| 研究課題/領域番号 |
20360373
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| 研究機関 | 大阪大学 |
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研究代表者 |
大政 健史 大阪大学, 大学院・工学研究科, 准教授 (00252586)
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| 研究分担者 |
大竹 久夫 大阪大学, 大学院・工学研究科, 教授 (10127483)
本田 孝祐 大阪大学, 大学院・工学研究科, 助教 (90403162)
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| キーワード | gene amplification / BAC library / Chinese hamster ovary cell / chromosome |
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| 研究概要 |
バイオ医薬品生産に多用されているCHO細胞であるが、細胞自身については殆ど解明されていない。現在、CHOに関してはゲノムプロジェクトを初めとして、しかしこれまでCHO細胞ゲノムそのものを解明利用したり、染色体増幅領域との関係解明を本格的に行った例は無い。そこで、本研究では、これまでに構築したCHO細胞の全ゲノム領域を含む「CHO細胞BACライブラリー」を用いてCHO細胞の染色体の分類マーカーを構築する。さらに、構築した分類マーカーと配列情報に基づくゲノム上の遺伝子存在位置情報からCHO細胞の細胞株構築過程における染色体再構築について解析することを目的とする。(1)BAC-FISH法を用いた染色体分類マーカーの構築 これまでの研究でCHO細胞の全ゲノムをカバーするBACライブラリーを構築した。これを用いて、BAC-FISHを行い、染色体を分類可能なBACクローンをスクリーニングし、染色体分類マーカーを構築した。(2)BAC-ENDシークエンスに基づいたCHO細胞ゲノムgene ontology: BACライブラリーは構築に用いたベクターが全て同じものであり、挿入されたBAC断片の両端の配列情報(END情報)については比較的簡単に決定することができる。本サブテーマでは、BAC-FISHマーカー作成に用いたBACクローンのENDシークエンスを解析した。(3)染色体マーカーを用いた染色体再配列解析システム開発:本研究の最終目的である細胞構築過程におけるCHO細胞の染色体安定性や再配列を解析するためには、上記(1)で構築したBAC-FISHマーカーを用いて、親株であるCHO-DG44細胞株の染色体分類解析を行うための画像データ抽出法を構築した。
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