修飾キラル分子であるアミノ酸のアラニンのラセミ混合物を吸着させると、D体とL体の領域に分離するという興味深いSTM像が観測された。しかし、D体、L体、あるいはラセミ体とも個々の分子は、アミノ基のN原子とカルボキシル基の2つの0原子で表面原子と吸着することが反射赤外吸収分光法で明らかになった。ごのため、アラニンのキラルな自己組織化構造の形成を昇温によって安定性を比較すると、分解生成物であるCO2の脱離スペクトルから、D体、L体、異なるキラル吸着状態間のエネルギーに違いが現れた。これは、異なるキラル分子間の水素結合の安定性が異なることと、表面原子の周期配列による下地原子の歪みに関わることが吸着構造の解析から示唆された。
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