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2009 年度 実績報告書

放射光真空紫外円二色性による生体分子の高次元構造解析

研究課題

研究課題/領域番号 20550153
研究機関広島大学

研究代表者

月向 邦彦  広島大学, 大学院・理学研究科, 特任教授 (10023467)

研究分担者 大前 英司  広島大学, 大学院・理学研究科, 助教 (30284152)
キーワード放射光 / 真空紫外円二色性 / タンパク質 / 二次構造解析 / ニューラルネットワーク法 / 糖類
研究概要

広島大学放射光科学研究センターの真空紫外円二色性(VUVCD)分散計を用い、以下の4点について研究した。[1]ジスルフィド結合欠損蛋白質の網羅的二次構造解析:4本のジスルフィド結合を順次欠損した13種のリゾチーム変異体のVUVCDスペクトルを170nmまで測定し、VUVCD-NN法を用いてα-ヘリックスとβ-ストランドの保存状態を解析し、立体構造保持における各ジスルフィド結合の役割を明らかにするとともに、アミロイド形成に関わるβ-ストランドの部位を予測した。[2]多糖類(グリコサミノグリカン)のVUVCDスペクトル解析:コンドロイチン、コンドロイチン硫酸(A, B, C)、ヒアルロン酸、ヘパリンおよびそれらの構成糖のVUVCDスペクトルを160nmまで測定し、COOH, SO_3H, OH, CH_2OH, NHCOCH_3基などの寄与を解析した。[3]酸性糖タンパク質α_1-acid glycoprotein (AGP)の二次構造:AGPはリン脂質との相互作用により、α-ヘリックスは14%(3本)から50%(8本)に、β-ストランドは38%(8本)から5.6%(2本)へと変化し、大きな二次構造変化が誘起されることがわかった。これらの構造変化は主としてリガンド結合部位で起こっており、蛋白質-生体膜相互作用による薬剤の細胞内輸送の機構について重要な知見が得られた。[4]β_2-microglobulinのアミロイドフィブリルの構造解析:赤外・ラマンスペクトルとVUVCDスペクトルを併用することにより、アミロイドフィブリルのlong straight型とworm-like型の2つの構造の違いが,カルボキシル基の解離状態に起因することを明らかにした。
これらの結果は、VUVCD分光法が生体分子の構造解析に有効であることを示している。

  • 研究成果

    (22件)

すべて 2010 2009

すべて 雑誌論文 (11件) (うち査読あり 9件) 学会発表 (11件)

  • [雑誌論文] Differences in the molecular structure of β_2-microglobulin between two morphologically different amyloid fibrils2010

    • 著者名/発表者名
      Hirotsugu Hiramatsu
    • 雑誌名

      Biochemistry 49

      ページ: 742-751

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Coupling effects of distal loops on structural stability and enzymatic activity of Escherichia coli dihydrofolate reductase revealed by deletion mutants2010

    • 著者名/発表者名
      Yuji Horiuchi
    • 雑誌名

      Biochim.Biophys.Acta 1804

      ページ: 846-855

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cloning and characterization of dihydrofolate reductases from deep-sea bacteria2010

    • 著者名/発表者名
      Chiho Murakami
    • 雑誌名

      J.Biochem. 147

      ページ: 591-599

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Membrane-induced conformational change of α_1-acid glycoprotein characterized by vacuum-ultraviolet circular dichroism spectroscopy2010

    • 著者名/発表者名
      Koichi Matsuo
    • 雑誌名

      HiSOR Activity Report 2008

      ページ: 13-17

  • [雑誌論文] Vacuum-ultraviolet circular dichroism of α-D-glucopyranoside investigated by time-dependent density functional theory2010

    • 著者名/発表者名
      Koichi Matsuo
    • 雑誌名

      HiSOR Activity Report 2008

      ページ: 18-19

  • [雑誌論文] Vacuum-ultraviolet circular dichroism analysis of glycosaminoglycans by synchrotron-radiation spectroscopy2009

    • 著者名/発表者名
      Koichi Matsuo
    • 雑誌名

      Biosci.Biotech.Biochem. 73

      ページ: 557-561

    • 査読あり
  • [雑誌論文] A novel vanadium reductase, Vanabin2, forms a possible cascade involved in electron transfer2009

    • 著者名/発表者名
      Norifumi Kawakami
    • 雑誌名

      Biochim.Biophys.Acta 1794

      ページ: 674-679

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Comprehensive secondary-structure analysis of disulfide variants of lysozyme by synchrotron-radiation vacuum-ultraviolet circular dichroism2009

    • 著者名/発表者名
      Koichi Matsuo
    • 雑誌名

      Proteins 77

      ページ: 191-201

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Characterization of vanadium-binding sites of the vanadium-binding protein Vanabin2 by site-directed mutagenesis2009

    • 著者名/発表者名
      Tatsuya Ueki
    • 雑誌名

      Biochim.Biophys.Acta 1790

      ページ: 1327-1333

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Pressure dependcnce of the apparent specific volume of bovine serum albumin : Insight into the difference between isothermal and adiabatic compressibilities2009

    • 著者名/発表者名
      Kunihiko Gekko
    • 雑誌名

      Biophys.Chem. 144

      ページ: 67-71

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Membrane-induced conformational change of α_1-acid glycoprotein characterized by vacuum-ultraviolet circular dichroism spectroscopy2009

    • 著者名/発表者名
      Koichi Matsuo
    • 雑誌名

      Biochemistry 48

      ページ: 9103-9111

    • 査読あり
  • [学会発表] Analysis of protein solution structures using synchrotron-radiation circular dichroism and application to medical fields2010

    • 著者名/発表者名
      松尾光一
    • 学会等名
      Hiroshima International Workshop on Synchrotron Radiation Circular Dichroism Spectroscopy
    • 発表場所
      東広島市
    • 年月日
      2010-03-05
  • [学会発表] What are the problems in future extension of SRCD?2010

    • 著者名/発表者名
      Kunihiko Gekko
    • 学会等名
      Hiroshima International Workshop on Synchrotron Radiation Circular Dichroism Spectroscopy
    • 発表場所
      東広島市
    • 年月日
      2010-03-05
  • [学会発表] Analysis of protein solution structure using synchrotron-radiation vacuum-ultraviolet circular dichroism at HiSOR2010

    • 著者名/発表者名
      松尾光一
    • 学会等名
      14^<th> Hiroshima International Symposium on Synchrotron Radiation
    • 発表場所
      東広島市
    • 年月日
      2010-03-04
  • [学会発表] 放射光真空紫外円二色性分光による水中における糖類の構造解析2010

    • 著者名/発表者名
      松尾光一
    • 学会等名
      第23回日本放射光学会年会
    • 発表場所
      姫路市
    • 年月日
      2010-01-08
  • [学会発表] Theoretical analysis of vacuum-ultraviolet CD spectrum of amyloid fibril formed by β_2-microglobulin fragment2009

    • 著者名/発表者名
      松尾光一
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島市
    • 年月日
      2009-10-08
  • [学会発表] Vacuum-ultraviolet circular dichroism spectrophotometer using synchrotron radiation at HiSOR2009

    • 著者名/発表者名
      松尾光一
    • 学会等名
      10th International Conference on Synchrotron Radiation Instrumentation
    • 発表場所
      Australia, Melbourne
    • 年月日
      2009-10-01
  • [学会発表] 放射光真空紫外円二色性分光法による糖類の構造解析2009

    • 著者名/発表者名
      月向邦彦
    • 学会等名
      第29回日本糖質科学会年会
    • 発表場所
      高山市
    • 年月日
      2009-09-09
  • [学会発表] Membrane-induced conformational change of α_1-acid glycoprotein characterized by vacuum-ultraviolet circular dichroism spectroscopy2009

    • 著者名/発表者名
      松尾光一
    • 学会等名
      12th International Conference on Circular Dichroism
    • 発表場所
      Italy, Brescia
    • 年月日
      2009-09-03
  • [学会発表] Secondary-structure analysis of proteins by vacuum-ultraviolet circular dichroism spectroscopy2009

    • 著者名/発表者名
      松尾光一
    • 学会等名
      Hokkaido University Mahidol University Joint Symposium
    • 発表場所
      北海道
    • 年月日
      2009-05-13
  • [学会発表] Membrane-induced conformational change of α_1-acid glycoprotein characterized by vacuum- ultraviolet circular dichroism spectroscpy2009

    • 著者名/発表者名
      松尾光一
    • 学会等名
      The 2^<nd> International Workshop on Synchrotron Radiation Circular Dichroism
    • 発表場所
      中国・北京
    • 年月日
      2009-04-07
  • [学会発表] Recent progress of VUVCD spectroscopy at HiSOR2009

    • 著者名/発表者名
      Kunihiko Gekko
    • 学会等名
      The 2^<nd> International Workshop on Synchrotron Radiation Circular Dichroism
    • 発表場所
      中国・北京
    • 年月日
      2009-04-07

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公開日: 2011-06-16   更新日: 2016-04-21  

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