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2008 年度 実績報告書

新しいペプチド探索法:遺伝子情報からのアミド型生理活性ペプチドの予測

研究課題

研究課題/領域番号 20590248
研究機関千葉大学

研究代表者

木村 定雄  千葉大学, 大学院・医学研究院, 教授 (40134225)

研究分担者 粕谷 善俊  千葉大学, 大学院・医学研究院, 准教授 (70221877)
西山 真理子  千葉大学, 大学院・医学研究院, 助教 (00092081)
キーワードG蛋白質共役受容体 / GPCR / オーファン受容体 / 生理活性ペプチド / ゲノム構造 / バイオインフォーマティクス
研究概要

本研究は、生理活性ペプチドにはC末端部アミドを持つ例が多いことに注目し、ヒトゲノムDNA配列情報より、すべてのアミド型のGPCRの新規生理活性ペプチドリガンド探索を行う。特に、ロドプシン型受容体βグループのオーファン受容体に焦点を当てて研究を行った。(1)ヒトゲノムデータベース等のBankに登録されたDNA配列(33.119個)の情報から、独自に開発したコンピューター検索ソフトにより、C末端部にアミドを持つ生理活性ペプチド候補(352個)を予測抽出した。(2)アミド型活性ペプチド候補(リガンドライブラリー)を約200個化学合成した。(3)次に、ロドプシン型受容体βグループに属するオーファン受容体遺伝子9個を取得し、安定発現細胞に導入した。(4)ブタ脳の酸-アセトン抽出物より、ペプチド性分画を取得し、逆相系HPLCにより360分画に分離した。(5)活性測定(スクリーニング)系として、オーファン受容体の発現細胞を用いて、fura-2/AMを用いた細胞内Ca^<2+>や濃度変化を追跡した。(6)今年度は、オーファン受容体、ヒトGPR176を用いて、スクリーニングを行ったが、合成ペプチド約200個、およびブタ脳抽出物の分画物の中には、活性を持つ物が検出できなかった。引き続いて、他のオーファン受容体の発現細胞を用いてスクリーニングを継続中である。

  • 研究成果

    (3件)

すべて 2009 2008 その他

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Impaired Placental Neovascularization in Mice with Pregnancy-Associated Hypertension2008

    • 著者名/発表者名
      Furuya M, Ishida J, Inaba S, Kasuya Y, Kimura S, Nemori R, Fukamizu A
    • 雑誌名

      Laboratory Investigation 88

      ページ: 416-429

    • 査読あり
  • [学会発表] 未知のモルモットβ1-adrenergic receptor遺伝子のクローニングとその機能解析2009

    • 著者名/発表者名
      高橋裕美、田中芳夫、木村定雄、小池勝夫、粕屋善俊
    • 学会等名
      日本薬理学会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2009-03-17
  • [備考]

    • URL

      http://www.m.chiba-u.jp/class/bunsiseitai/research-new.htm

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公開日: 2010-06-11   更新日: 2016-04-21  

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