網羅的遺伝子発現解析を用いたバクテリアの増殖再開メカニズムの解明

2010 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 20570006
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 遺伝・ゲノム動態
• 研究機関: 大阪医科大学
• 研究代表者: 牧 泰史 大阪医科大学, 医学部, 講師 (60401733)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2010
• キーワード: 細菌 / マイクロアレイ / 増殖

研究概要

バクテリアが増殖停止から増殖再開に至るメカニズムを解明することを目的として、様々な生育状態にある細胞を使ったmicroarray解析を進めた。研究には大腸菌をモデル生物として使用した。本研究の結果、増殖再開の初期に多くの遺伝子が発現していること、栄養環境の違いによって増殖停止期の適応状態が異なり、増殖再開期の遺伝子発現プロファイルも互いに違っていること、などが明らかとなった。

研究成果

• [雑誌論文] Structure of the 100S Ribosome in the Hibernation Stage Revealed by Electron Cryomicroscopy. (2010)
  • 著者名/発表者名: Takayuki Kato, Hideji Yoshida, Tomoko Miyata, Yasushi Maki, Akira Wada, Keiichi Namba
  • 雑誌名: Structure vol.18 ページ: 719-724
  • 査読あり
• [雑誌論文] Solution structure of the E. coli ribosome hibernation promoting factor HPF : Implications for the relationship between structure and function. (2009)
  • 著者名/発表者名: Akiko Sato, Takumi Watanabe, Yasushi Maki, Masami Ueta, Hideji Yoshida, Yutaka Ito, Akira Wada, Masaki Mishima
  • 雑誌名: Biochemical and Biophysical Research Communications vol.389 ページ: 580-585
  • 査読あり
• [雑誌論文] Role of HPF (Hibernation Promoting Factor) in Translational Activity in Escherichia coli. (2008)
  • 著者名/発表者名: Masami Ueta, Ryosuke L, Ohniwa, Hideji Yoshida, Yasushi Maki, Chieko Wada, Akira Wada
  • 雑誌名: Journal of Biochemistry vol.143 ページ: 425-433
• [学会発表] 大腸菌の栄養環境応答のトランスクリプトーム (2010)
  • 著者名/発表者名: 牧泰史
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(兵庫県)
  • 年月日: 20101207-20101210
• [学会発表] Transcriptome analysis of the Escherichia coli in the prolonged stationary phase and lag phase. (2010)
  • 著者名/発表者名: 牧泰史
  • 学会等名: The 11th Asian and Oceanian Conference on Transcription
  • 発表場所: Hotel Bel Paraiso (Okinawa, Japan)
  • 年月日: 20100701-20100705
• [学会発表] 大腸菌の栄養環境応答のトランスクリプトーム解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 牧泰史
  • 学会等名: 第4回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 九州大学医学部(福岡県)
  • 年月日: 20100307-20100309
• [備考] ホームページ等
  • URL: http://www.osaka-med.ac.jp/~yhide/