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2008 年度 実績報告書

サクラソウの適応的遺伝子に関するエコゲノム研究

研究課題

研究課題/領域番号 20241055
研究機関筑波大学

研究代表者

大澤 良  筑波大学, 大学院・生命環境科学研究科, 准教授 (80211788)

研究分担者 津村 義彦  独立行政法人森林総合研究所, 森林遺伝研究領域, 室長 (20353774)
鷲谷 いづみ  東京大学, 農学生命科学研究科, 教授 (40191738)
キーワードサクラソウ / 適応的遺伝子 / ESTマーカー / QTL解析 / 遺伝子連鎖地図
研究概要

野生サクラソウを対象として,QT正解析および発現遺伝子情報であるEST情報に基づくマーカーによるゲノムワイドな探索によってサクラソウの持つ適応的遺伝子を同定することを目的としてESTマーカーおよびSSRマーカーの開発,連鎖地図作製,それらに基づく量的形質遺伝子解析による適応的遺伝子の同定ならびに各地での個体群構造の把握を行った。サクラソウの多様性評価の指標とされてきた花弁形状と花弁面積の集団内。問の遺伝的変異を同一圃場実験によって評価し,DNAマーカーによる集団問分化程度と比較したところ,花弁の切れ込みと最大幅と面積は有意な集団間差が認められたものの,花弁形質の遺伝的変異は主に集団内に維持されていた。さらに花弁形質は自然選択に中立な形質であり,花弁形状変異の大部分を占める切れ込みと最大幅,長幅比に加え花弁面積が集団内の遺伝的多様性の目視評価の指標となりうることが示された。開発したSSRマーカーおよびESTマーカーにより北海道由来個体と長野由来個体の分離家系を用いて連鎖地図を作成し,128座,14個の連鎖群からなる連鎖地図が作成できた。サクラソウは2n=24であるため今後さらに地図を充実させる必要がある。同一家系による適応関連形質のQTL解析を行い,出芽日,開花まで日数,花型および異型花柱性に関わるQTL座を検出した。また,サクラソウ個体群の空間構造が種子生産に与える影響を調査した。

  • 研究成果

    (14件)

すべて 2009 2008 その他

すべて 雑誌論文 (9件) (うち査読あり 9件) 学会発表 (3件) 図書 (1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Tracing the origins of stocks of the endangered species Primula sieboldii using nuclear microsatellites and chloroplast DNA.2009

    • 著者名/発表者名
      Honjo, M, Ueno,S., Tsumura, Y., Handa, T., Washitani, I., and Ohsawa, R.
    • 雑誌名

      Conservation Genetics 9

      ページ: 1139-1l47

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Ecological responses of Primula. nutans to centimeter-scale tonoffranhic and environmental variability in an aloine wetland.2009

    • 著者名/発表者名
      Shen, H., Tang, Y. and Washitani, I
    • 雑誌名

      Ecological Research 24

      ページ: 75-81

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genetic variation and differentiation of floral morphology in wild Primula sieboldii evaluated by image analysis data and SSR markers2008

    • 著者名/発表者名
      Yoshida, Y., M. Honjo, N. Kitamoto and R. Ohsawa
    • 雑誌名

      Breeding Science 58

      ページ: 301-307

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effect of population density of compatible neighbors on inbreeding level within a Primula sieboldii population2008

    • 著者名/発表者名
      Kitamoto, N., Ueno, S., Tsumura, Y., Washitani, I, Ohsawa, R.
    • 雑誌名

      Ecoloeical Research 23

      ページ: 307-315

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Towards a legal framework for systematic conservation: identification and development of allele-specific PCR markers for conspecific varieties of an endangered perennial herb Primula kisoana Miauel based on sequence variation of chloroplast DNA.2008

    • 著者名/発表者名
      Ohtani, M., Terauchi, H., Nishihiro, J., Ueno, S., Tsumura, Y., and Washitani, I.
    • 雑誌名

      Conservation Genetics 9

      ページ: 1173-1181

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Characteristics of leaf photosynthesis and simulated individual carbon budget in Primula nutans under contrasting light and temnerature conditions.2008

    • 著者名/発表者名
      Shen, H., Tang, Y., Muraoka, H. and Washitani, I.
    • 雑誌名

      Journal of Plant Research 121

      ページ: 191-200

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Development of 120 microsatellite markers for Primula sieboldii E. Morren for linkage mapping

    • 著者名/発表者名
      Ueno, S., Yoshida, Y., Taguchi, Y., Honjo, M., Kitamoto, N., Washitani, I., Ohsawa, R. and Tsumura, Y.
    • 雑誌名

      Conservation Genetics (In press)

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 群馬県鳴神山における絶滅危惧植物カッコソウの個体群再生に向けた取り組みとそれにより明らかになった種特性及び生育環境

    • 著者名/発表者名
      大谷雅人,西廣淳,寺内浩,寺内優美子,鷲谷いつみ
    • 雑誌名

      保全生態学研究 (印刷中)

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Management units of the endangered herb Primula sieboldii based on microsatellite variation among and within populations throughout Japan

    • 著者名/発表者名
      Honjo, M., Kitamoto, N., Ueno, S., Tsumura, Y., Was.hitani, I. and Ohsawa, R
    • 雑誌名

      Conservation Genetics (In press)

    • 査読あり
  • [学会発表] 適応に関連したQTLに基づく野生サクラソウ集団の遺伝的多様性評価2009

    • 著者名/発表者名
      吉田康子, 上野真義, 北本尚子, 小玉昌孝, 本城正憲, 田口由利子, 永井美穂子, 鷲谷いづみ, 津村義彦, 大澤良
    • 学会等名
      日本生態学会第56回大会
    • 発表場所
      岩手県立大学
    • 年月日
      2009-03-19
  • [学会発表] サクラソウの受粉から結実までに働く近交弱勢の関与遺伝子座数とその効果の解析2009

    • 著者名/発表者名
      北本尚子, 本城正憲, 吉田康子, 上野真義, 津村義彦, 鷲谷いづみ, 大澤良
    • 学会等名
      日本生態学会第56回大会
    • 発表場所
      岩手県立大学
    • 年月日
      2009-03-19
  • [学会発表] サクラソウの個体群構造と種子生産の空間的不均一性2009

    • 著者名/発表者名
      田中良典, 鷲谷いづみ
    • 学会等名
      日本生態学会第56回大会
    • 発表場所
      岩手県立大学
    • 年月日
      2009-03-19
  • [図書] サクラソウのひみつ2008

    • 著者名/発表者名
      幸田シャーミン(作),大島節子(絵),鷲谷いつみ(監修)
    • 出版者
      社団法人ユネスコ協会連盟(印刷中)
  • [備考]

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公開日: 2010-06-11   更新日: 2016-04-21  

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