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2008 年度 実績報告書

乳がん診断・治療におけるマイクロRNA発現プロファイルの応用

研究課題

研究課題/領域番号 20390342
研究機関京都大学

研究代表者

清水 一治  京都大学, 薬学研究科, 教授 (50456836)

研究分担者 辻本 豪三  京都大学, 薬学研究科, 教授 (80172013)
佐藤 史顕  京都大学, 薬学研究科, 准教授 (20467426)
土屋 創健  京都大学, 薬学研究科, 助教 (80423002)
戸井 雅和  京都大学, 医学研究科, 教授 (10207516)
上野 貴之  京都大学, 医学研究科, 助教 (40452362)
キーワード乳癌 / microRNA
研究概要

本課題の目的は、乳癌の臨床に応用できるマイクロRNA(miR)の探索にある。課題の初年度として、まず、miRの検出系であるmiRマイクロアレイのデータの再現性と、in vitroの実験系で乳癌に関連するmiRの探索を行った。
(1) miRマイクロアレイの信頼性の検証:市場で入手可能な5種類のmiRマイクロアレイについて調査したところ、アジレント社と東レ社の製品はプラットフォーム内再現性が高く、プラットフォーム間データの一致性が高かった。また、定量的PCR法によるmiR定量データとの相関も高く、データの信頼性が高いと考えられ、今後のプロジェクトに東レ製miRマイクロアレイを使用することになった。(Sato F, et al. PLoS One, 2009, in press)
(2) Herceptin感受性:乳癌細胞株11株を蒐集し、そのHer2増幅の有無とHerceptin感受性を調べた。11株中Her2増幅株は3株あり、その中で、2株(SK-BR-3、BT-474)が明らかなHerceptin感受性を示した。そこで、感受性株であるSK-BR-3から、Herceptin長期暴露により、Herceptin耐性株の樹立を試みたが、2か月以上の長期暴露でも、Herceptin耐性が得られなかった。
(3)乳癌細胞株のmiRプロファイリング:正常乳管上皮細胞と乳癌細胞株11株のmiR発現を上記マイクロアレイ法で取得した。Herceptin感受性株で発現の変動をしているmiR8個(上昇:6個、低下:2個)を選択した。今後は、これらのmiRに対して定量的RT-PCRによる発現量の検証、機能解析、臨床標本におけるmiR発現の意義を解析していく予定である。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2009 2008

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] Intra-platform Repeatability and Inter-platform Comparability of MicroRNA Microarray Technology.2009

    • 著者名/発表者名
      Sato F, et al.
    • 雑誌名

      PLoS One (in press)

    • 査読あり
  • [雑誌論文] MicroRNA-338-3p and microRNA-451 contribute to the formation of basolateral polarity in epithelial cells2009

    • 著者名/発表者名
      Tsuchiya S, et al.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research (in press)

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 特集・がん化学療法個別化の現状と展望、トランスクリプトーム解析に基づくがん化学療法の最適化とゲノム創薬2008

    • 著者名/発表者名
      佐藤史顕, 辻本豪三, 清水一治
    • 雑誌名

      医薬ジャーナル 44

      ページ: 104-108

  • [学会発表] #4P-1510 Reproducibility and Quantitivity of microRNA microarray2008

    • 著者名/発表者名
      佐藤史顕
    • 学会等名
      分子生物学会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2008-12-12

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公開日: 2010-06-11   更新日: 2016-04-21  

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