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2009 年度 実績報告書

オミックス解析によるマイクロRNAのがんにおける役割の解明

研究課題

研究課題/領域番号 20510184
研究機関東京医科歯科大学

研究代表者

福岡 豊  東京医科歯科大学, 疾患生命科学研究部, 准教授 (30242217)

研究分担者 水島 洋  東京医科歯科大学, 疾患生命科学研究部, 特任教授 (50219630)
田中 博  東京医科歯科大学, 疾患生命科学研究部, 教授 (60155158)
キーワードマイクロRNA / 遺伝子発現 / 肝細胞がん / マイクロアレイ
研究概要

本研究の目的は、肝細胞がんにおいて、網羅的遺伝子発現・臨床情報などのオミックス情報とマイクロRNA(miRNA)の発現データを統合し、がん細胞においてmiRNAが近傍の遺伝子の発現に与える影響を明らかにすることである。
平成20年度に、miRNAを中心とした様々な大きさのウインドウ中の遺伝子の平均発現量を比較するというウインドウ解析を行い、肝細胞がんではがん部と非がん部でmiRNA近傍の遺伝子の発現状態が顕著に異なることを見出した。すなわち、がん部ではmiRNA近傍の遺伝子の発現レベルがゲノム全体と異なるが、非がん部では全体と変わらない。平成21年度は、検体数を8人分増やして20人分とするとともに、そのような現象の原因について考察した。具体的には、miRNAと遺伝子の発現の相関係数を比較した。がん部と非がん部の差はウインドウ幅が小さくなるほど顕著になり、ウインドウ幅が小さい場合は、がん部で正の相関を示すものが有意に多くなった。一方、miRNAターゲット予測プログラムmiRandaによって予測されたターゲット遺伝子とmiRNAの相関係数は、がん部と非がん部で有意な差がなかった。これらの結果から、がん部においては、miRNAとターゲットの関係は正常であるが、miRNAの発現に異常が生じている可能性が示唆された。
現在、近傍遺伝子との相関係数が有意に異なるmiRNAを選定し、miRNAの発現に関して詳しく検討している。

  • 研究成果

    (7件)

すべて 2009

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (6件)

  • [雑誌論文] シリコーン膜のひずみと膜接着細胞のみずみとの比較2009

    • 著者名/発表者名
      小林こず恵、岸亜由美、田中真澄、稲岡秀検、根武谷吾、福岡豊, ほか
    • 雑誌名

      生体医工学 47

      ページ: 464-469

    • 査読あり
  • [学会発表] 肝細胞がんにおけるmicroRNA発現量と近傍遺伝子発現量の関係2009

    • 著者名/発表者名
      岩村泰輔、福岡豊、内山孝憲、稲岡秀検、Muhmut Y、水島洋, ほか
    • 学会等名
      第32回分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      20091200
  • [学会発表] Co-expression analysis in close physical proximity using tumor data2009

    • 著者名/発表者名
      稲岡秀検, 福岡豊, 野城真理
    • 学会等名
      The 20th International Conference on Genome Informatics
    • 発表場所
      Yokohama
    • 年月日
      20091200
  • [学会発表] 肺動脈内皮細胞の機械的伸展による形状変化の測定2009

    • 著者名/発表者名
      小林こず恵、岸亜由美、田中真澄、稲岡秀検、根武谷吾、福岡豊, ほか
    • 学会等名
      第24回生体生理工学シンポジウム
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      20090900
  • [学会発表] 大規模がん発現データにおける共発現解析2009

    • 著者名/発表者名
      稲岡秀検、福岡豊、野城真理
    • 学会等名
      第48回生体医工学大会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      20090400
  • [学会発表] 肺胞上皮細胞の機械的伸展による形状変化の測定2009

    • 著者名/発表者名
      小林こず恵、岸亜由美、田中真澄、稲岡秀検、根武谷吾、福岡豊, ほか
    • 学会等名
      第48回生体医工学大会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      20090400
  • [学会発表] Cytokine productions and gene expressions caused by mechanical stretching of normal human pulmonary artery endothelial cells2009

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi K, Tanaka M, Inaoka H, Nebuya S, Fukuoka Y, Kobayashi H, Noshiro M
    • 学会等名
      The 20th International Conference on Genome Informatics
    • 発表場所
      Yokohama
    • 年月日
      20090000

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公開日: 2011-06-16   更新日: 2016-04-21  

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