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2010 年度 実績報告書

種内表現型多型のスケールアップ効果:湖沼生態系に与える影響の実験的検証

研究課題

研究課題/領域番号 20370009
研究機関京都大学

研究代表者

奥田 昇  京都大学, 生態学研究センター, 准教授 (30380281)

研究分担者 陀安 一郎  京都大学, 生態学研究センター, 准教授 (80353449)
吉田 丈人  東京大学, 総合文化研究科, 准教授 (40447321)
小北 智之  福井県立大学, 海洋生物資源学部, 講師 (60372835)
近藤 倫生  龍谷大学, 理工学部, 准教授 (30388160)
キーワード湖沼適応 / トランスクリプトーム / 次世代シークエンサー / 遺伝的変異 / 表現型可塑性 / 捕食者-被食者体サイズ比 / 生態系メタボリズム / 適応的食物網
研究概要

1)魚類栄養多型の遺伝的基盤解明
魚類における湖沼適応形質の遺伝的基盤を解明するために、沖合環境への生理適応に関連した遺伝子群の探索を比較トランストクリプトーム解析によって試みた。非モデル生物に適用可能なHiCEP法を用いて遺伝子発現プロファイリングを実施したところ、コイ科魚類の沖合型-底生型ペア種において発現量の異なる遺伝子の幾つかは、サケ科ペア種で報告された発現差異と同じパターンを示した。湖沼適応に関連した遺伝子発現の収斂進化の可能性が示唆された。
2)魚類栄養多型の生態系影響の実験的解析
湖沼メソコスムで魚類の栄養多型を操作することによって、プランクトン群集の構造や生態系機能に及ぼす影響を実験的に検証した。魚類の摂餌型によって、プランクトン群集のサイズ構造、被食者-捕食者体サイズ比、群集平均栄養段階、群集代謝が変異することを実証した。また、栄養型の多様性が相乗効果をもたらすことも明らかにした。
3)藻類被食防衛形質可塑性の実験的解析
餌生物の被食防衛形質の表現型可塑性が個体群動態に与える影響を調べることを目的として、イカダモとワムシからなる被食-捕食系を用いた長期培養実験を実施した。昨年までの実験よって単離された異なる表現型可塑性をもつイカダモ株を利用し、可塑性の違いが被食-捕食動態に及ぼす効果を調べた。予備的な結果として、従来報告されていた群体形成だけでなく、細胞集塊の形成という新しい防衛形態があることを明らかにした。
4)適応的食物網の理論的解析
食物網はネスト構造を持つサブウェブの集合である。この構造が生物の適応進化によって生じた可能性について理論的解析を行った。生物の適応的餌選択と個体群動態の関連性を調べるために個体ベースモデルを作成し、多型の維持が食物網の構造と動態に強い影響を及ぼす可能性を示した。さらに、摂餌機能群内部の多様性が生態系機能に及ぼす安定化効果について、植物-分解者系を例に新しい理論を提示した。

  • 研究成果

    (37件)

すべて 2011 2010

すべて 雑誌論文 (9件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (26件) 図書 (2件)

  • [雑誌論文] Physical structure of habitat network differently affects migration patterns of native and invasive fishes in Lake Biwa and its tributary lagoons : Stable isotope approach2011

    • 著者名/発表者名
      Shibata, J., Z.Karube, M.Oishi, M.Yamaguchi, Y.Goda, N.Okuda
    • 雑誌名

      Population Ecology

      巻: 53 ページ: 143-153

    • DOI

      10.1007/s10144-010-0213-x

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 生命のるつぼ「琵琶湖」:生物標本はタイムマシーン2011

    • 著者名/発表者名
      奥田昇
    • 雑誌名

      生き物たちのつづれ織り

      巻: 4 ページ: 179-180

  • [雑誌論文] タモロコ属魚類の栄養多型はプランクトン群集の栄養構造を変える!2011

    • 著者名/発表者名
      酒井陽一郎
    • 雑誌名

      生態学会関東地区会会報

      巻: 59 ページ: 26-29

  • [雑誌論文] Food webs are built up with nested subwebs2010

    • 著者名/発表者名
      M.Kondoh, S.Kato, Y.Sakato
    • 雑誌名

      Ecology

      巻: 91 ページ: 3123-3130

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effects of evolutionary changes in prey use on the relationship between food web complexity and stability2010

    • 著者名/発表者名
      W.Yamaguchi, M.Kondoh, M.Kawata
    • 雑誌名

      Population Ecology

      巻: 53 ページ: 59-72

  • [雑誌論文] Fumctional diversity of microbial decomposers facilitates plant coexistence in a plant-microbe-soil feedback model2010

    • 著者名/発表者名
      T.Miki, M.Ushio, S.Fukui, M.Kondoh
    • 雑誌名

      PNAS

      巻: 107 ページ: 14251-14256

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Carbon and nitrogen stable isotope ratios of macroinvertebrates in the littoral zone of Lake Biwa as indicators of anthropogenic activities in the watershed2010

    • 著者名/発表者名
      Karube, Z., Y.Sakai, T.Takeyama, N.Okuda, A.Kohzu, C.Yoshimizu, T.Nagata, I.Tayasu
    • 雑誌名

      Ecological Research

      巻: 25 ページ: 847-855

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 自然集団の適応的分化の検出~モデル系としての日本在来魚~2010

    • 著者名/発表者名
      小北智之・山平寿智
    • 雑誌名

      月刊海洋

      巻: 42 ページ: 317-322

  • [雑誌論文] 生命のるつぼ「琵琶湖」:琵琶湖を汚したのは誰?2010

    • 著者名/発表者名
      奥田昇
    • 雑誌名

      生き物たちのつづれ織り

      巻: 3 ページ: 61-62

  • [学会発表] 高次階層システムとしての生態系メタボリズムを駆動するメカニズムは何?サイズスケーリングvsストイキオメトリー2011

    • 著者名/発表者名
      福森香代子・酒井陽一郎・西松聖乃・陀安一郎・近藤倫生・奥田昇
    • 学会等名
      日本生態学会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2011-03-12
  • [学会発表] メタ群集における捕食-被食食物網の安定性に与える共進化と移動分散の効果2011

    • 著者名/発表者名
      山口和香子・大野ゆかり・近藤倫生・河田雅圭
    • 学会等名
      日本生態学会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2011-03-11
  • [学会発表] タモロコ属魚類の湖沼適応にかかわる遊泳関連形質の遺伝的分化2011

    • 著者名/発表者名
      柿岡諒・小北智之・熊田裕喜・渡辺勝敏・瀬戸雅文-奥田昇
    • 学会等名
      日本生態学会第58回大会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2011-03-10
  • [学会発表] 異なる可塑的防衛が捕食者・被食者系の個体群動態へ与える影響:ケモスタットを用いた実証実験2011

    • 著者名/発表者名
      桜澤孝佑・李恒・吉田丈人
    • 学会等名
      日本生態学会第58回大会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2011-03-10
  • [学会発表] 栄養モジュール動態の生息地特性への応答2011

    • 著者名/発表者名
      梅田隆利・近藤倫生
    • 学会等名
      日本生態学会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2011-03-10
  • [学会発表] 捕食者の摂餌機能多様性は水域生態系の構造を変える!2011

    • 著者名/発表者名
      酒井陽一郎・福森香代子・西松聖乃・陀安一郎・奥田昇
    • 学会等名
      日本生態学会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2011-03-10
  • [学会発表] 湖沼適応と関連した網羅的遺伝子発現パターンの変化:タモロコ属魚類の場合2011

    • 著者名/発表者名
      小北智之・熊田裕喜・柿岡諒・奥田昇
    • 学会等名
      日本生態学会第58回大会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2011-03-09
  • [学会発表] 陸域相利系における発見が水域群集に適用されるとき:群集ネスト構造をめぐる発見と迷走2011

    • 著者名/発表者名
      近藤倫生
    • 学会等名
      日本生態学会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2011-03-09
  • [学会発表] 文献調査に基づく60年代琵琶湖食物網の構築2011

    • 著者名/発表者名
      高嶋あやか・近藤倫生
    • 学会等名
      日本生態学会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2011-03-09
  • [学会発表] Feeding functional diversity in top predatory fish affects plankton trophic structure2010

    • 著者名/発表者名
      Sakai, Y., K.Fukumori, K.Nishimatsu, N.Okuda
    • 学会等名
      The 4th International Symposium of the Biodiversity and Evolution Global COE project
    • 発表場所
      Kyoto
    • 年月日
      20100911-20100912
  • [学会発表] Phenotypic adaptation toward the use of the limnetic niche in Gnathopogon fishes2010

    • 著者名/発表者名
      Kakioka, R., T.Kokita, H.Kumada, K.Watanabe, M.Seto, N.Okuda
    • 学会等名
      The 4th International Symposium of the Biodiversity and Evolution Global COE project
    • 発表場所
      Kyoto
    • 年月日
      20100911-20100912
  • [学会発表] Heterogeneous use of resources by benthic assemblages in a reach of tropical mountain stream2010

    • 著者名/発表者名
      Uno H., Y.Takemon, K.Kitayama, N.Okuda
    • 学会等名
      The 95th ESA Annual Meeting
    • 発表場所
      Pittsburgh
    • 年月日
      20100802-20100805
  • [学会発表] Ecosystem metabolism is driven by ecological stoichiometry but not by size scaling in experimental lake mesocosms2010

    • 著者名/発表者名
      Fukumori, K., Y.Sakai, K.Nishimatsu, I.Tayasu, N.Okuda
    • 学会等名
      Metabolic Basis Of Ecology And Evolution in Gordon Research Conferences
    • 発表場所
      Biddeford, ME
    • 年月日
      20100719-20100722
  • [学会発表] Linking the community structure to ecosystem properties via food-web unfolding2010

    • 著者名/発表者名
      M.Kondoh
    • 学会等名
      International Symposium in Isotope Ecology 2010 in Kyoto
    • 発表場所
      Kyoto
    • 年月日
      2010-11-02
  • [学会発表] Biological specimens tell us a centurial history of food web alterations in the ancient lake", November 2010, Kyoto2010

    • 著者名/発表者名
      Okuda, N., T.Komiya, Y.Katoh, Y.Okuzaki, M.Hori, I.Tayasu, T.Nagata
    • 学会等名
      International Symposium on Isotope Ecology 2010
    • 発表場所
      Kyoto
    • 年月日
      2010-11-02
  • [学会発表] Is the relationship between body size and trophic niche position time-invariant in a predatory fish? First stable isotope evidence2010

    • 著者名/発表者名
      Nakazawa, T., Y.Sakai, C.-H.Hsieh, T.Koitabashi, I.Tayasu, N.Yamamura, N.Okuda
    • 学会等名
      International Symposium on Isotope Ecology 2010
    • 発表場所
      Kyoto
    • 年月日
      2010-11-02
  • [学会発表] Predator feeding functional diversity alters plankton trophic structure2010

    • 著者名/発表者名
      Sakai Y., K.Fukumori, K.Nishimatsu, I.Tayasu, N.Okuda
    • 学会等名
      International Symposium on Isotope Ecology 2010
    • 発表場所
      Kyoto
    • 年月日
      2010-11-02
  • [学会発表] Heterogeneous resource use by benthic assemblages in a tropical mountain stream : approach from habitat scale SI data2010

    • 著者名/発表者名
      Uno, H., Y.Takemon, K.Kitayama, N.Okuda
    • 学会等名
      International Symposium on Isotope Ecology 2010
    • 発表場所
      Kyoto
    • 年月日
      2010-11-02
  • [学会発表] Seasonal dynamics of a coastal food web : Stable isotope analysis of a higher consumer2010

    • 著者名/発表者名
      Hamaoka, H., N.Okuda, T.Fukumoto, H.Miyasaka, K.Omori
    • 学会等名
      International Symposium on Isotope Ecology 2010
    • 発表場所
      Kyoto
    • 年月日
      2010-11-02
  • [学会発表] "琵琶湖"適応遺伝子の探索:タモロコ属ペア種を用いた比較トランスクリプトーム解析2010

    • 著者名/発表者名
      小北智之・熊田裕喜・奥田昇
    • 学会等名
      2010年度日本魚類学会年会
    • 発表場所
      津
    • 年月日
      2010-09-24
  • [学会発表] 日本産タモロコ属魚類の遺伝的分化と集団構造2010

    • 著者名/発表者名
      柿岡諒・小北智之・森誠一・渡辺勝敏
    • 学会等名
      2010年度日本魚類学会年会
    • 発表場所
      津
    • 年月日
      2010-09-24
  • [学会発表] 食物網構造から適応の痕跡を読み取る2010

    • 著者名/発表者名
      近藤倫生
    • 学会等名
      個体群生態学会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2010-09-22
  • [学会発表] Food web analysis of recently constructed Fei-Tsui Reservoir, Taiwan : a comparison with the ancient Lake Biwa2010

    • 著者名/発表者名
      Okuda N., Y.Sakai, K.Fukumori, S.Yang, C.-H.Hsieh, F.-K.Shiah
    • 学会等名
      第75回日本陸水学会
    • 発表場所
      弘前
    • 年月日
      2010-09-18
  • [学会発表] 魚類の栄養多型がもたらすプランクトン群集の変化:栄養構造とストイキオメトリー2010

    • 著者名/発表者名
      酒井陽一郎・福森香代子・西松聖乃・陀安一郎・奥田昇
    • 学会等名
      第75回日本陸水学会
    • 発表場所
      弘前
    • 年月日
      2010-09-18
  • [学会発表] A consideration of the scale at which food-web structure constrains population dynamics2010

    • 著者名/発表者名
      M.Kondoh
    • 学会等名
      British Ecological Society Annual Meeting 2010
    • 発表場所
      英国Leeds
    • 年月日
      2010-09-07
  • [学会発表] Complex global warming effects on a lacustrine fish coupling between pelagic, profundal and littoral habitats2010

    • 著者名/発表者名
      Okuda, N., Y.Sakai, M.Kumagai
    • 学会等名
      The American Society of Limnology and Oceanography/North American Benthological Society Summer Meeting
    • 発表場所
      Santa Fe
    • 年月日
      2010-06-09
  • [図書] Seasonal dynamics of a coastal food web : Stable isotope analysis of a higher consumer. In : Earth, Life, and Isotopes.2010

    • 著者名/発表者名
      Hamaoka, H., N.Okuda, T.Fukumoto, H.Miyasaka, K.Omori
    • 総ページ数
      415
    • 出版者
      Kyoto University Press
  • [図書] 安定同位体分析.In:魚類生態学の基礎.2010

    • 著者名/発表者名
      奥田昇
    • 総ページ数
      317
    • 出版者
      恒星社厚生閣

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公開日: 2012-07-19  

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