• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 課題ページに戻る

2009 年度 実績報告書

DNAの磁気泳動分離

研究課題

研究課題/領域番号 20560044
研究機関横浜国立大学

研究代表者

山本 勲  横浜国立大学, 大学院・工学研究院, 准教授 (40242383)

キーワードDNA / 磁気分離 / 強磁場 / 電気泳動 / 磁気力 / 磁場配向
研究概要

(1)磁気力泳動:静電引力に比較して比較的弱い磁気力をDNA泳動パターンに顕在化させるには支持体ゲルの濃度が低い方が有利であることをつきとめた。この知見により、0.25wt.%アガロースゲルを支持体として採用し、96時間の磁気力泳動を5℃のTAEバッファーを用いて試みた。結果として、B=6.4T,|B(dB/dz)|=420T^2m^<-1>では泳動せず、B=9.1T,|B(dB/dz)|=583T^2m^<-1>では1kb~15kbのサイズのDNAが分離せずに3mm程度泳動することを見出した。5T以上で配向が飽和していると考えられるので、磁気力DNA泳動について磁気力場の閾値が存在し、その値は500T^2m^<-1>程度であると考えられる。
(2)磁場配向:磁場中でのDNAの速度変化は磁気力とDNAの磁場による配向による。磁場中での磁場配向の様子を計算機シミュレーションで評価した。試料回転による一軸配向の様子を調査した結果、条件を選べば低回転速度でも容易に磁場配向することを明らかにした。
(3)電気磁気泳動:ローレンツ力効果を顕在化させる泳動電圧閾値が存在することを利用して、電気磁気泳動における磁気力によるDNAの軌道の変化を追求した。具体的には、弱い横電場(E=870Vm^<-1>)と強い横磁場(|B(dB/dz)|=583T^2m^<-1>,B=9.1T)が直交する場を用いて、鉛直方向にかかるローレンツ力によるDNA泳動を無視できる条件で電気磁気泳動を行った。1kb~15kbのサイズのDNAを5℃で50分間泳動した結果、大サイズのDNAほど軌道変化が大きく、磁気力のかかる方向へtanθ=0.11~0.28の軌道変化を観測した。磁場勾配による磁気力とローレンツ力を分離して観測する手段を確立した。
(4)異形状DNAの分離:これまで用いてきた2本鎖直鎖状(2重螺旋)DNAと、一本鎖直鎖状DNA(M13mp18,7249bp)、プラスミド環状2本鎖DNA(pUC18,2686bp)の分離を試みた。一本鎖DNAは5kbの、プラスミドは2kbの2本鎖DNAと同じ泳動速度を示す。電場と磁場が直交する場で泳動を行ったところ、明確な分離は得られなかった。しかしながらDNAの蛍光分布に偏りを認めたことにより、今後の発展が期待できる。

  • 研究成果

    (11件)

すべて 2010 2009

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (9件)

  • [雑誌論文] Rotational Diffusion Model of 2-Dimensional Magnetic Alignment2009

    • 著者名/発表者名
      M.Yamaguchi
    • 雑誌名

      J.Phys : Conference series 156

      ページ: 12007-12009

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Rotational diffusion model of magnetic alignment2009

    • 著者名/発表者名
      M.Yamaguchi
    • 雑誌名

      Jpn.J.Appl.Phys. 48

      ページ: 63001-63007

    • 査読あり
  • [学会発表] 磁気力を用いたDNA泳動2010

    • 著者名/発表者名
      小澤瞬、黒坂大希、田中千晴、山本勲、高増正
    • 学会等名
      第57回応用物理学関係連合講演会
    • 発表場所
      東海大
    • 年月日
      2010-03-17
  • [学会発表] 高磁場を用いたDNA電気泳動2010

    • 著者名/発表者名
      山本勲、黒坂大希、田中千晴、小澤瞬、高増正
    • 学会等名
      第57回応用物理学関係連合講演会
    • 発表場所
      東海大
    • 年月日
      2010-03-17
  • [学会発表] Kinetics of Magnetic Alignment in Rotating Fields Studied by Rotational Duffusion Model2009

    • 著者名/発表者名
      山口益弘
    • 学会等名
      3rd Int.Conf.Magneto Science (ICMS 2009)
    • 発表場所
      Nijmegen, Netherland
    • 年月日
      2009-11-29
  • [学会発表] DNA Electroromagneticphoresis under the Condition of B//E2009

    • 著者名/発表者名
      小澤瞬
    • 学会等名
      3rd Int.Conf.Magneto Science (ICMS 2009)
    • 発表場所
      Nijmegen, Netherland
    • 年月日
      2009-11-27
  • [学会発表] 磁場中電気泳動におけるローレンツ力効果II2009

    • 著者名/発表者名
      黒坂大希、小澤瞬,田中千晴,山本勲
    • 学会等名
      第4回磁気科学会年次大会
    • 発表場所
      信州大
    • 年月日
      2009-11-13
  • [学会発表] 勾配磁場中におけるDNA磁気泳動2009

    • 著者名/発表者名
      小澤瞬、黒坂大希,田中千晴,山本勲,高増正
    • 学会等名
      第4回磁気科学会年次大会
    • 発表場所
      信州大
    • 年月日
      2009-11-13
  • [学会発表] 回転磁場による磁気配向の動的挙動2009

    • 著者名/発表者名
      山口益弘、小澤瞬、山本勲
    • 学会等名
      第4回磁気科学会年次大会
    • 発表場所
      信州大
    • 年月日
      2009-11-13
  • [学会発表] Magnetic Alignment with and without Diffusion2009

    • 著者名/発表者名
      Masuhiro Yamaguchi, Shun Ozawa and Isao Yamamoto
    • 学会等名
      日本学術振興会アジア研究教育拠点事業「材料電磁プロセシングの世界拠点の構築」オープンクラスタ講演会
    • 発表場所
      名古屋大
    • 年月日
      2009-09-18
  • [学会発表] 磁場中DNA電気泳動におけるローレンツ力効果II2009

    • 著者名/発表者名
      黒坂大希、小澤瞬、田中千晴、山本勲
    • 学会等名
      第70回応用物理学会学術講演会
    • 発表場所
      富山大
    • 年月日
      2009-09-09

URL: 

公開日: 2011-06-16   更新日: 2016-04-21  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi