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2008 年度 実績報告書

プロテオミクス基盤技術としてのオンチップ無細胞遺伝子工学創成

研究課題

研究課題/領域番号 20550148
研究機関東京大学

研究代表者

野島 高彦  東京大学, 生産技術研究所, 助教 (00291930)

キーワード遺伝子 / DNA / 遺伝子工学 / マイクロ流体チップ / PCR / GFP / 蛍光イメージング / キャピラリ-電気泳動
研究概要

特定蛋白質の遺伝子をコードしたDNA分子に塩基配列改変操作を施し,この遺伝情報を蛋白質に変換するまでの一連の流れを,バクテリアなどの生細胞の助けを一切借りることなく全て細胞外で達成する手法を確立することが本研究課題の目標である.そのために生体高分子の選択的操作技術に,適切な酵素反応を組み合わせることによって,生細胞を用いることなく従来の遺伝子工学と同様の操作を達成することをめざしている.そして,この手法をマイクロ流体チップを用いて達成し,プロテオミクス研究領域における応用を視野に入れた基盤技術としてのオンチップ無細胞遺伝子工学という概念の創成にとりくんでいる.今年度は,2種類の異なる配列のDNA分子種をDNA連結酵素により連結して得られるDNA混合物に対してポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を行い,この反応における主生成物をオンチップキャピラリー電気泳動で分離し,再度PCRで増幅することによって,無細胞蛋白質合成系用の鋳型を無細胞的に調製する手法を確立した.モデル遺伝子としては緑色蛍光蛋白質(GFP)の変異体をコードしたものを用いることにより,最終的な実験結果を蛍光イメージングする方法を採用した.ここでは初期条件として1,000塩基対程度のDNA分子を分離する条件に最適化されていたキャピラリー電気泳動のものを用いたが,これにもとづきキャピラリー流路内の充填剤および緩衝溶液に関して種々の比較検討を行うことによって,DNA分子鎖長のレンジを広げることができた.

  • 研究成果

    (11件)

すべて 2008

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (8件)

  • [雑誌論文] Cell-free protein synthesis conducted by template DNA with repetitive sequence2008

    • 著者名/発表者名
      Takahiko Nojima, Hiroshi Kimura and Teruo Fujii
    • 雑誌名

      Chemistry Letters 37

      ページ: 648-649

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Polymerase chain reaction-based molecular logic gate coupled with cell-free transcription-translation as a reporter2008

    • 著者名/発表者名
      Takahiko Nojima, Takatoki Yamamoto, Hiroshi Kimura and Teruo Fujii
    • 雑誌名

      Chemical Communications 2008

      ページ: 3771-3773

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Millisecond denaturation dynamics of fluorescent proteins revealed by femtoliter container on micro-thermodevice2008

    • 著者名/発表者名
      Hideyuki F. Arata, Frederic Gillot, Takahiko Nojima, Teruo Fujii and Hiroyuki Fujita
    • 雑誌名

      Lab on a Chip 8

      ページ: 1436-1440

    • 査読あり
  • [学会発表] Fluorescent green logic2008

    • 著者名/発表者名
      野島高彦,山本貴富喜,木村啓志,藤井輝夫
    • 学会等名
      第11回生命化学研究会〜生命化学をシステムで捉えたら〜
    • 発表場所
      水上館
    • 年月日
      20081128-1129
  • [学会発表] オンデマンド型微量液滴ハンドリングデバイスによるPNAプローブ法を用いたDNA一塩基置換検出の高速化2008

    • 著者名/発表者名
      金田祥平,野島高彦,山本貴富喜,藤井輝夫
    • 学会等名
      第25回「センサ・マイクロマシンと応用システム」シンポジウム
    • 発表場所
      宜野湾市沖縄コンベンションセンター
    • 年月日
      20081022-1024
  • [学会発表] A droplet on demand microfluidic device for detecting DNA single base substitution using PNA probe2008

    • 著者名/発表者名
      Shohei Kaneda, Takahiko Nojima, Takatoki Yakamoto, Teruo Fujii
    • 学会等名
      The 12th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences
    • 発表場所
      San diego, California, USA
    • 年月日
      20081012-1016
  • [学会発表] 同一遺伝子を繰り返しコードした鋳型DNAからの無細胞蛋白質合成2008

    • 著者名/発表者名
      野島高彦,木村啓志,藤井輝夫
    • 学会等名
      第57回高分子討論会
    • 発表場所
      大阪市立大学
    • 年月日
      20080924-0926
  • [学会発表] PCRに基づく生化学ロジックゲート2008

    • 著者名/発表者名
      野島高彦
    • 学会等名
      第3回バイオ関連化学合同シンポジウム
    • 発表場所
      東京工業大学すずかけ台キャンパス
    • 年月日
      20080918-20080920
  • [学会発表] オンデマンド型液滴ハンドリングデバイスによるPNAプローブ法を用いたDNAの-塩基置換検出2008

    • 著者名/発表者名
      金田祥平,野島高彦,山本貴富喜,藤井輝夫
    • 学会等名
      第17回化学とマイクロ・ナノシステム研究会(17th CHEMINAS)
    • 発表場所
      九州大学馬出キャンパス
    • 年月日
      20080520-0521
  • [学会発表] DNA増幅と遺伝子発現にもとつくロジックゲート構築のこころみ2008

    • 著者名/発表者名
      野島高彦,山本貴富喜,木村啓志,藤井輝夫
    • 学会等名
      第17回化学とマイクロ・ナノシステム研究会
    • 発表場所
      九州大学馬出キャンパス
    • 年月日
      20080520-0521
  • [学会発表] 微量液滴ハンドリングデバイスによるPNAプローブ法とRFLP法を用いたDNA-塩基検出2008

    • 著者名/発表者名
      金田祥平,野島高彦,山本貴富喜,藤井輝夫
    • 学会等名
      東京大学生命科学研究ネットワークシンポジウム2008「生命科学の広がりにむけて」
    • 発表場所
      東京大学安田講堂/工学部2号館
    • 年月日
      2008-09-23

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公開日: 2010-06-11   更新日: 2016-04-21  

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