細菌鞭毛フラジェリンの構造機能相関と細胞表層局在化機構

2010 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 20380049
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 応用微生物学
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 村田 幸作 京都大学, 農学研究科, 教授 (90142299)
• 研究分担者: 橋本 渉 京都大学, 農学研究科 (30273519) ; 三上 文三 京都大学, 農学研究科 (40135611)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2010
• キーワード: フラジェリン / 鞭毛 / ペプチドグリカン加水分解酵素 / メタロペプチダーゼ / X線結晶構造解析 / 体腔形成細菌

研究概要

Sphingomonas属細菌A1株では、鞭毛形成タンパク質フラジェリンは鞭毛形成には与らず、細胞表層に局在し、強力なアルギン酸結合活性を示し、且つその欠失は細胞死を惹起する。フラジェリンのかかる特異な性質の生物学的意義を明らかにするため、フラジェリン、フラジェリンの細胞表層繋留タンパク質、並びにフラジェリンの細胞表層通過を許容するペプチドグリカン分解酵素の立体構造を決定し、その構造機能相関とそこから導き出される生物学的意義を考察した。

研究成果

• [雑誌論文] Crystal structure of bacterial cell-surface alginate-binding protein with an M_75 peptidase motif. (2011)
  • 著者名/発表者名: Yukie Maruyama, Akihito Ochiai, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, Kousaku Murata
  • 雑誌名: Biochem. Biophys. Res.Commun 405(3) ページ: 411-416
  • 査読あり
• [雑誌論文] Heterosubunit composition and crystal structures of a novel bacterial M16B metallopeptidase. (2011)
  • 著者名/発表者名: Yukie Maruyama, Asako Chuma, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, Kousaku Murata
  • 雑誌名: J.Mol.Biol. 407(1) ページ: 180-192
  • 査読あり
• [雑誌論文] Bacterial supersystem for alginate import/metabolism and its environmental and bioenergy applications. (2010)
  • 著者名/発表者名: Wataru Hashimoto, Shigeyuki Kawai, Kousaku Murata
  • 雑誌名: Bioengineered Bugs. 1(2) ページ: 1-13
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structure of the glycosidase family 73 peptidoglycan hydrolase FlgJ. (2009)
  • 著者名/発表者名: Wataru Hashimoto, Akihito Ochiai, Keiko Momma, Takafumi Itoh, Bunzo Mikami, Yukie Maruyama, Kousaku Murata
  • 雑誌名: Biochem.Biophys.Res.Commun. 381 ページ: 16-21
  • 査読あり
• [雑誌論文] Superchannel of bacteria : biological significance and new horizons. (2008)
  • 著者名/発表者名: Kousaku Murata, Shigeyuki Kawai, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto
  • 雑誌名: Biosci. Biotechnol. Biochem. 72(2) ページ: 265-277
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structure of a novel bacterial cell-surface flagellin binding to polysaccharide. (2008)
  • 著者名/発表者名: Yukie Maruyama, Misato Momma, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, Kousaku Murata
  • 雑誌名: Biochemstry 47(5) ページ: 1393-1402
  • 査読あり
• [学会発表] Sphingomonas属細菌A1株由来ペプチドグリカン分解酵素の立体構造に基づく触媒機構解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 丸山如江、落合秋人、三上文三、橋本渉、村田幸作
  • 学会等名: 日本農芸化学会関西支部大会
  • 発表場所: 奈良(口頭発表)
  • 年月日: 2010-10-03
• [学会発表] Sphingomonas属細菌A1株由来細胞表層に局在するアルギン酸結合タンパク質の遺伝子発現とX線結晶構造解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 橋本渉、丸山如江、落合秋人、三上文三、村田幸作
  • 学会等名: 日本農芸化学会関西支部大会
  • 発表場所: 奈良(口頭発表)
  • 年月日: 2010-10-03
• [学会発表] 細菌由来メタロペプチダーゼファミリーM16酵素のX線結晶構造 (2010)
  • 著者名/発表者名: 丸山如江、橋本渉、村田幸作
  • 学会等名: 日本農芸化学会平成22年度大会
  • 発表場所: 東京(口頭発表)
  • 年月日: 2010-03-28
• [学会発表] ファミリーGH73ペプチドグリカン分解酵素のX線結晶構造 (2009)
  • 著者名/発表者名: 橋本渉、落合秋人、門間敬子、丸山如江、伊藤貴文、三上文三、村田幸作
  • 学会等名: 日本農芸化学会2009年度大会
  • 発表場所: 福岡(口頭発表)
  • 年月日: 2009-03-28