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平成20年度に引き続き、中米の現代および古代先住民集団の遺伝的多様性の解明を目的として、メキシコ中央高原のテオティワカン遺跡、およびメキシコ中西部に位置する複数の古代アステカ、トルテカ、マヤ遺跡から出土した古人骨試料(総計80余体の骨片・歯牙)よりDNAを抽出後、PCR法によりミトコンドリアDループ領域のDNAを増幅し、その全塩基配列を決定した。これら古人骨試料については、DNAの質的な劣化が強く、また未知の夾雑物が混入している悪条件もあり、その分析には平成20年度と同様に困難を極め、予定していた分析期間を大幅に超えてしまったが、DNAの抽出精製方法やPCRの条件などを再検討することにより、約20個体のDNA型判定を行うことができた。さらに、メキシコ中西部の2つの現代先住民族併せて36個体から得られた生体試料(口腔粘膜等)よりDNAを抽出し、古人骨と同様にミトコンドリアDループ領域の塩基配列を決定した。それらの塩基配列データをもとにして、メキシコの古代および現代先住民について集団遺伝学的系統分析を行った。その結果、古代テオティワカン集団と現代メキシコ中西部の先住民族の個体の一部に、コーカソイドにその起源を有すると考えられており、新大陸では北米の先住民に数パーセントの頻度で見られるに過ぎないハプログループが僅かながら存在していることが明らかになった。これにより、古代テオティワカン民族とメキシコ中西部の現代先住民族が遺伝的に近縁であり、かつこれらの集団がコーカソイド由来の系統である可能性が示唆された。なお、このハプログループの中米地域における分布状況を解明するため、平成22年度にはメキシコ周辺国(グアテマラ、ホンジュラス)の古代マヤ遺跡出土古人骨および現代先住民族に分析対象を広げて試料収集を行い、研究を進めていく方針である。
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