大腸菌染色体複製関連タンパク質における相互作用解析

2010 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 20570110
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 構造生物化学
• 研究機関: 九州大学
• 研究代表者: 阿部 義人 九州大学, 薬学研究院, 准教授 (60315091)
• 研究分担者: 片山 勉 (70264059)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2010
• キーワード: 分子認識および相互作用 / 複製 / NMR

研究概要

タンパク質には単体で機能するものもあるが、他のタンパク質と複合体を形成したり、相互作用することによって分子機能を持つものが多い。本研究では、そのような分子間相互作用が機能につながっていると考えられるCedA、HSPQ、PriB、PriC、DnaTなどの大腸菌染色体複製に関与する蛋白質の構造および相互作用をNMR解析および変異体解析を用いて調べ、その機能との相関を明らかにした。

研究成果

• [雑誌論文] Evidence for the binding of phosphate ion to the C-terminus region in A β 1-40 using heteronuclear NMR analyses (2010)
  • 著者名/発表者名: Nagata-Uchiyama M, Abe Y, Monji A, Kanba S, Ueda T
  • 雑誌名: Protein Peptide lett. 17 ページ: 176-180
  • 査読あり
• [雑誌論文] Effect of protein concentration and pH on the chitinase activity of Tapes japonica lysozyme (2010)
  • 著者名/発表者名: Goto T, Abe Y, Imoto T, Ueda T
  • 雑誌名: Protein Peptide lett. 17 ページ: 172-175
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structure of membrane domain of human erythrocyte anion exchanger 1 revealed by electron crystallography (2010)
  • 著者名/発表者名: Yamaguchi T, Ikeda Y, Abe Y, Kuma H, Kang D, Hamasaki N, Hirai T
  • 雑誌名: J. Mol. Biol. 397,1 ページ: 179-189
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mutation of His 834 in human anion exchanger 1 affects substrate binding (2010)
  • 著者名/発表者名: Takazaki S, Abe Y, Yamaguchi T, Yagi M, Ueda T, Kang D, Hamasaki N
  • 雑誌名: BBA -Biomembranes 1798,5 ページ: 903-908
  • 査読あり
• [雑誌論文] Evaluation of the conformational equilibrium of reduced hen egg lysozyme by antibodies to the native form (2010)
  • 著者名/発表者名: Oda M, Kitai A, Murakami A, Nishimura M, Ohkuri T, Abe Y, Ueda T, Nakamura H, Azuma T
  • 雑誌名: Arch Biochem Biophys 494,2 ページ: 145-150
  • 査読あり
• [雑誌論文] Helical image reconstruction of the outward-open human erythrocyte band 3 membrane domain in tubular crystals (2010)
  • 著者名/発表者名: Yamaguchi T, Fujii T, Abe Y, Hirai T, Kang D, Namba K, Hamasaki N, Mitsuoka K
  • 雑誌名: J. Struc. Biol. 169,3 ページ: 406-412
  • 査読あり
• [雑誌論文] Effects of His mutations on the fibrillation of amyloidogenic Vλ 6 protein Wil under acidic and physiological conditions (2010)
  • 著者名/発表者名: Mishima T, Ohkuri T, Monji A, Kanemaru T, Abe Y, Ueda T
  • 雑誌名: Biochem Biophys Res Commun 391,1 ページ: 615-620
  • 査読あり
• [雑誌論文] Residual Structures in the Acid-Unfolded States of Vlambda6 Proteins Affect Amyloid Fibrillation. (2009)
  • 著者名/発表者名: Mishima T, Ohkuri T, Monji A, Kanemaru T, Abe Y, Ueda T
  • 雑誌名: J. Mol. Biol. 392 ページ: 1033-1043
  • 査読あり
• [雑誌論文] DiaA dynamics are coupled with changes in initial origin complexes leading to helicase loading. (2009)
  • 著者名/発表者名: Keyamura K, Abe Y, Higashi M, Ueda T, Katayama T
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 284 ページ: 25038-25050
  • 査読あり
• [雑誌論文] Factor G Utilizes a Carbohydrate-Binding Cleft That Is Conserved between Horseshoe Crab and Bacteria for the Recognition of {β}-1,3-d-Glucans. (2009)
  • 著者名/発表者名: Ueda Y, Ohwada S, Abe Y, Shibata T, Iijima M, Yoshimitsu Y, Koshiba T, Nakata M, Ueda T, Kawabata SI.
  • 雑誌名: J. Immunol. 183 ページ: 3810-3818
  • 査読あり
• [雑誌論文] アサリ貝リゾチームの構造と機能 (2009)
  • 著者名/発表者名: 阿部義人, 植田正
  • 雑誌名: 生化学 81 ページ: 314-319
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structures of K33 mutant hen lysozymes with enhanced activities. (2008)
  • 著者名/発表者名: Goto T, Ohkuri T, Shioi S, Abe Y, Imoto T, Ueda T
  • 雑誌名: J. Biochem. 144 ページ: 619-623
  • 査読あり
• [学会発表] 大腸菌の複製再開始蛋白質の構造と一本鎖DNA認識 (2011)
  • 著者名/発表者名: 阿部義人、片山勉、植田正
  • 学会等名: 平成23年度九大P&P拡大研究会「超高次複合体解析に基づくゲノム動態研究プロジェクト」
  • 年月日: 20110100
• [学会発表] DNA複製再開始におけるプライモソーム構成因子PriCの構造機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 荒牧峻彦、阿部義人、大栗誉敏、植田正
  • 学会等名: 第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会 合同大会
  • 年月日: 20101200
• [学会発表] NMRを用いた大腸菌複製再開始因子PriBの相互作用解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 阿部義人、竹縄太一、塩井誠次郎、片山勉、植田正
  • 学会等名: 第10回日本蛋白質科学会
  • 年月日: 20100600
• [学会発表] 大腸菌DNA複製再開始因子PriCのドメイン化およびその構造と機能 (2010)
  • 著者名/発表者名: 荒牧峻彦、阿部義人、大栗誉敏、三島朋徳、片山勉、植田正
  • 学会等名: 第10回日本蛋白質科学会
  • 年月日: 20100600
• [学会発表] 構造生物学アプローチによる大腸菌細胞分裂阻害再活性化因子CedAの機能解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 阿部義人、三好孝法、渡邊典子、片山勉、植田正
  • 学会等名: P&P合同公開シンポジウム「生命活動を制御する高次複合体の構造と機能」
  • 年月日: 20091200
• [学会発表] 大腸菌DNA複製再開始因子PriCのドメイン化およびその構造と機能について (2009)
  • 著者名/発表者名: 荒牧峻彦、阿部義人、大栗誉敏、三島朋徳、片山勉、植田正
  • 学会等名: P&P合同公開シンポジウム「生命活動を制御する高次複合体の構造と機能」
  • 年月日: 20091200
• [学会発表] 大腸菌熱ショック蛋白質HSPQの機能解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 中田光、阿部義人、塩井誠次郎、片山勉、植田正
  • 学会等名: 第9回日本蛋白質科学会
  • 年月日: 20090500
• [学会発表] DNA複製再開に関わるプライモソーム構成因子DnaTのドメイン化及びNMRによる構造解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 谷純也、阿部義人、佐藤健治、片山勉、植田正
  • 学会等名: 日本生化学会九州支部会
  • 年月日: 20090500
• [学会発表] 大腸菌プライモソーム構成因子PriC N末ドメインのNMR構造解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 荒牧峻彦, 阿部義人, 大栗誉敏, 三島朋徳, 片山勉
  • 学会等名: 日本生化学会九州支部会
  • 年月日: 20090500
• [学会発表] 細胞分裂阻害再活性化因子CedAの機能解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 三好孝法、阿部義人、渡辺典子、片山勉、植田正
  • 学会等名: 第31日本分子生物学会・第83回生化学会合同年会
  • 年月日: 20081200
• [学会発表] 大腸菌熱ショックタンパク質HSPQの機能解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 中田光、阿部義人、塩井誠次郎、片山勉、植田正
  • 学会等名: 日本薬学会九州支部大会
  • 年月日: 20081200
• [学会発表] 構造生物学的アプローチによる大腸菌複製開始因子DnaAの機能解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 阿部義人、大栗誉敏、片山勉、植田正
  • 学会等名: 日本生化学会九州支部例会
  • 年月日: 20080500
• [備考] ホームページ等