2010 年度研究成果報告書

大規模分子シミュレーションによるヘモグロビンの新たな四次構造変化の提唱と実証

研究課題

研究課題/領域番号	20500268
研究種目	基盤研究(C)
配分区分	補助金
応募区分	一般
研究分野	生体生命情報学
研究機関	弘前大学
研究代表者	斎藤稔弘前大学, 大学院・理工学研究科, 教授 (60196011)
研究協力者	長井雅子法政大学, 工学研究科, 客員教授 (60019578)
研究期間 (年度)	2008 – 2010
キーワード	生体生命情報学
研究概要	スーパーコンピュータと独自に開発したソフトウエアCOSMOS90を駆使して、大規模なシミュレーションを可能にし、ヘモグロビンの新たな四次構造変化を明らかにした。COSMOS90は、開発者である筆者が自ら、スーパーコンピュータ上でベクトル化と並列化とを行って高速化した。それによって、ヘモグロビンのような巨大な蛋白質を全原子、全自由度、全相互作用を考慮して、リアルな条件下で長時間シミュレーションすることを可能にした。これまで、ヘモグロビンに対してこのような研究は行われていなかった。