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ヨメナ属植物は、シオン属植物と比べて明らかに小さな染色体を持ち、その染色体サイズは約半分で、核型は相似的であることが示されている。これまでに、葉緑体DNAを使った分子系統解析と染色体による細胞遺伝学的解析により、ヨメナ属の小型染色体(Sタイプ)がシオン属の大型染色体(Lタイプ)よりも派生的であることが示されている。このことは、シオン属からヨメナ属への進化の過程で染色体サイズの減少がおこった事を示すものである。本研究では、本研究では、染色体サイズの減少がどのようにして生じたのかを明らかにするため、LタイプおよびSタイプのゲノムDNAを材料に、これら2属がもつ、異なるゲノム構成または染色体の進化について新たな知見を得るため、平成20年度は、九州および関東ならびに東北地域における自生地域調査を行い、調査によって得られた植物個体を栽培後、生きた個体から分裂組織をサンプリングし、SタイプおよびLタイプの特定を含めた細胞遺伝学的評価を行った。さらに、シロヨメナおよびユウガギクゲノムを用いたGISH、 DNAプロファイリングによるディファレンシャルディスプレイからLタイプとSタイプ染色体の間で異なる反復配列の検出を行った。またレトロトランスポゾン因子を増幅させるプライマーを用いた分散型反復配列およびサザン解析による両種ゲノムの配列の反復数について見積もり、さらに長鎖DNAを電気パルスにより導入するための準備を行った。
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