High throughput sequencerによる癌のエピゲノーム解析

2010 年度 自己評価報告書

• 研究課題/領域番号: 20229005
• 研究種目: 基盤研究(S)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 病態医化学
• 研究機関: 独立行政法人理化学研究所
• 研究代表者: 西川 伸一 独立行政法人理化学研究所, 幹細胞研究グループ, グループディレクター (60127115)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2012
• キーワード: MDS / メチローム / ゲノムワイド / メチル化阻害剤

研究概要

基礎・臨床が協力して骨髄異形成症候群(MDS)および悪性黒色腫のメチル化DNA部位を全ゲノムレベル(メチローム)で解析し、MDS発生過程でメチル化によりサイレンシングされ、また治療により脱メチル化される遺伝子をリストし、治療の困難なMDSの発症過程を明らかにする。現在、ヒトMDS細胞株を用いたモデル治療実験の解析が終わり、選択的に脱メチル化される120種類の遺伝子のリストを作成したところである。今後、脱メチル化剤が著効を示した患者さんのMDS細胞に対象を広げてメチローム解析を行い、MDS発症にかかわる分子を明らかにする。

研究成果

• [雑誌論文] Adult stem cells exhibit global suppression of RNA polymeraseII serine-2 phosphorylation. (2010)
  • 著者名/発表者名: Freter R, Osawa M, Nishikawa S.
  • 雑誌名: Stem Cells 28 ページ: 1571-1580
  • 査読あり
• [雑誌論文] Intrinsic transition of embryonic stem-cell differentiation into neural progenitors. (2010)
  • 著者名/発表者名: Kamiya D, Banno S, Sasai N, Ohgushi M, Inomata H, Watanabe K, Kawada M, Yakura R, Kiyonari H, Nakao K, Jakt LM, Nishikawa S, Sasai Y.
  • 雑誌名: Nature 470 ページ: 503-509
  • 査読あり
• [雑誌論文] Transient expression of ephrin b2 in perinatal skin is required for maintenance of keratinocyte homeostasis. (2009)
  • 著者名/発表者名: Egawa G, Osawa M, Uemura A, Miyachi Y, Nishikawa S.
  • 雑誌名: J Invest Dermatol 129 ページ: 2386-2395
  • 査読あり
• [雑誌論文] Continuous single-cell imaging of blood generation from haemogenic endothelium. (2009)
  • 著者名/発表者名: Eilken HM, Nishikawa S, Schroeder T.
  • 雑誌名: Nature 457 ページ: 896-900
  • 査読あり
• [雑誌論文] The novel protein kinase Vlk is essential for stromal function of mesenchymal cells. (2009)
  • 著者名/発表者名: Kinoshita M, Era T, Jakt LM, Nishikawa S.
  • 雑誌名: Development 136 ページ: 2069-2079
  • 査読あり
• [学会発表] Development of hematopoietic stem cell explained (2010)
  • 著者名/発表者名: Shinichi Nishikawa
  • 学会等名: Nobel Symposium
  • 発表場所: Stockholm
  • 年月日: 2010-04-14
• [学会発表] Development of ematopoietic stem cells in vitro and in vivo (2010)
  • 著者名/発表者名: Shinichi Nishikawa
  • 学会等名: Keystone Symposium
  • 発表場所: Keystone
  • 年月日: 2010-02-18
• [学会発表] CSH Laboratory meeting (2009)
  • 著者名/発表者名: Shinichi Nishikawa
  • 学会等名: Control and Regulation of Stem Cells
  • 発表場所: New York
  • 年月日: 20090922-20090926
• [学会発表] The pathway of hematopoietic stem cell development explained (2009)
  • 著者名/発表者名: Shinichi Nishikawa
  • 学会等名: Annual Congress of the European Society of Gene and Cell Therapy(ESGCT)
  • 発表場所: Hannover
  • 年月日: 2009-11-21
• [学会発表] Constructing hematopoietic stem cells, Embo Conference, Advances in Stem Cell Research (2009)
  • 著者名/発表者名: Shinichi Nishikawa
  • 学会等名: Stem Cells meet Systems and Synthetic Biology
  • 発表場所: Cambridge
  • 年月日: 2009-06-17
• [図書] 西川伸一監訳, 幹細胞WARS (2009)
  • 著者名/発表者名: シンシアフォックス著
  • 総ページ数: 662
  • 出版者: 一灯社
• [備考] 2011 年度国際色素細胞学会Myron Gordon 賞ZA Malek,R. Halaban と共同受賞