高度好熱菌ゲノム情報維持の分子メカニズムの解明

2010 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 20570131
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 機能生物化学
• 研究機関: 大阪大学
• 研究代表者: 増井 良治 大阪大学, 大学院・理学研究科, 准教授 (40252580)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2010
• キーワード: 酵素 / 核酸 / 生体分子 / ゲノム / 細菌

研究概要

高度好熱菌のミスマッチ修復系および塩基除去修復系を構成するタンパク質群を精製し,修復反応の再構成実験や相互作用解析,さらに立体構造解析を行った結果,新たな相互作用によってミスマッチを含むDNA鎖を識別していること,そのDNA鎖を分解するヌクレアーゼが特有の構造で一本鎖DNAを認識していること,さらに2種類のDNAポリメラーゼが異なる塩基除去修復経路で働いていることを明らかにした。

研究成果

• [雑誌論文] Long type endonuclease IV has an additional C-terminal loop that increases binding affinity to DNA. (2011)
  • 著者名/発表者名: Asano, R., Ishikawa, H., Nakane, S., Nakagawa, N., Kuramitsu, S., Masui, R.
  • 雑誌名: Acta Crystallogr. D67 ページ: 149-155
  • 査読あり
• [雑誌論文] A novel single-stranded DNA-specific 3'-5' exonuclease, Thermus thermophilus exonuclease I, is involved in several DNA repair pathways. (2010)
  • 著者名/発表者名: Shimada, A., Masui, R., Nakagawa, N., Takahata, Y., Kim, K., Kuramitsu, S., Fukui, K.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 38 ページ: 5692-5705
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structure of RecJ exonuclease defines its specificity for single-stranded DNA. (2010)
  • 著者名/発表者名: Wakamatsu, T., Kitamura, Y., Kotera, Y., Nakagawa, N., Kuramitsu, S., Masui, R.
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. 285 ページ: 9762-9769
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterization of DNA polymerase X from Thermus thermophilus HB8 reveals the POLXc and PHP domains are both required for 3'-5' exonuclease activity. (2009)
  • 著者名/発表者名: Nakane, S., Nakagawa, N., Kuramitsu, S., Masui, R.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 37 ページ: 2037-2052
  • 査読あり
• [雑誌論文] Bound nucleotide controls the endonuclease activity of mismatch repair enzyme MutL. (2008)
  • 著者名/発表者名: Fukui, K., Nishida, M., Nakagawa, N., Masui, R., Kuramitsu, S.
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. 283 ページ: 12136-12145
  • 査読あり
• [学会発表] Structural and functional analysis of bacterial DNA polymerase X involved in DNA repair processes. (2010)
  • 著者名/発表者名: 中根修平, 増井良治
  • 学会等名: 第83回日本生化学会大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2010-12-09
• [学会発表] DNAミスマッチ修復における鎖除去ステップの解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 島田敦広, 増井良治
  • 学会等名: 第83回日本生化学会大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2010-12-08
• [学会発表] Contribution of OB-fold domain to the activity of RecJ exonuclease. (2009)
  • 著者名/発表者名: 若松泰介, 増井良治
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2009-12-10
• [学会発表] DNAミスマッチ修復系初期反応におけるMutLエンドヌクレアーゼ活性の制御機構 (2008)
  • 著者名/発表者名: 福井健二, 増井良治
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会 合同大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2008-12-12
• [学会発表] 好熱菌由来endonuclease IVの3'-5' exonuclease活性発現機構の解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 淺野瑠一, 増井良治
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会 合同大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2008-12-12
• [図書] やさしい原理からはいるタンパク質科学実験法3:タンパク質のはたらきを知る(共著) (2009)
  • 著者名/発表者名: 倉光成紀, 増井良治
  • 総ページ数: 1-21
  • 出版者: 化学同人