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2008 年度 実績報告書

糖転移作用を支配する構造因子の分子解析と応用

研究課題

研究課題/領域番号 20380056
研究機関北海道大学

研究代表者

木村 淳夫  北海道大学, 大学院・農学研究院, 教授 (90186312)

研究分担者 奥山 正幸  北海道大学, 大学院・農学研究院, 助教 (00344490)
キーワード糖転移 / 構造因子 / 分子解析
研究概要

糖質酵素が触媒する糖転移作用を制御できる新しい現象を3つ見出した。すなわち、1)長鎖オリゴ糖を生産する新規な転移酵素、2)触媒水の結合部位、3)受容体の結合部位、である。本研究の目的は、これらの現象を解析し、転移作用の分子機構を知り、応用研究に結びつけることにある。具体的には、i)それぞれの現象から「糖転移を支配する構造因子(蛋白質の部分構造)」の決定 ; ii)その機能の機構究明 ; iii)構造因子を他の酵素に移植 ; iv)有用な機能の利用、である。糖転移反応の改良・開発は要求が強いため、応用研究への発展を図る。計画は順調に進行しており、次の研究成果を得た。
長鎖オリゴ糖の生産酵素 : 1)酵素遺伝子発現と結晶化 : 酵素遺伝子を大腸菌の系で発現・酵素精製に成功した。結晶化条件を調査中である。2)拮抗阻害剤の探索 : 「阻害剤-酵素複合体」の結晶調製のため拮抗阻害剤を探索し、トリスが候補となった。3)自殺基質による触媒残基推定 : 「基質-触媒残基置換酵素」の結晶作製に必要な触媒残基の推定を自殺基質法で調べた。コンズリトールBエポキシドを酵素に作用させたところ、自殺基質の様式で失活した。本化合物が結合したアミノ酸を決定中である。触媒水の結合部位 : 4)結合部位を構築するアミノ酸 : デキストラン-グルコシダーゼ(DDase)の触媒水サイトを構築するアミノ酸に変異を導入した。変異酵素の加水分解力は低下したが、転移能力は向上した。受容体の結合部位 : 5)結合部位の改変(基質切断点の近傍) : DDaseの基質切断点近傍にある受容体結合部位に対し、立体構造情報から置換アミノ酸の候補を決め、置換酵素を作製した。予想どおり親酵素(α-1, 6結合生成能が高い)と異なる転移特異性を示した。加水分解のグルコシド結合認識も変化した。6)結合部位の改変(基質切断点の遠位) : DDaseの立体構造から受容体結合部位の遠位に位置する残基に変異を与え、転移作用を調べた。特異性は変化しなかったが、5)にある近傍への変異との組み合わせで明瞭な効果が発揮されると考えられるので、現在検討中である。

  • 研究成果

    (14件)

すべて 2009 2008

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 6件) 学会発表 (7件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Substrate recognition of α-1,6-glucosidic linkage hydrolyzing enzyme, dextran glucosidase from Streptococcus mutans2008

    • 著者名/発表者名
      Hondoh H
    • 雑誌名

      J Mol Biol 378

      ページ: 911-920

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Substrate recognition of Escherichia coli YicI(α-xylosidase)2008

    • 著者名/発表者名
      Okuyama M
    • 雑誌名

      J Appl Glycosci 55

      ページ: 111-118

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure-function relationship of substrate length specificity of dextran glucosidase from Streptococcus mutans2008

    • 著者名/発表者名
      Saburi W
    • 雑誌名

      Biologia, sect Cell Mol Biol 63

      ページ: 1000-1005

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Enzymatic synthesis of α-2-deoxyglucosyl derivatives catalyzed by organic solvent-resistant α-glucosidase2008

    • 著者名/発表者名
      Kim YM
    • 雑誌名

      Biotechnol Bioprocess Eng 13

      ページ: 639-645

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Isolation of Bacillus and Paenibacillus bacterial strains that produce large molecular of cyclic isomaltooligosaccharides2008

    • 著者名/発表者名
      Funane K
    • 雑誌名

      Biosci Biotechnol Biochem 72

      ページ: 3277-3280

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural and functional analysis of a glycoside hydrolase family 97 enzyme from Bacteroides thetaiotaomicron2008

    • 著者名/発表者名
      Kitamura M
    • 雑誌名

      J Biol Chem 283

      ページ: 36328-36337

    • 査読あり
  • [学会発表] Isomaltooligosaccharide 6-α-glucosyltransfbrase (I6GT)のイソマルトオリゴ糖への作用と転移に関する構造因子2009

    • 著者名/発表者名
      西村崇志
    • 学会等名
      日本農芸化学会2009年度大会
    • 発表場所
      マリンメッセ福岡(福岡)
    • 年月日
      2009-03-28
  • [学会発表] Structure-based mutagenesis for the modulation of the substrate specificity of dextran glucosidase2008

    • 著者名/発表者名
      Hondoh H
    • 学会等名
      24th International Carbohydrate Symposium
    • 発表場所
      University of Oslo, Oslo, Norway
    • 年月日
      20080727-0801
  • [学会発表] Heterologous overproduction and characterization of a novel α-glucosidase from Lactobacillus johnsonii NBRC13952.2008

    • 著者名/発表者名
      Kang MS
    • 学会等名
      24th International Carbohydrate Symposium
    • 発表場所
      University of Oslo, Oslo, Norway
    • 年月日
      20080727-0801
  • [学会発表] Engineering on substrate recognition of hydrolysis and transglucosylati on of Streptococcus mutans dextran glucosidase2008

    • 著者名/発表者名
      Hondoh H
    • 学会等名
      16th Symposium on Amylases and Related Enzymes
    • 発表場所
      Okinawa Convention Center, Ginowan City, Japan
    • 年月日
      2008-09-20
  • [学会発表] α-1, 4グルコシド結合特異的なdextran glucosidase変異体の基質認識機構2008

    • 著者名/発表者名
      本同宏成
    • 学会等名
      応用糖質科学会平成20年度大会(第57回)
    • 発表場所
      琉球大学,沖縄
    • 年月日
      2008-09-18
  • [学会発表] Bacillus sp.由来isomaltooligosaccharide 6-α-glucosyltrasferase(I6GT)の転移反応に関与する構造因子2008

    • 著者名/発表者名
      鐘ヶ江倫世
    • 学会等名
      応用糖質科学会平成20年度大会(第57回)
    • 発表場所
      琉球大学, 沖縄
    • 年月日
      2008-09-18
  • [学会発表] 新規酵素isomaltooligosaccharide 6-α-glucosyltransferase (16GT)の機能解析2008

    • 著者名/発表者名
      鐘ヶ江倫世
    • 学会等名
      日本農芸化学会北海道支部合同学術講演会
    • 発表場所
      北海道大学,札幌
    • 年月日
      2008-08-09
  • [図書] Molecular mechanism of α-glucosidase. "arbohydrate-active enzymes : structure,function, and applications (ed. by Park K-H)"2008

    • 著者名/発表者名
      Okuyama M
    • 総ページ数
      299(64-76)
    • 出版者
      Woodhead Publishing Ltd. (Cambridge, England)

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公開日: 2010-06-11   更新日: 2016-04-21  

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