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2008 年度 実績報告書

シロイヌナズナ無細胞転写解析法による光依存転写機構の解析

研究課題

研究課題/領域番号 20510188
研究機関名古屋市立大学

研究代表者

湯川 泰  名古屋市立大学, 大学院・システム自然科学研究科, 准教授 (70381902)

キーワードシロイヌナズナ / 転写 / 無細胞系 / 光依存制御 / MM2d株 / 培養細胞 / 液胞除去 / 光合成
研究概要

真核生物の遺伝子の発現制御は主に転写レベルで行われている。現在、植物における遺伝子転写制御に関する分子生物学的知見は、in vitroで転写を解析できる手法の欠如ゆえ極めて乏しい。本研究では、顕花植物でポストゲノム情報および遺伝学的資産の整った、シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)由来の無細胞転写系開発を目的としている。
シロイヌナズナは植物体が小さいという弱点を克服するため、本研究では材料として増殖の速い培養細胞(MM2d細胞)を用いることにした。まず始めに、MM2d細胞の培養条件を検討した結果、培地組成はタバコ培養細胞BY-2株に用いていた組成が成長速度および細胞の状態において良好であった。培養時間は4日間で200gの細胞を調製し、その後の実験に用いることにした。MM2d細胞は懸濁培養液中で小さな塊を作るため、プロトプラスト調製に必要な時間を延ばすことで効率化を図った。続いて、プロトプラストからの核を単離する際に必要な条件を検討した。細胞破砕法として、ナイロンメッシュおよびダウンスホモジナイザーを試したが、前者の結果が良好であった。単離した核から可溶性画分を抽出して、シロイヌナズナのU2snRNA遺伝子を用いて、Pol II依存の転写活性を検出することにより転写活性を検定した。検出法は、in vitroで合成されたU2snRNAに対する蛍光標識プライマーを作成し、逆転写により放射性同位元素を用いずに行った。当初は、実際に活性を検出するに至なかったが、プロトプラストからさらに液胞を除去することによって弱いながら転写活性を検出した。これらの結果は大きな前進であり、今後をさらに詳細に条件を検討することによって、比較的容易に活性向上を図れることを意味する。したがって、引き続き活性向上に努め、最終目標である光依存的な転写制御の解析を実現する。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2009 2008

すべて 学会発表 (6件)

  • [学会発表] タバコ葉緑体翻訳反応における 5'非翻訳領域とコード領域の適合性検証2009

    • 著者名/発表者名
      大羽 由衣, 湯川 眞希, 杉浦昌弘, 湯川 泰
    • 学会等名
      日本植物生理学会第50回年会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2009-03-22
  • [学会発表] 葉緑体psbD-psbC翻訳開始機構の解析2008

    • 著者名/発表者名
      足達 由佳, 黒田 洋詩, 杉浦昌弘, 湯川 泰
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会 第81回日本生化学会大会 合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2008-12-10
  • [学会発表] イネ新規non-coding RNA の探索2008

    • 著者名/発表者名
      西田 満帆, 杉浦 昌弘, 湯川 泰
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会 第81回日本生化学会大会 合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2008-12-09
  • [学会発表] シロイヌナズナ培養細胞核由来の in vitro転写系の開発2008

    • 著者名/発表者名
      岩田 真也, 杉浦 昌弘, 湯川 泰
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会 第81回日本生化学会大会 合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2008-12-09
  • [学会発表] 葉緑体 in vitro翻訳系を用いた翻訳機構の解析2008

    • 著者名/発表者名
      黒田 洋詩, 湯川 眞希, 鈴木晴香, 湯川 泰, 杉浦 昌弘
    • 学会等名
      大阪大学蛋白質研究所セミナー国際シンポジウム「葉緑体のすべてに迫る」
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2008-10-14
  • [学会発表] シロイヌナズナ培養細胞核由来の in vitro転写系の開発2008

    • 著者名/発表者名
      岩田 真也, 杉浦 昌弘, 湯川 泰
    • 学会等名
      日本遺伝学会第80回大会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2008-09-05

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公開日: 2010-06-11   更新日: 2016-04-21  

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