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2012 年度 実績報告書

転写マシナリーと核内微細構造のダイナミックプロテオミクス

研究課題

研究課題/領域番号 20221010
研究機関東京大学

研究代表者

浜窪 隆雄  東京大学, 先端科学技術研究センター, 教授 (90198797)

研究分担者 岩成 宏子  東京大学, 先端科学技術研究センター, 特任助教 (20176556)
内藤 眞  新潟大学, 医歯学系, 教授 (30045786)
井原 茂男  東京大学, 先端科学技術研究センター, 特任教授 (30345136)
三好 元介  東京大学, 先端科学技術研究センター, 特任教授 (40345137)
川村 猛  東京大学, 先端科学技術研究センター, 特任助教 (70306835)
望月 康弘  東京大学, 先端科学技術研究センター, 特任准教授 (80282523)
研究期間 (年度) 2008-05-12 – 2013-03-31
キーワードプロテオミクス / 細胞周期 / スプライシング / 転写調節 / 核微細構造 / ヒストン修飾 / 生体イメージング / 軟X線顕微鏡
研究概要

作製した核内受容体LXRαの特異抗体を用いて,内在性タンパク質は主として核小体に分布すること,ターゲテドプロテオミクス解析やChip-Seq解析によりLXRαはホモ2量体として核小体に分布しリボゾーマルRNAの転写調節に関わること,細胞質内ではRXRαとのヘテロ2量体として脂質代謝の遺伝子調節に関与することを見出した。また,RNAプロセッシング調節をしていると考えられるWTAPに関して,タンパク質複合体(BCLAF1, THRAP3, CBLL1等)を同定し,これらの複合体構成タンパク質のRNAノックダウンにより細胞周期のG2/M集積がみられ,このうちBCLAF1/THRAP3はWTAPのnon-coding RNAとの相互作用による核スペックルへの移行に必要であること,WTAP複合体がヒストンメチル化酵素のオルタナティブスプライシングを調節することにより,ヒストンH4のメチル化を調節して細胞周期に関与している可能性を見出した(Gordon conference 発表)。また,開発したターゲテドプロテオミクス法を用いて、敗血症におけるPTX3(パターン認識自然免疫受容体)の複合体解析により,新規マーカーを発見し(MCP),自然免疫における新しい防御反応の可能性を提唱した(Frontiers in Immunology)。
ライブセルイメージング技術の開発に関して,Gタンパク質受容体を介したシグナル伝達を測定するFRETプローブを作製し、ケモタクシスの画像解析法を開発し方向探知機構におけるシグナルホットスポットの存在を見出した(平成24年度生化学会発表,論文投稿中)。MTMR6,9に対する抗体により複合体蛋白質を同定し,ライブセルイメージングと画像解析によりオートファジー機構との関連を見出した(JBC)。軟X線顕微鏡によるマウス肺胞の画像取得に成功した。

現在までの達成度 (区分)
理由

24年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • 研究成果

    (30件)

すべて 2013 2012 その他

すべて 雑誌論文 (11件) (うち査読あり 11件) 学会発表 (13件) 図書 (4件) 備考 (1件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] Novel role of copper transport protein antioxidant-1 in neointimal formation after vascular injury.2013

    • 著者名/発表者名
      Kohno T
    • 雑誌名

      Arterioscler Thromb Vasc Biol.

      巻: Apr; 33 (4) ページ: 805-813

    • DOI

      10.1161/ATVBAHA.112.300862.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Host-protective effect of circulating pentraxin 3 (PTX3) and complex formation with neutrophil extracellular traps.2013

    • 著者名/発表者名
      Daigo K
    • 雑誌名

      Front Immunol.

      巻: 3 ページ: 378

    • DOI

      10.3389/fimmu.2012.00378.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mutations for decreasing the immunogenicity and maintaining the function of core streptavidin.2012

    • 著者名/発表者名
      Yumura K
    • 雑誌名

      Protein Sci.

      巻: Feb;22(2) ページ: 213-221

    • DOI

      10.1002/pro.2203.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Phosphatidylinositol 3-phosphatase myotubularin-related protein 6 (MTMR6) is regulated by small GTPase Rab1B in the early secretory and autophagic pathways.2012

    • 著者名/発表者名
      Mochizuki Y
    • 雑誌名

      J Biol Chem.

      巻: Jan 11;288(2) ページ: 1009-1021

    • DOI

      10.1074/jbc.M112.395087.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Evaluation of the asparagine synthetase level in leukemia cells by monoclonal antibodies.2012

    • 著者名/発表者名
      Kusano-Arai O
    • 雑誌名

      ybridoma (Larchmt)

      巻: Oct;31(5) ページ: 325-332

    • DOI

      10.1089/hyb.2012.0014.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Inhibition of DNA damage-induced apoptosis through Cdc7-mediated stabilization of Tob.2012

    • 著者名/発表者名
      Suzuki T
    • 雑誌名

      J Biol Chem

      巻: Nov 23;287(48) ページ: 40256-40265

    • DOI

      10.1074/jbc.M112.353805.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Functional reconstitution of olfactory receptor complex on baculovirus.2012

    • 著者名/発表者名
      Mitsui K
    • 雑誌名

      Chem Senses.

      巻: Nov;37(9) ページ: 837-847

    • DOI

      10.1093/chemse/bjs067.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural and thermodynamic characterization of the self-adhesive properties of human P-cadherin.2012

    • 著者名/発表者名
      Kudo S
    • 雑誌名

      Mol Biosyst.

      巻: Aug;8(8) ページ: 2050-2053

    • DOI

      10.1039/c2mb25161b.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Dynamic change of chromatin conformation in response to hypoxia enhances the expression of GLUT3 (SLC2A3) by cooperative interaction of hypoxia-inducible factor 1 and KDM3A.2012

    • 著者名/発表者名
      Mimura I
    • 雑誌名

      Mol Cell Biol.

      巻: Aug;32(15) ページ: 3018-3032

    • DOI

      10.1128/MCB.06643-11.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Creation and biochemical analysis of a broad-specific claudin binder.2012

    • 著者名/発表者名
      Takahashi A
    • 雑誌名

      Biomaterials.

      巻: Apr;33(12) ページ: 3464-3474

    • DOI

      10.1016/j.biomaterials.2012.01.017.

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Membrane-bound form of monocyte chemoattractant protein-1 enhances antitumor effects of suicide gene therapy in a model of hepatocellular carcinoma.2012

    • 著者名/発表者名
      Marukawa Y
    • 雑誌名

      Cancer Gene Ther.

      巻: 19(5) ページ: 312-319

    • DOI

      10.1038/cgt.2012.3.

    • 査読あり
  • [学会発表] プレターゲティング法を用いた薬剤輸送のためのコアストレプトアビジン融合抗体2013

    • 著者名/発表者名
      湯村 恭平
    • 学会等名
      第93回日本化学会
    • 発表場所
      滋賀
    • 年月日
      20130322-20130325
  • [学会発表] 走化性におけるリガンド刺激依存的Gタンパク質活性変化と細胞膜伸長の解析2012

    • 著者名/発表者名
      増田 一之
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      20121211-20121214
  • [学会発表] 2つの転写因子が介在する相反するクロマチン立体構造は内皮細胞特異性維持に寄与している2012

    • 著者名/発表者名
      神吉 康晴
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      20121211-20121214
  • [学会発表] The WTAP complex is a novel RNA processing factor required for cell cycle progression.2012

    • 著者名/発表者名
      Keiko Horiuchi
    • 学会等名
      Gordon conference, The biology of post-transcriptional gene regulation .
    • 発表場所
      ロードアイランド(アメリカ)
    • 年月日
      20120715-20120720
  • [学会発表] ヒト核内受容体PPARαによる生体防御レクチンMBL2の発現制御機構の解析2012

    • 著者名/発表者名
      橘 敬祐
    • 学会等名
      第121回日本薬理学会近畿部会
    • 発表場所
      徳島
    • 年月日
      20120629-20120629
  • [学会発表] Proteomic analysis of circulating pentraxin3 (PTX3) complexes in sepsis revealed the PTX3-NETs complex formation: Implication of new protective roles against sepsis2012

    • 著者名/発表者名
      Kenji Daigo
    • 学会等名
      9th International Conference on Innate Immunity.
    • 発表場所
      ロードス島(ギリシャ)
    • 年月日
      20120623-20120628
  • [学会発表] 2種の異なるhomo‐dimerを形成するP‐cadherinの物性,構造,機能解析2012

    • 著者名/発表者名
      工藤 翔太
    • 学会等名
      第12回本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      20120620-20120622
  • [学会発表] 低免疫原性ストレプトアビジンを用いた融合抗体の構築2012

    • 著者名/発表者名
      湯村 恭平
    • 学会等名
      第12回本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      20120620-20120622
  • [学会発表] PTX3 in neutrophils and macrophages: localization and mechanisms of secretion2012

    • 著者名/発表者名
      Razvina Olga
    • 学会等名
      第52回日本リンパ網内系学会総会
    • 発表場所
      福島
    • 年月日
      20120612-20120614
  • [学会発表] Wilms’tumor1‐associating protein(WTAP)の肥満・糖代謝への関与の検討2012

    • 著者名/発表者名
      小林 正稔
    • 学会等名
      第55回日本糖尿病学会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      20120517-20120519
  • [学会発表] 核内受容体LXRαの核小体内への局在と機能の解析2012

    • 著者名/発表者名
      大橋 瑠子
    • 学会等名
      第101回日本病理学会総会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      20120426-20120428
  • [学会発表] 抗ヒトHNF4α抗体を用いた脊椎動物のHNF4αの検出2012

    • 著者名/発表者名
      姜 淑英
    • 学会等名
      第101回日本病理学会総会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      20120426-20120428
  • [学会発表] Localization of PTX3 in neutrophils and macrophages and it's secretion mechanisms2012

    • 著者名/発表者名
      Razvina Olga
    • 学会等名
      第101回日本病理学会総会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      20120426-20120428
  • [図書] 新機能抗体開発ハンドブック2012

    • 著者名/発表者名
      浜窪 隆雄(監修)
    • 総ページ数
      603
    • 出版者
      エヌ・ティー・エス
  • [図書] 抗体医薬品の開発と市場2012

    • 著者名/発表者名
      浜窪 隆雄
    • 総ページ数
      239
    • 出版者
      シーエムシー出版
  • [図書] 次世代医薬開発に向けた抗体工学の最前線2012

    • 著者名/発表者名
      浜窪 隆雄
    • 総ページ数
      283
    • 出版者
      シーエムシー出版
  • [図書] 皮膚科臨床アセット14 肉芽腫性皮膚疾患、(古江増隆 編)2012

    • 著者名/発表者名
      内藤 眞
    • 総ページ数
      345
    • 出版者
      中山書店
  • [備考] 計量生物医学

    • URL

      http://www.qbm.rcast.u-tokyo.ac.jp/

  • [産業財産権] 全身性炎症反応症候群の治療又は予防剤2012

    • 発明者名
      浜窪 隆雄 他6名
    • 権利者名
      浜窪 隆雄 他6名
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      特願2012-141380
    • 出願年月日
      2012-06-22

URL: 

公開日: 2014-07-24  

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