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2010 年度 実績報告書

フェレドキシン依存性ビリン還元酵素群による多様なビリン色素合成の分子機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 20370037
研究機関大阪大学

研究代表者

福山 恵一  大阪大学, 大学院・理学研究科, 教授 (80032283)

研究分担者 高橋 康弘  埼玉大学, 大学院・理工学研究科, 教授 (10154874)
和田 啓  大阪大学, 大学院・理工学研究科, 助教 (80379304)
キーワードビリン色素 / X線結晶解析 / 光合成色素 / クロロフィルの分解 / 酵素反応機構 / PcyA / RCCR
研究概要

PcyAはヘムの代謝産物であるビリベルジンIXα(BV)をフェレドキシン依存的に還元し、光合成や光応答に利用されるテトラピロール色素、フィコシアノビリン、を合成する。PcyAはBVのD環のexo-ビニル基を還元した後、A環のendo-ビニル基を還元する特徴を持っており、BVの方向を厳密に区別して結合する。ところが、BVの認識に強く関与しているとは考えていなかったVal225をAspに置換したところ、この変異体PcyA-BVの吸収スペクトルに変化が見られた。この変異体PcyA-BVの結晶構造を決定したところ、BVが裏返って結合し、しかも野生型PcyAと異なりBVを結合してもinduced fitを起こしていなかった。この結果は変異体蛋白質の構造機能解析に警告を与えた。また、BVをPcyAとは異なる部位を還元するシアノバクテリア由来のビリベルジン還元酵素を発現・精製・結晶化した。この結晶とSe-Met体の回折実験を行った。
一方、クロロフィル分解系で主要な酵素、red chlorophyll catabolite reductase(RCCR)、の基質(RCC)結合型の結晶構造を決定した。さらに、RCCRのPhe218をValに置換した変異体、およびそのRCC結合型の結晶構造をも決定した。これらの構造情報を総合して、RCCRの活性残基を推定すると共に、変異に伴い反応生成物の立体構造が変わる理由を示した。また、RCCRによるRCCの還元部位がRCCの中央部にあることを反映して、PcyAとは異なり、RCCRが基質をルーズに結合している必然性に説明を与えた。

  • 研究成果

    (14件)

すべて 2011 2010 その他

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 5件) 学会発表 (7件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Expression, purification and preliminary X-ray crystallographic analysis of the cyanobacterial biliverdin reductase2011

    • 著者名/発表者名
      A.Watanabe, K.Fukuyama, et al.
    • 雑誌名

      Acta Crystallographica, Section F

      巻: F67 ページ: 313-317

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of the substrate-bound forms of red chlorophyll catabolite reductase : Implication for site-specific and stereospecific reaction2010

    • 著者名/発表者名
      M.Sugishima, K.Fukuyama, et al.
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Biology

      巻: 402 ページ: 879-891

    • 査読あり
  • [雑誌論文] One residue substitution in PcyA leads to unexpected changes in tetrapyrrole substrate binding2010

    • 著者名/発表者名
      K.Wada, K.Fukuyama, et al.
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      巻: 402 ページ: 373-378

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Enhancement of glutaryl-7-aminocepharosporanic acid acylase activity of γ-glutamyltranspeptidase of Bacillus subtilis2010

    • 著者名/発表者名
      H.Suzuki, K.Fukuyama, et al.
    • 雑誌名

      Biotechnology Journal

      巻: 5 ページ: 829-837

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 超分子マシーナリーが担う鉄硫黄クラスターの生合成2010

    • 著者名/発表者名
      高橋康弘、和田啓、福山恵一
    • 雑誌名

      生化学

      巻: 82 ページ: 139-143

  • [雑誌論文] 鉄硫黄クラスター生合成マシナリーの構造と作動機構2010

    • 著者名/発表者名
      和田啓、福山恵一、高橋康弘
    • 雑誌名

      化学と生物

      巻: 48 ページ: 831-838

    • 査読あり
  • [学会発表] グルタチオン代謝の鍵酵素γ-グルタミルトランスペプチダーゼに対する古典的阻害剤アシビシンの結合様式2010

    • 著者名/発表者名
      伊田知代、和田啓、平竹潤、鈴木秀之、福山恵一
    • 学会等名
      第83回日本生化学会大会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(兵庫)
    • 年月日
      2010-12-07
  • [学会発表] ビリン還元酵素PcyA変異体I86D-BV複合体の高分解能構造解析2010

    • 著者名/発表者名
      入川鉄平、和田啓、萩原義徳、福山恵一
    • 学会等名
      日本結晶学会年会 創立60周年記念大会
    • 発表場所
      大阪大学コンベンションセンター
    • 年月日
      2010-12-03
  • [学会発表] 鉄硫黄クラスターのde novo合成を担うISC蛋白質群の複合体解析2010

    • 著者名/発表者名
      平林佳、岩永朋子、高橋康弘、福山恵一、和田啓
    • 学会等名
      日本結晶学会年会 創立60周年記念大会
    • 発表場所
      大阪大学コンベンションセンター
    • 年月日
      2010-12-03
  • [学会発表] 基質結合型結晶構造から推定されるred chlorophyll catabolite reductaseの反応機構2010

    • 著者名/発表者名
      杉島正一、岡本千寛、野口正人、河内孝之、民秋均、福山恵一
    • 学会等名
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道)
    • 年月日
      2010-06-18
  • [学会発表] ビリン色素合成酵素PcyAは新規な機構で基質を還元しているのか2010

    • 著者名/発表者名
      萩原義徳、和田啓、福山恵一
    • 学会等名
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道)(招待講演)
    • 年月日
      2010-06-17
  • [学会発表] NMRによるヘム認識機構の解明2010

    • 著者名/発表者名
      原田英里砂、杉島正一、野口正人、福山恵一、菅瀬謙治
    • 学会等名
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道)
    • 年月日
      2010-06-17
  • [学会発表] 超好熱菌Aquifex aeolicusの鉄硫黄クラスター生合成に関わる中核成分、脱硫黄酵素IscSと中間体クラスター形成蛋白質IscUの相互作用2010

    • 著者名/発表者名
      平林佳、中嘉孝、高橋康弘、福山恵一、和田啓
    • 学会等名
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道)
    • 年月日
      2010-06-17
  • [備考]

    • URL

      http://bio.sci.osaka-u.ac.jp/bio_web/lab_page/fukuyama/index.html

URL: 

公開日: 2012-07-19  

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