織化現象の蛍光イメージ解析と理論的解析2008

    • 著者名/発表者名
      西川正俊
    • 学会等名
      数理生物学会年会
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2008-09-16
  • [学会発表] バフンウニ初期発生におけるDicerホモログの機能解析2008

    • 著者名/発表者名
      岡光憂佳
    • 学会等名
      第79回日本動物学会大会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2008-09-05
  • [学会発表] バフンウニVasa(HpVasa)遺伝子の発現と機能2008

    • 著者名/発表者名
      住吉範子
    • 学会等名
      第79回日本動物学会大会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2008-09-05
  • [学会発表] 走化性情報処理のゆらぎと協同性2008

    • 著者名/発表者名
      柴田達夫
    • 学会等名
      第60回日本細胞生物学会大会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2008-06-29
  • [学会発表] Identification and characterization of a novel candidate gene that regulates competence of ectodermal cells to BMP-mediated embryonic induction2008

    • 著者名/発表者名
      Miyamoto Tatsuo
    • 学会等名
      41st Annual meeting for the Japanease society of developmental biologists
    • 発表場所
      Tokushima
    • 年月日
      2008-05-28
  • [学会発表] Analysis of the mechanism underlying the localized function of HpNanos at archenteron tip2008

    • 著者名/発表者名
      Fujii Takayoshi
    • 学会等名
      41st Annual meeting for the Japanease society of developmental biologists
    • 発表場所
      Tokushima
    • 年月日
      2008-05-28
  • [学会発表] Analysis of cis-regulatory elements controlling spatio-temporal expression of T-brain gene of sea urchin2008

    • 著者名/発表者名
      Ochiai Hiroshi
    • 学会等名
      Hemicentrotus pulcherrimus, Developmental Biology of the sea urchin XVIII
    • 発表場所
      Woods Hole, MA, USA
    • 年月日
      2008-04-25
  • [学会発表] Self-organization in chemotactic signal transduction of eukaryoticcell2006

    • 著者名/発表者名
      Shibata Tatsuo
    • 学会等名
      International Workshop on Bio-Soft Matter
    • 発表場所
      Tokyo
    • 年月日
      2006-06-09
  • [図書] 骨形成タンパク質のシグナル伝達と形態形成における役割2011

    • 著者名/発表者名
      鈴木厚
    • 出版者
      オーム社 in press
  • [図書] Single Molecule Dynamics in Life Science2008

    • 著者名/発表者名
      Ueda Masahiro
    • 総ページ数
      346
    • 出版者
      WILEY-VCH Verelag GmbH & Co
  • [備考] ホームページ等

    • URL

      http://www.mls.sci.hiroshima-u.ac.jp/smg/index.html

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公開日: 2012-02-13   更新日: 2016-04-21  

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