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2011 年度 実績報告書

種内表現型多型のスケールアップ効果:湖沼生態系に与える影響の実験的検証

研究課題

研究課題/領域番号 20370009
研究機関京都大学

研究代表者

奥田 昇  京都大学, 生態学研究センター, 准教授 (30380281)

研究分担者 陀安 一郎  京都大学, 生態学研究センター, 准教授 (80353449)
吉田 丈人  東京大学, 総合文化研究科, 准教授 (40447321)
小北 智之  福井県立大学, 海洋生物資源学部, 講師 (60372835)
近藤 倫生  龍谷大学, 理工学部, 准教授 (30388160)
キーワードメソコスム / 次世代シークエンサー / 表現型可塑性 / 被食者 捕食者 / 適応的食物網
研究概要

水界生態系の一次生産者および高次捕食者にみられる表現型多型・可塑性が食物網構造や動態に与える影響を実験的に解析し、適応的食物網に関する理論を構築することを目的として、以下の4つの課題を実施した。
1)魚類栄養多型の遺伝的基盤解明
魚類における湖沼適応形質の遺伝的基盤を解明するために、タモロコ属魚類のF2交配家系を用いた連鎖地図の作成および湖沼適応に開連した形態のQTL解析をけった。次世代シークエンサーを利用したRADシークエンシングを行い、多数のSNPマーカーを作成した。得られたマーカーを用い、高密度連鎖地図を作成した。さらにQTL解析を行ったところ、湖沼型-河川型ペア種間における採餌関連形質や体型の違いの多くは、効果の小さい複数の遺伝子座に支配されることが示唆された。
2)魚類栄養多型の生態系影響の実験的解析
魚類の栄養多型がプランクトン食物網に及ぼす影響を実験的に解析したところ、ベントス食魚の存在によって食物連鎖長け有意に長くなる一方、バイオマスで重みづけされた平均栄養段階は有意に短くなるという結果が得られた。前者はサンプリンブエラーのArtifactを含みうるが、後者は栄養関係を介したシステム全体のエネルギー流を記述する指標として有効であり、魚類の栄養多型効果が食物網全体にトップダウン的に波及することが実証された。
3)餌藻類の可塑性がワムシ捕食費-餌藻類系の個体群動態に与える影響
前年までの実験により、藻類のイカダキが捕食者から放出されるカイロモンに反応して、捕食されにくい形態である群体を可塑的に形成することがわかった。しかし、イカダモの群体形成における可塑性はクローンによってさまざまであり、表現型可塑性が個体群動態に与える影響を実験的に調べる当初の目的は達成困難であることがわかった。そのため、数理モデルを用いた理論的解析を実施し、表現型可塑性が個体群動態を安定化させる効果は、他の適応メカニズムである進化的変化の効果より大きいことを確認した。
4)適応的食物網の理論的解析
食物網の構造は生物の適応的餌戦略によって説明できる可能性が知られでいるが、餌としての適合度は捕食者・被食者の体サイズ比に影響を強く受ける。だが、体サイズはその測定の方法によって大きく変動する可能性があり、またその変動の仕方は注目する生物学的レベルに依存することを突き止めた。また、干潟の食物網が典型的なギルド内捕食構造をとり、(捕食者(鳥類)の適応的なエサ選択がその安定性に深く関わる可能性を示唆した。

  • 研究成果

    (35件)

すべて 2012 2011

すべて 雑誌論文 (10件) (うち査読あり 7件) 学会発表 (22件) 図書 (3件)

  • [雑誌論文] Non-random spatial couping induces desynchronization, chaos and multistability in a predator-prey-resource system2012

    • 著者名/発表者名
      K.Suzuki, T.Yoshida
    • 雑誌名

      Journal of Theoretical Biology

      巻: 300 ページ: 81-90

    • DOI

      10.1016/j.jtbi.2011.12.011

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Variable and complex food web structures revealed by exploring missing trophic links between birds and biofilm2012

    • 著者名/発表者名
      T.Kuwae, E.Miyoshi, S.Hosokawa, K.Ichimi, J.Hosoya, T.Amano, T.Moriya, M.Kondoh, R.C.Ydenberg, R.W.Elner
    • 雑誌名

      Ecology Letters

      巻: 15 ページ: 347-356

    • DOI

      10.1111/j.1461-0248.2012.01744.x

    • 査読あり
  • [雑誌論文] A non-lethal sampling method for estimating the trophic position of an endangered giant water bug using stable isotope analysis2012

    • 著者名/発表者名
      Ohba, S., J.Takahashi, N.Okuda
    • 雑誌名

      Insect Conservation and Diversity

      巻: (掲載確定)(in press)

    • DOI

      10.1111/j.1752-4598.2012.00198.x

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 生命のるつぼ「琵琶湖」:温暖化に翻弄される固有種たち2012

    • 著者名/発表者名
      奥田昇
    • 雑誌名

      生き物たちのつづれ織り

      巻: 5 ページ: 87-88

  • [雑誌論文] 生態-進化フィードバック-生態学という名の舞台で繰り広げられる進化劇-2012

    • 著者名/発表者名
      奥田昇
    • 雑誌名

      生き物たちのつづれ織り

      巻: 5 ページ: 27-33

  • [雑誌論文] Comparing the Effects of Rapid Evolution and Phenotypic Plasticity on Predator-Prey Dynamics2011

    • 著者名/発表者名
      Yamamichi, M., T. Yoshida, A. Sasaki
    • 雑誌名

      The American Naturalist

      巻: 178巻 ページ: 287-304

    • DOI

      DOI:10.1086/661241

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Phylogeography and historical demography of the anadromous fish Leucopsarion petersii in relation to geological history and oceanography around the Japanese Archipelago2011

    • 著者名/発表者名
      Kokita, T., K. Nohara
    • 雑誌名

      Molecular Ecology

      巻: 20巻 ページ: 143-164

    • DOI

      doi:10.1111/j.1365-294X.2010.04920.x

    • 査読あり
  • [雑誌論文] The role of body size in multispecies systems2011

    • 著者名/発表者名
      T.Nakazawa, M.Ushio, M.Kondoh
    • 雑誌名

      Advances in Ecological Research

      巻: 45 ページ: 269-302

    • DOI

      10.1016/B978-0-12-386475-8.00007-1

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Physical structure of habitat network differently affects migration patterns of native and invasive fishes in Lake Biwa and its tributary lagoons : Stable isotope approach2011

    • 著者名/発表者名
      Shibata, J., Z.Karube, M.Oishi, M.Yamaguchi, Y.Goda, N.Okuda
    • 雑誌名

      Population Ecology

      巻: 53 ページ: 143-153

    • DOI

      10.1007/s10144-010-0213-x

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 生命のるつぼ「琵琶湖」:生物標本はタイムマシーン2011

    • 著者名/発表者名
      奥田昇
    • 雑誌名

      生き物たちのつづれ織り

      巻: 4 ページ: 179-180

  • [学会発表] The ancient Lake Biwa as a biodiversity hot spot : how to detect drivers of biodiversity loss?2012

    • 著者名/発表者名
      Shibata J., Z.Karube、Y.Satoh, S.Yachi, S.Nakano, N.Okuda
    • 学会等名
      Planet Under Pressure
    • 発表場所
      International Conference Center, London, UK
    • 年月日
      2012-03-27
  • [学会発表] 捕食者と被食者の体サイズ比のスケール依存性2012

    • 著者名/発表者名
      仲澤剛史, 潮雅之, 近藤倫生
    • 学会等名
      Joint Meeting of the 59th Annual Meeting of ESJ and the 5th EAFES International Congress
    • 発表場所
      Ryukoku Univ., Otsu
    • 年月日
      2012-03-21
  • [学会発表] 混成群集ネットワークと個体群動態の安定性2012

    • 著者名/発表者名
      舞木昭彦, 近藤倫生
    • 学会等名
      Joint Meeting of the 59th Annual Meeting of ESJ and the 5th EAFES International Congress
    • 発表場所
      Ryukoku Univ., Otsu
    • 年月日
      2012-03-19
  • [学会発表] Grazing on the cyanobacterium Microcystis aeruginosa by the heterotrophic flagellate Collodictyon triciliatum in an experimental2012

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi Y., Y.Hodoki, K.Ohbayashi, H.Amano, T.Tanaka, N.Okuda, S.Nakano
    • 学会等名
      Joint Meeting of the 59th Annual Meeting of ESJ and the 5th EAFES International Congress
    • 発表場所
      Ryukoku Univ., Otsu
    • 年月日
      2012-03-19
  • [学会発表] The ancient Lake Biwa as a model of Asian lake ecosystems : historical and geographical patterns of biodiversity2012

    • 著者名/発表者名
      Shibata J., Z.Katube, Y.Sakai, T.Takeyama, I.Tayasu, Y.Satoh, S.Yachi, S.Nakano, N.Okuda
    • 学会等名
      Joint Meeting of the 59th Annual Meeting of ESJ and the 5th EAFES International Congress
    • 発表場所
      Ryukoku Univ., Otsu
    • 年月日
      2012-03-19
  • [学会発表] 非破壊的サンプリングによる高次捕食者の栄養段階の推定2012

    • 著者名/発表者名
      大庭伸也・奥田昇
    • 学会等名
      Joint Meeting of the 59th Annual Meeting of ESJ and the 5th EAFES International Congress
    • 発表場所
      Ryukoku Uuiv., Otsu
    • 年月日
      2012-03-19
  • [学会発表] Feedback between ecological and adaptive dynamics : experimental study using plankton2012

    • 著者名/発表者名
      T.Yoshida
    • 学会等名
      日本生態学会第59回大会
    • 発表場所
      大津市(龍谷大学)
    • 年月日
      2012-03-18
  • [学会発表] 相互作用ネットワークとしての生物群集理解:展望と限界2012

    • 著者名/発表者名
      近藤倫生
    • 学会等名
      Joint Meeting of the 59th Annual Meeting of ESJ and the 5th EAFES International Congress
    • 発表場所
      Ryukoku Univ., Otsu
    • 年月日
      2012-03-18
  • [学会発表] 水でつながる人の暮らしと琵琶湖の生物多様性In:公開講演会「生物間相互作用が作り出す生物多様性」2012

    • 著者名/発表者名
      奥田昇
    • 学会等名
      Joint Meeting of the 59th Annual Meeting of ESJ and the 5th EAFES International Congress
    • 発表場所
      Ryukoku Uuiv., Otsu(招待講演)
    • 年月日
      2012-03-17
  • [学会発表] dator feeding functional diversity as a driver for lake food web alterati2012

    • 著者名/発表者名
      Sakai, Y., K.Fukumori, K.Nishimatsu, I.Tayasu, N.Okuda
    • 学会等名
      Kyoto University and The University of Tokyo Global COE Joint Symposium
    • 発表場所
      東京(東京大学)
    • 年月日
      2012-01-20
  • [学会発表] Next-generation RAD RAD-sequencing for the genome-wide genetic marker discovery and linkage analysis in Gnathopogon fishes2012

    • 著者名/発表者名
      Kakioka, R., T.Kokita, H.Kumada, K.Watanabe, N.Okuda
    • 学会等名
      Kyoto University and The University of Tokyo Global COE Joint Symposium
    • 発表場所
      東京(東京大学)
    • 年月日
      2012-01-20
  • [学会発表] Linkage map construction using sequenced restriction-site associated DNA markers in Gnathopogon fishes2011

    • 著者名/発表者名
      Kakioka R., T.Kokita, H.Kumada, K.Watanabe, N.Okuda
    • 学会等名
      The 5th International Symposium of the Biodiversity and Evolution Global COE project
    • 発表場所
      Kyoto Univ., Kyoto
    • 年月日
      20110709-20110710
  • [学会発表] Predator feeding functional diversity as a driver for lake food web alterations2011

    • 著者名/発表者名
      Sakai Y., K.Fukumori, K.Nishimatsu, N.Okuda
    • 学会等名
      The 5th International Symposium of the Biodiversity and Evolution Global COE project
    • 発表場所
      Kyoto Univ., Kyoto
    • 年月日
      20110709-20110710
  • [学会発表] こタガメの栄養段階を推定する:安定同位体分析のための非侵略的サンプリング法2011

    • 著者名/発表者名
      大庭伸也・高橋純一・奥田昇
    • 学会等名
      第23回日本環境動物昆虫学会
    • 発表場所
      宮崎市(ホテルメリージュ)
    • 年月日
      2011-11-12
  • [学会発表] 混成群集ネットワークと個体群動態の安定性2011

    • 著者名/発表者名
      舞木昭彦, 近藤倫生
    • 学会等名
      個体群生態学会第27回大会
    • 発表場所
      岡山(岡山大学)
    • 年月日
      2011-10-15
  • [学会発表] 従属栄養鞭毛虫Collodictyon triciliatumのMicrocystis aeruginosaに対する摂食圧2011

    • 著者名/発表者名
      小林由紀・程木義邦・大林夏湖・天野一葉・田中拓弥・奥田昇, 中野伸一
    • 学会等名
      第27回日本微生物生態学会
    • 発表場所
      京都市(京都大学)
    • 年月日
      2011-10-08
  • [学会発表] タモロコ属魚類の湖沼適応の遺伝基盤の探索:次世代シーケンサーを利用したsRADマーカーによる連鎖地図作成とQTL解析2011

    • 著者名/発表者名
      柿岡諒・小北智之・熊田裕喜・渡辺勝敏・奥田昇
    • 学会等名
      第44回日本魚類学会
    • 発表場所
      弘前市(弘前大学)
    • 年月日
      2011-10-01
  • [学会発表] 炭素・窒素安定同位体比から推定された霞ヶ浦北浦におけるワカサギの回遊範囲2011

    • 著者名/発表者名
      荒山和則・奥田昇
    • 学会等名
      平成23年度日本水産学会秋季大会
    • 発表場所
      長崎市長崎大学
    • 年月日
      2011-09-29
  • [学会発表] 水界動物群集の「生物多様性-生態系機能関係」を再考する:栄養段階の重要性2011

    • 著者名/発表者名
      奥田昇・苅部甚一・酒井陽一郎・武山智博・陀安一郎・由水手景, 永田俊
    • 学会等名
      第76回日本陸水学会
    • 発表場所
      松江市(島根大学)
    • 年月日
      2011-09-23
  • [学会発表] 大久保賞受賞講演食物網をめぐる生態学:群集構造と動態をむすぶ2011

    • 著者名/発表者名
      近藤倫生
    • 学会等名
      第21回日本数理生物学会年会
    • 発表場所
      東京(明治大学)(招待講演)
    • 年月日
      2011-09-14
  • [学会発表] Functional diversity of predators alter ecosystem metabolism in experimental lake mesocosms2011

    • 著者名/発表者名
      Fukumori, K., Y.Sakai, K.Nishimatsu, I.Tayasu, M.Kondoh, N.Okuda
    • 学会等名
      The 5th International Symposium of the Biodiversity and Evolution Global COE project
    • 発表場所
      Kyoto Univ., Kyoto(招待講演)
    • 年月日
      2011-07-10
  • [学会発表] Ecological genetics of parallel adaptive evolution to the limnetic trophic niche in Japanese lakes2011

    • 著者名/発表者名
      Kokita, T.
    • 学会等名
      The 5th International Symposium of the Biodiversity and Evolution Global COE project
    • 発表場所
      Kyoto Univ., Kyoto(招待講演)
    • 年月日
      2011-07-10
  • [図書] シリーズ現代の生態学9淡水生態学のフロンティア2012

    • 著者名/発表者名
      古田丈人・鏡味麻衣子・加藤元海(編著), 奥田昇・陀安一郎(分担執筆)
    • 総ページ数
      269
    • 出版者
      共立出版
  • [図書] 温暖化の湖沼学2012

    • 著者名/発表者名
      永田俊・熊谷道夫・吉山浩平(編著), 奥田昇・陀安一郎(分担執筆)
    • 総ページ数
      289
    • 出版者
      京都大学出版会
  • [図書] エコロジー講座5生物間相互作用が作り出す生物多様性2012

    • 著者名/発表者名
      陀安一郎(責任編集), 奥田昇(分担執筆)
    • 総ページ数
      69
    • 出版者
      文一総合出版

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公開日: 2013-06-26  

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