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2011 年度 実績報告書

ナシ属初の自殖F2集団を用いた果実有用形質のマッピングと高機能新品種開発への応用

研究課題

研究課題/領域番号 20380021
研究機関鳥取大学

研究代表者

板井 章浩  鳥取大学, 農学部, 准教授 (10252876)

研究分担者 児玉 基一朗  鳥取大学, 農学部, 教授 (00183343)
山本 俊哉  (独)農業・食品産業技術総合研究機構, 果樹研究所, 果樹ゲノムチーム長 (60355360)
村山 秀樹  山形大学, 農学部, 教授 (40230015)
キーワードナシ / SNP / ショ糖 / 良食味 / マイクロアレイ / 次世代シークエンサー / MAS
研究概要

本研究課題は、ナシにおいて、果実の品質の重要な決定因子である味などの有用形質および病害抵抗性に関するマーカー開発を行い、MAS(Marker Assisted Selection)で育種現場で実際に適用し、新品種開発に役立てることを目的として研究を行った。これまで酸性インベルターゼ(AIV)をコードする遺伝子PpAIV2のゲノミックサザン解析により、4.4kbおよび3.3kb付近に位置するバンドが、ショ糖含量が中・低蓄積型の品種に特異的に検出されることを見いだしていたが、このマーカーをPCR利用の簡便なAFLPマーカーに変換することに成功した。このマーカーを用いて、実際のニホンナシ育種集団への適応性を検定し、ショ糖含量の多少と一致することを確認した。またニホンナシ100品種以上のAIV2遺伝子型を決定した。ショ糖含量が高蓄積型になる品種においては、ショ糖合成の鍵酵素であるショ糖リン酸合成酵素(PPSPS1)遺伝子が重要であるが、この遺伝子のプロモーターには大きな品種間差異が見られることを発見した。さらにマイクロアレイ解析により、果実肥大が優れる品種および単為結果性を示す品種において発現の様相が大きく異なる遺伝子を同定した。これらの遺伝子の中には、転写因子群が含まれ、今後果実サイズおよび単為結果性のマーカー開発が可能になってくると思われる。病害抵抗性のマーカー開発は,黒星病および黒斑病でより病原性遺伝子近傍に連鎖したSSRマーカーが得られ、このニホンナシの2大病害抵抗性品種開発が高確率で可能になった。ニホンナシ及びセイヨウナシ品種より次世代シーケンサーを用いたゲノム配列の取得を行い、配列比較解析から、多数のSNPをニホンナシとセイヨウナシ間で見いだした。

  • 研究成果

    (14件)

すべて 2012 2011

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (10件)

  • [雑誌論文] Parthenocarpic genetic resources and gene expression related to parthenocarpy among four species in pear (Pyrus spp.)2012

    • 著者名/発表者名
      Nishitani, C.
    • 雑誌名

      Scientia Horticulturae

      巻: 136 ページ: 101-109

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Ethylene Analog and 1-Methylcyclopropene Enhance Black Spot Disease Development in Pyrus pyrifolia Nakai2012

    • 著者名/発表者名
      Itai, A.
    • 雑誌名

      HortScience

      巻: 47 ページ: 228-231

    • 査読あり
  • [雑誌論文] ニホンナシにおけるTRIM型レトロトランスポゾン配列の取得と品種識別マーカーへの利用2011

    • 著者名/発表者名
      Kim, H.
    • 雑誌名

      DNA多型

      巻: 19 ページ: 88-92

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular characterization of novel Tyl-copia-like retrotransposons in pear (Pyrus pyrifolid)2011

    • 著者名/発表者名
      Kim, H.
    • 雑誌名

      Tree Genetics & Genomes

      巻: 7 ページ: 845-856

    • 査読あり
  • [学会発表] ニホンナシ黒斑病原因遺伝子座のファインマッピングとBACコンティグの構築2012

    • 著者名/発表者名
      寺上伸吾
    • 学会等名
      育種学会
    • 発表場所
      宇都宮大学
    • 年月日
      2012-03-30
  • [学会発表] ニホンナシにおける収穫期を始めとする果実形質のQTL解析2012

    • 著者名/発表者名
      山本俊哉
    • 学会等名
      育種学会
    • 発表場所
      宇都宮大学
    • 年月日
      2012-03-30
  • [学会発表] 分離集団における量的形質分布を両親のゲノムワイドマーカー遺伝子型から予測する:日本ナシデータへの適用2012

    • 著者名/発表者名
      岩田洋佳
    • 学会等名
      育種学会
    • 発表場所
      宇都宮大学
    • 年月日
      2012-03-30
  • [学会発表] ニホンナシにおける病害抵抗性と自家和合性実生のDNAマーカー選抜2012

    • 著者名/発表者名
      山本俊哉
    • 学会等名
      園芸学会
    • 発表場所
      大阪府立大学
    • 年月日
      2012-03-29
  • [学会発表] ニホンナシ果実の糖組成の品種間差異の分子機構2012

    • 著者名/発表者名
      板井章浩
    • 学会等名
      園芸学会
    • 発表場所
      大阪府立大学
    • 年月日
      2012-03-29
  • [学会発表] Skin color and pigment changes during ripening of pear fruit2012

    • 著者名/発表者名
      Charoenchongsuk, N.
    • 学会等名
      園芸学会
    • 発表場所
      大阪府立大学
    • 年月日
      2012-03-28
  • [学会発表] ニホンナシ黒斑病の病斑拡大におけるエチレンの作用2011

    • 著者名/発表者名
      板井章浩
    • 学会等名
      植物化学調節学会
    • 発表場所
      宇都宮大学
    • 年月日
      2011-11-02
  • [学会発表] プロピレンと1-MCP処理によるニホンナシ黒斑病の病斑拡大2011

    • 著者名/発表者名
      板井章浩
    • 学会等名
      園芸学会
    • 発表場所
      岡山大学
    • 年月日
      2011-09-25
  • [学会発表] ナシにおける遺伝子発現とゲノム機能解析9.次世代シーケンサの配列情報を利用したニホンナシとセイヨウナシのマイクロアレイ作成2011

    • 著者名/発表者名
      西谷千佳子
    • 学会等名
      園芸学会
    • 発表場所
      岡山大学
    • 年月日
      2011-09-25
  • [学会発表] ニホンナシ育種におけるDNAマーカー開発と利用2011

    • 著者名/発表者名
      山本俊哉
    • 学会等名
      園芸学会
    • 発表場所
      岡山大学
    • 年月日
      2011-09-23

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公開日: 2013-06-26  

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