分裂酵母を用いた細胞内局在化RNAのゲノムワイドスクリーニング

2010 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 20570005
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 遺伝・ゲノム動態
• 研究機関: 大妻女子大学 (2008, 2010); 大妻女子大学短期大学部 (2009)
• 研究代表者: 竹内 知子 (安東 知子) 大妻女子大学, 短期大学部・家政科, 准教授 (20294548)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2010
• キーワード: 分裂酵母 / RNA / 局在化

研究概要

分裂酵母を用い、新たに5,316個(累計6,520個)のランダムなRNAを可視化して観察し、細胞内で特異的な局在を示すRNAを探索した。その結果、核内にドット状に局在するRNA候補を25個、DNA領域特異的に局在するRNA候補を5個、核小体領域特異的に局在するRNA 候補を9個、新たに取得した。DNA領域に局在するRNAのうち2つについて調べたところ、それぞれ異なる局在化配列を有することが明らかとなった。またこれらのRNA配列が、遺伝子発現に影響を与える可能性が示唆された。

研究成果

• [雑誌論文] EGD1 (β-NAC) mRNA is localized in a novel cytoplasmic structure in Saccharomyces cerevisiae. (2011)
  • 著者名/発表者名: Sachiko Hayashi, Tomoko Andoh, Tokio Tani
  • 雑誌名: Genes Cells vol.16 ページ: 316-329
  • 査読あり
• [学会発表] 分裂酵母spo9^+の3'UTR内に存在する核内局在化(核係留)RNA配列の解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 渕田綾子
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
  • 年月日: 20101207-20101210
• [学会発表] 分裂酵母における核内局在化(核係留)RNA配列の同定と解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 渕田綾子
  • 学会等名: 第12回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 一橋記念講堂(東京都)
  • 年月日: 20100727-20100729
• [学会発表] 分裂酵母における細胞内局在化RNAの網羅的探索と解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 渕田綾子
  • 学会等名: RNAフロンティアミーティング2009
  • 発表場所: IPC生産性国際交流センター
  • 年月日: 20090926-20090928
• [学会発表] 分裂酵母における細胞内局在化RNAの網羅的探索と新規核内局在化non-coding RNAの解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 大庭沙耶歌
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2008-12-12
• [学会発表] 分裂酵母における網羅的な局在化RNAのスクリーニングと遺伝子発現調節機構の解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 大庭沙耶歌
  • 学会等名: 第60回日本細胞生物学会大会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2008-06-30
• [備考] ホームページ等
  • URL: http://www.paw.hi-ho.ne.jp/t-takeu/