シグナル伝達系パスウエイの挙動に基づく細胞群シミュレーション法の確立

2010 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 20500275
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 生体生命情報学
• 研究機関: 岡山理科大学
• 研究代表者: 山田 訓 岡山理科大学, 工学部, 教授 (20393506)
• 連携研究者: 吉村 昭彦 慶應義塾大学, 医学部, 教授 (90182815)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2010
• キーワード: ヘルパーT細胞 / 免疫ネットワーク / 転写因子 / サイトカイン / シミュレーション / iTreg / Th17

研究概要

ヘルパーT細胞のサブタイプの分化のモデル化を題材に細胞内反応と細胞群の挙動を同時に計算する手法を開発した。サブタイプに分化する前のTh0内の転写因子相互作用とサイトカインによる分化・増殖の影響をモデル化し、Th17とiTregのTCR刺激強度依存性とTGF-β濃度依存性を再現することができた。その際に、Foxp3で誘導されRORγtの効果を抑制する未知の抑制因子が必要であることがわかった。樹状細胞とnTregを加えた系でiTregの生理的役割を解析した。

研究成果

• [学会発表] Computer model of helper T cell differentiation (2010)
  • 著者名/発表者名: 山田訓, 吉村昭彦
  • 学会等名: The 2nd Synthetic Immunology Workshop
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2010-12-18
• [学会発表] Computer model of helper T cell differentiation with transcription factor's interactions (2010)
  • 著者名/発表者名: 山田訓, 吉村昭彦
  • 学会等名: BMB2010
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-10
• [学会発表] Computer model of helper T cell differentiation (2010)
  • 著者名/発表者名: 山田訓, 吉村昭彦
  • 学会等名: 14th International IL Congress of Immunology
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-08-23
• [学会発表] Model analysis of Helper T cell differentiation with transcriptional factor's interactions in Th0 (2009)
  • 著者名/発表者名: 山田訓, 吉村昭彦
  • 学会等名: The 20th International Conference on Genome Informatics
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 20091214-20091216
• [学会発表] 転写因子相互作用を含むヘルパーT細胞分化のモデル化 (2009)
  • 著者名/発表者名: 山田訓,吉村昭彦
  • 学会等名: 第39回日本免疫学会総会・学術集会
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2009-12-03
• [学会発表] ヘルパーT細胞分化のモデル化 (2008)
  • 著者名/発表者名: 山田訓,吉村昭彦
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会第81回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-12-09
• [学会発表] ヘルパーT細胞分化のモデル化 (2008)
  • 著者名/発表者名: 山田訓,吉村昭彦
  • 学会等名: 第38回日本免疫学会総会・学術集会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2008-12-01