時計遺伝子の変異様式と光周性との相関の抽出と応用

2010 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 20570002
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 遺伝・ゲノム動態
• 研究機関: 名古屋大学
• 研究代表者: 小内 清 名古屋大学, 遺伝子実験施設, 研究員 (00402454)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2010
• キーワード: 生物時計 / 概日リズム / 生物発光

研究概要

生物時計は高等植物において光周的花成を制御している。本研究では、シロイヌナズナにおいて発見した高等植物の時計遺伝子PHYTOCLOCK1(PCL1)のイネにおけるオーソログOsPCL1に突然変異をもつ変異体を分離して、光周的花成や概日遺伝子発現を調査することを目的とした。OsPCL1の突然変異体を、約3,600系統のイネのEMS系統の中からTILLING法によってスクリーニングし、7個の変異体を分離した。そして、分離したこれらのOsPCL1変異体の表現型を調査した。

研究成果

• [雑誌論文] Plasma membrane aquaporin agpZ is essential for glucose metabolism during photomixotrophic growth of Synechocysiis sp. PCC 6803. (2011)
  • 著者名/発表者名: Akai M, Onai K, Kusano M, Sato M, Redestig H, Toyooka K, Morishita M, Miyake H, Hazama A, Checchetto V, Szabo I, Matsuoka K, Saito K, Yasui M, Ishiura M, Uozumi N
  • 雑誌名: in press
  • 査読あり
• [雑誌論文] 生物発光リアルタイム測定解析システム=有用生物株や有用遺伝子の網羅的な高速探索のための新システム= (2011)
  • 著者名/発表者名: 小内清、石浦正寛
  • 雑誌名: 光アライアンス「特集:生物フォトン研究の最前線」 3月号 ページ: 20-26
• [雑誌論文] 生物発光リアルタイム測定システムの歴史と展望～生物発光からゲノム学・生物物理学への潮流～ (2010)
  • 著者名/発表者名: 小内清、石浦正寛
  • 雑誌名: 生物物理 50 ページ: 141-145
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functionally important structural elements of the cyanobacterial clock-related protein Pex. (2009)
  • 著者名/発表者名: Kurosawa S, Murakami R, Onai K(共著第一著者), Morishita M, Hasagawa D, Iwase R, Uzumaki T, Hyashi F,Kitajima-Ihara T, Sakata S, Mrakami M, Kouyama T, Ishiura M
  • 雑誌名: Genes Cells 14 ページ: 1-16
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification and characterization of the Na+/H+ antiportere NhaS3 from the thylakoid mambrane of Synechocystis sp.PCC 6803. (2009)
  • 著者名/発表者名: Tsunekawa K, Shijyuku T, Hayashimoto M, Kojima Y, Onai K, Morishita M, Ishiura M, Kuroda T, Nakamura T, Kobayashi H, Sato M, Toyooka K, Matsuoka K, Omata T, Uozumi N
  • 雑誌名: J Biol Chem 284 ページ: 16513-16521
  • 査読あり
• [雑誌論文] 非接触、サンプリング不要の細胞濃度・増殖速度リアルタイム計測システム (2009)
  • 著者名/発表者名: 石浦正寛、小内清
  • 雑誌名: 中部TLOニュース No.9 ページ: 5
• [雑誌論文] A systematic forward genetic analysis identified components of the Chlamydomonas circadian system. (2008)
  • 著者名/発表者名: Matsuo T, Okamoto K, Onai K, Niwa Y, Shimogawara K, Ishiura M
  • 雑誌名: Genes Dev 22 ページ: 918-930
  • 査読あり
• [学会発表] シロイヌナズナHSI2サブファミリーB3因子による種子成熟プログラム抑制機構 (2011)
  • 著者名/発表者名: 鵜飼聖子、河合都妙、近藤有里、前尾健一郎、小内清、石浦正寛、中村研三
  • 学会等名: 第52回日本植物生理学会年会(仙台)
  • 発表場所: 紀要のみ(3pCO7(615))
  • 年月日: 20110300
• [学会発表] 生物発光リアルタイム測定解析システムを使ったシロイヌナズナの油脂合成制御変異株の網羅的スクリーニング (2011)
  • 著者名/発表者名: 河合都妙、小内清、鈴木孝征、前尾健一郎、石浦正寛、中村研三
  • 学会等名: 第52回日本植物生理学会年会(仙台)
  • 発表場所: 紀要のみ
  • 年月日: 20110300
• [学会発表] 単細胞緑藻クラミドモナスにおける時計遺伝子生物発光レポーター株の発光リズムから見えるもの (2011)
  • 著者名/発表者名: 丹羽由実、松尾拓哉、立川誠、小内清、石浦正寛
  • 学会等名: 第52回日本植物生理学会年会(仙台)
  • 発表場所: 紀要のみ(PFO54(736))
  • 年月日: 20110300
• [学会発表] Large scale screening of Arabidopsis mutants in seed oil synthesis by using a high-throughput real-time bioluminescence monitoring system. (2011)
  • 著者名/発表者名: Kawai T, Onai K, Hashimoto M, Mace K, Nakamura, Nakamura K
  • 学会等名: 2nd Gordon Research Conference on "Plant Lipids, Structure, Metabolism & Function" (GRC on Plant Lipids)
  • 発表場所: Hotel Galvez, Galveston.Texas.USA
  • 年月日: 20110130-20110204
• [学会発表] 生物発光リアルタイム測定解析システムによるシロイヌナズナの油脂合成制御因子の網羅的探索 (2010)
  • 著者名/発表者名: 河合都妙、小内清、松本貴幸、石浦正寛、前尾健一郎、中村研三
  • 学会等名: 第23回植物脂質シンポジウム
  • 発表場所: 京都大学宇治キャンパスきはだホール、宇治(ポスター発表)
  • 年月日: 20101126-20101127
• [学会発表] Systematic identification of circadian clock components in the unicellular green alga Chlamydomonas reinhardtii. (2010)
  • 著者名/発表者名: Matsuo T, Okamoto K, Onai K, Niwa Y, Shimogawara K, Ishiura M
  • 学会等名: 第4回GCOEリトリート
  • 発表場所: 豊橋日航ホテル(豊橋市)(ポスター発表)
  • 年月日: 20100913-20100914
• [学会発表] The circadian rhythms of bioluminescence reporters for clock genes in Chlamydomonas reinhardtii. (2010)
  • 著者名/発表者名: 丹羽由実、松尾拓哉、立川誠、小内清、石浦正寛
  • 学会等名: 第4回GCOEリトリート
  • 発表場所: 豊橋日航ホテル(豊橋市)(ポスター発表)
  • 年月日: 20100913-20100914
• [学会発表] Isolation of Arabidopsis mutants in the expression of a gene for oil synthesis by using high-throughput real-time bioluminescence monitoring system. (2010)
  • 著者名/発表者名: Kawai T, Onai K, Matsumoto T, Maeo K, Maeo K, Ishiura M, Nakamura K
  • 学会等名: VII Congress of the Federation of European Societies of Plant Biology (FESPB 2010)
  • 発表場所: Valencia Convention Center, Valencia, Spain
  • 年月日: 20100704-20100709
• [学会発表] Large-scale screening of Arabidopsis mutants in the expression of a gene for seed oil synthesis by high-throughput real-time bioluminescence monitoring system. (2010)
  • 著者名/発表者名: Kawai T, Onai K, Matsumoto T, Hashimoto M, Maeo K, Ishiura M, Nakamura K
  • 学会等名: 21st International Conference on Arabidopsis Research
  • 発表場所: Pacifico Yokohama, Yokohama
  • 年月日: 20100606-20100610
• [学会発表] LUCレポーター遺伝子を用いたシロイヌナズナ油脂合成系遺伝子発現制御因子の探索 (2010)
  • 著者名/発表者名: 河合都妙、橋本実佳、小内清、石浦正寛、前尾健一郎、中村研三
  • 学会等名: 第52回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 熊本大学黒髪北キャンパス、熊本(ポスター発表)
  • 年月日: 20100318-20100319
• [学会発表] Real-time bioluminescence monitoring system. (2010)
  • 著者名/発表者名: Onai K, Ishiura M
  • 学会等名: PITTCON 2011
  • 発表場所: Orlando, Florida(展示発表)
  • 年月日: 20100228-20100305
• [学会発表] 生物発光リアルタイム測定解析システム (2010)
  • 著者名/発表者名: 小内清、石浦正寛
  • 学会等名: 第3回名古屋大学医学・バイオ系知財フェア
  • 発表場所: 名古屋大学医学部、名古屋(ボスター発表)
  • 年月日: 2010-12-17
• [学会発表] クラミドモナスの時計遺伝子生物発光レポーター株の作製およびその特徴 (2010)
  • 著者名/発表者名: 丹羽巾実、松尾拓哉、立川誠、小内清、石浦正寛
  • 学会等名: 第8回クラミドモナスワークショップ
  • 発表場所: 東京大学理学部、東京、ポスター発表
  • 年月日: 2010-12-12
• [学会発表] 生物発光リアルタイム測定解析システム-有用生物株や有用遺伝子の網羅的な高速探索のための新システムの開発- (2010)
  • 著者名/発表者名: 小内清、大久保充宏、長谷川寛、中村隆司、神谷聡、白木央、石浦正寛
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会(BMB2010)
  • 発表場所: 神戸国際展示場、神戸(ポスター発表)
  • 年月日: 2010-12-08
• [学会発表] 生物発光リアルタイム測定解析システムによるシロイヌナズナの油脂合成制御因子の網羅的探索 (2010)
  • 著者名/発表者名: 河合都妙、小内清、橋本実佳、松本貴幸、前尾健一郎、石浦正寛、中村研三
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合1司大会(BMB2010)
  • 発表場所: 神戸国際展示場、神戸(ポスター発表)
  • 年月日: 2010-12-08
• [学会発表] 生物発光リアルタイム測定解析システム-有用生物株や有用遺伝子の網羅的な高速探索のための新システムの開発 (2010)
  • 著者名/発表者名: 小内清、大久保充宏、長谷川寛、中村隆司、神谷聡、白木央、石浦正寛
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会(BMB2010)
  • 発表場所: 神戸国際展示場、神戸(口頭発表)
  • 年月日: 2010-12-07
• [学会発表] 単細胞緑藻クラミドモナスにおける時計遺伝子生物発光レポーター株の作製 (2010)
  • 著者名/発表者名: 丹羽巾実、松尾拓哉、立川誠、小内清、石浦正寛
  • 学会等名: 第82回日本遺伝学会年会
  • 発表場所: 北海道大学理学部、札幌(口頭発表)
  • 年月日: 2010-09-21
• [学会発表] 生物発光リアルタイム測定解析システム-有用生物株や有用遺伝子の網羅的な高速探索のための新システムの開発-、科学技術交流財団「ハイスループソトスクリーニングシステムと次世代DNAシーケンサーの相乗的応用」 (2010)
  • 著者名/発表者名: 小内清、石浦正寛
  • 学会等名: 第1回研究会
  • 発表場所: 名古屋大学野依記念学術交流館、名古屋(招待講演)
  • 年月日: 2010-07-23
• [学会発表] 生物発光リアルタイム測定解析システムによる高等植物の油脂合成制御因子の網羅的探索、科学技術交流財団「ハイスループットスクリーニングシステムと次世代DNAシーケンサーの相乗的応用」 (2010)
  • 著者名/発表者名: 河合都妙、小内清、石浦正寛、中村研三
  • 学会等名: 第1回研究会
  • 発表場所: 名古屋大学野依記念学術交流館、名古屋(招待講演)
  • 年月日: 2010-07-23
• [学会発表] 単細胞緑藻クラミドモナスにおいてルシフェラーゼレポーターの概ロリズムは転写後に調節される (2010)
  • 著者名/発表者名: 丹羽由実、松尾拓哉、立川誠、小内清、石浦正寛
  • 学会等名: 第52回日本植物生理学会年会
  • 発表場所: 熊本大学黒髪北キャンパス、熊本(ポスター発表)
  • 年月日: 2010-03-19
• [学会発表] Real-time bioluminescence monitoring device for living plant. (2010)
  • 著者名/発表者名: Onai K, Ishiura M
  • 学会等名: NC-TECII 2011, Technology Showcase in RTP
  • 発表場所: North Carolina
  • 年月日: 2010-02-10
• [学会発表] 生物発光リアルタイム測定システム (2009)
  • 著者名/発表者名: 小内清、大久保充宏、中村隆司、長谷川寛、白木央、石浦止寛
  • 学会等名: 先端計測分析技術・機器開発事業5周年記念シンポジウム
  • 発表場所: 東京(展示発表)
  • 年月日: 20091208-20091209
• [学会発表] 生物発光リアルタイム測定システム-有用遺伝子の網羅的な超高速探索へ向けて- (2009)
  • 著者名/発表者名: 小内清、岡本和久、石浦止寛
  • 学会等名: 第7回クラミドモナスワークショップ
  • 発表場所: 名古屋大学野依記念学術交流館、名古屋(招待講演)
  • 年月日: 20090325-20090326
• [学会発表] クラミドモナス核遺伝子生物発光レポーターの開発 (2009)
  • 著者名/発表者名: 立川誠、松尾拓哉、丹羽由実、小内清、石浦正寛
  • 学会等名: 第7回クラミドモナスワークショップ
  • 発表場所: 名古屋大学野依記念学術交流館、名古屋(ポスター発表)
  • 年月日: 20090325-20090326
• [学会発表] 単細胞クラミドモナスにおいてルシフェラーゼレポーターの概日リズムは転写後に調節される (2009)
  • 著者名/発表者名: 丹羽由実、松尾拓哉、立川誠、小内清、石浦正寛
  • 学会等名: 日本植物生理学会第50回大会
  • 発表場所: 名古屋大学IB電子情報館、名古屋(口頭発表)
  • 年月日: 20090321-20090324
• [学会発表] 単細胞緑藻クラミドモナスにおける時計遺伝子生物発光レポーター株の作製 (2009)
  • 著者名/発表者名: 丹羽由実、松尾拓哉、立川誠、小内清、石浦正寛
  • 学会等名: 第81回日本遺伝学会年会
  • 発表場所: 信州大学理学部、松本(口頭発表)
  • 年月日: 2009-09-18
• [学会発表] 生物発光リアルタイム測定システム-大規模測定と高感度測定のための次世代システムの開発- (2009)
  • 著者名/発表者名: 小内清、大久保充宏、岡本和久、長谷川寛、太田武司、伊藤英樹、川角康之、中村隆司、森下めぐみ、西本治美、松尾拓哉、上池伸徳、白木央、石浦止寛
  • 学会等名: 日本遺伝学会第81回大会
  • 発表場所: 信州大学理学部、松本(口頭発表)
  • 年月日: 2009-09-18
• [学会発表] 生物発光リアルタイム測定システムの開発と応用-有用遺伝子の網羅的な超高速探索へ向けて- (2009)
  • 著者名/発表者名: 小内清、石浦正寛
  • 学会等名: (財)岩手生物工学研究センター第154回公開セミナー
  • 発表場所: (財)岩手生物工学研究センター、北上市(招待講演)
  • 年月日: 2009-07-13
• [学会発表] Synechocystissp. strainPCC6803は生物時計タンパク質KaiA、KaiBおよびKaiCに加え、KaiBおよびKaiCホモログを2つずつ有している (2008)
  • 著者名/発表者名: 村上怜子、石井健太郎、小内清、森下めぐみ、石浦正寛
  • 学会等名: 第46回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 博多国際会議場、博多(ポスター発表)
  • 年月日: 20081203-20081205
• [学会発表] 時計タンパク質の核移行と核におけるリズム発振機能～単細胞緑藻クラミドモナスにおける時計遺伝子の網羅的同定～ (2008)
  • 著者名/発表者名: 松尾拓哉、岡本和久、小内清、丹羽由実、下河原浩介、石浦正寛
  • 学会等名: 特定領域研究「核ダイナミクス」班会議
  • 発表場所: 京都ガーデンパレス、京都(口頭発表)
  • 年月日: 20081027-20081029
• [学会発表] 生物発光リアルタイム測定システム (2008)
  • 著者名/発表者名: 小内清、石浦正寛
  • 学会等名: バイオジャパン2008
  • 発表場所: 横浜国際平和会議場(パシフィコ横浜)、横浜(ポスター発表)
  • 年月日: 20081015-20081017
• [学会発表] クラミドモナスにおける核遺伝子発光レポーター系の開発 (2008)
  • 著者名/発表者名: 立川誠、松尾拓哉、小内清、丹羽由実、石浦正寛
  • 学会等名: 日本遺伝学会第80回大会
  • 発表場所: 名古屋大学IB電子情報館、名古屋(口頭発表)
  • 年月日: 20080903-20080905
• [学会発表] 単細胞緑藻クラミドモナスの葉緑体リズム変異体における時計遺伝子のリズム (2008)
  • 著者名/発表者名: 丹羽由実、松尾拓哉、小内清、立川誠、石浦正寛
  • 学会等名: 日本遺伝学会第80回大会
  • 発表場所: 名古屋大学IB電子情報館、名古屋(口頭発表)
  • 年月日: 20080903-20080905
• [学会発表] 藍色細菌Synechocystissp. Strain PCC6803は生物時計たんぱく質KaiA、KaiBおよびKaiCに加え、KaiBホモログおよびKaiCホモログを2つずつ有している (2008)
  • 著者名/発表者名: 村上怜子、石井健太郎、小内清、森下めぐみ、石浦正寛
  • 学会等名: 日本遺伝学会第80回大会
  • 発表場所: 名古屋大学IB電子情報館、名古屋(口頭発表)
  • 年月日: 20080903-20080905
• [学会発表] 藍色細菌の生物時計関連タンパク質Pexの構造と機能の解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 村上怜子、黒澤俊介、小内清、森下めぐみ、宇津巻竜也、林史夫、岩瀬亮、武藤梨沙、佐藤洋志、長谷川大祐、神山勉、石浦正寛
  • 学会等名: 日本光合成研究会公開シンポジウム
  • 発表場所: 名古屋大学野依記念学術交流館、名古屋(ポスター発表)
  • 年月日: 20080530-20080531
• [学会発表] Systematic identification of circadian clock components in the Chlamydomonas reinhardtii. (2008)
  • 著者名/発表者名: Matsuo T, Okamoto K, Onai K, Niwa Y, Shimogawara K, Ishiura M
  • 学会等名: The 13th international Chlamydomonas conference
  • 発表場所: Hyeres-les-Palmiers, France(際会議招待講演)
  • 年月日: 20080527-20080601
• [学会発表] 生物発光リアルタイム測定システムの現状と展望-有用遺伝子の超高速探索へ向けて、名古屋大学遺伝子実験施設シンポジウム「新たなDNA解析-次世代DNA解析のすべてとDNA解析の新分野への展開-」 (2008)
  • 著者名/発表者名: 小内清、岡本和久、石浦正寛
  • 発表場所: 名古屋大学環境総合館、名古屋(招待講演)
  • 年月日: 2008-12-16
• [学会発表] 全ゲノム情報を利用した遺伝子タギング法による網羅的な遺伝子同定、名古屋大学遺伝子実験施設シンポジウム「新たなDNA解析-次世代DNA解析のすべてとDNA解析の新分野への展開-」 (2008)
  • 著者名/発表者名: 松尾拓哉、岡本和久、小内清、丹羽由美、下河原浩介、石浦正寛
  • 発表場所: 名古屋大学環境総合館、名古屋(招待講演)
  • 年月日: 2008-12-16
• [学会発表] 生物発光リアルタイム測定システム (2008)
  • 著者名/発表者名: 小内清、松尾拓哉、石浦正寛
  • 学会等名: 名古屋大学医学・バイオ系特許フェア
  • 発表場所: 名古屋大学医学部、名古屋(ポスター発表)
  • 年月日: 2008-11-21
• [学会発表] 緑藻の生物時計～クラミドモナスにおける時計遺伝子の網羅的同定 (2008)
  • 著者名/発表者名: 松尾拓哉、岡本和久、小内清、丹羽由美、下河原浩介、石浦正寛
  • 学会等名: 日本遺伝学会第80回大会ワークショップ
  • 発表場所: 名古屋大学IB電子情報館、名古屋(招待講演)
  • 年月日: 2008-09-05
• [学会発表] 藍色細菌Synechocystis sp.strain PCC6803のkai遺伝子の1幾能解析-kai遺伝子の進化と機能分担- (2008)
  • 著者名/発表者名: 小内清、森下めぐみ、岡本和久、石浦正寛
  • 学会等名: 日本遺伝学会第80回大会
  • 発表場所: 名古屋大学IB電子情報館、名古屋(口頭発表)
  • 年月日: 2008-09-05
• [学会発表] 生物発光リアルタイム測定システムの現状と課題、科学技術交流財団「光計測技術と生物発光リアルタイム測定システムの応用」 (2008)
  • 著者名/発表者名: 小内清、石浦正寛
  • 学会等名: 第1回研究会
  • 発表場所: 名古屋大学野依学術交流館、名古屋(招待講演)
  • 年月日: 2008-07-11
• [図書] Bacterial Circadian Programs(Circadian clocks of Synechocystis sp.strain PCC 6803, Thermosynechococcus elongates, Prochlorococcus spp., Tri chodesmi um spp.and other species.)(Ditty J.L.et al.eds.) (2009)
  • 著者名/発表者名: Aoki S, Onai K(共著第一著者)
  • 総ページ数: 259-282
  • 出版者: Springer-Verlag, Berlin Heidelberg
• [産業財産権] 測定処理を高速化した発光測定装置 (2010)
  • 発明者名: 小内清、石浦正寛、白木央、太田武司、大久保充宏、川角康之
  • 権利者名: 国立大学法人名古屋大学、中立電機株式会社
  • 産業財産権番号: 特許,特願2010-070074
  • 出願年月日: 2010-03-25
• [産業財産権] 高感度発光測定装置 (2010)
  • 発明者名: 小内清、石浦正寛、白木央、大久保充宏、伊藤英樹、中村隆司、長谷川寛
  • 権利者名: 国立大学法人名古屋大学
  • 産業財産権番号: 特許,特願2010-070075
  • 出願年月日: 2010-03-25
• [産業財産権] 分配装置、及び分配方法 (2010)
  • 発明者名: 小内清、石浦正寛、白木央、大久保充宏、神谷聡、八木良樹、岡悦男、戎晃司
  • 権利者名: 中立電機株式会社、椿本興業、マイクロニクス株式会社
  • 産業財産権番号: 特許,特願2010-095985
  • 出願年月日: 2010-04-19
• [産業財産権] 植物の種子油脂生産性を増大させる遺伝子及びその利用方法 (2010)
  • 発明者名: 中村研三、河合都妙、橋本実佳、石浦正寛、松田雅敏、小内清
  • 権利者名: トヨタ自動車株式会社、株式会社コンポン研究所、国立大学法人名古屋大学
  • 産業財産権番号: 特許,特願2010-054484
  • 出願年月日: 2010-03-11