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2009 年度 実績報告書

大量高速全ゲノムSNPチップ連鎖解析システムによる遺伝性神経疾患の遺伝子同定

研究課題

研究課題/領域番号 20590989
研究機関東京大学

研究代表者

後藤 順  東京大学, 医学部附属病院, 講師 (10211252)

キーワード連鎖解析 / SNP / 遺伝性疾患 / 遺伝子同定
研究概要

遺伝性神経疾患の原因遺伝子を同定することにより、当該疾患の診断精度の向上、病態解明及び治療法開発を進めることが可能となる。分子遺伝学の進歩により、多くの疾患の原因遺伝子が、過去20余年の間に同定され、研究が大きく展開されている。しかしながら、すべての疾患遺伝子が同定されているわけではなく、稀少な小家系においては、原因遺伝子の同定が残されているものも多く、また家系解析(連鎖解析)もこれまで多大な労力を要するものであった。SNPチップによる全ゲノムのジェノタイピングが短時間に行えるようになったことから、SNPチップデータによるハイスループット連鎖解析システムを福田(連携研究者)らは確立した。本システムを用いて、これまでに収集してきた、原因遺伝子未同定の遺伝性疾患家系について、連鎖解析による遺伝子候補領域の同定を進めている。結果的には既知病因遺伝子であったが、遺伝性痙性対麻痺(SPG21)、脊髄小脳変性症(Friedreich失調症)、ネマリンミオパチー(TPM2)の診断に有用であった。さらに、新規のミオパチー遺伝子座位の同定を含め、心筋症を伴ったネマリンミオパチー家系等の連鎖解析を行った。家系の収集を進めるとともに、未解析の家系の解析、候補領域を同定した家系については、書誌学的情報、オントロジー、ゲノム情報学を駆使した候補遺伝子の抽出、エクソンキャプチャー等を用いた、大規模シークエンシング解析による病因変異の同定を進めていく。

  • 研究成果

    (12件)

すべて 2010 2009

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 6件) 学会発表 (6件)

  • [雑誌論文] TDP-43 M337V mutation in familial amyotrophic lateral sclerosis in Japan.2010

    • 著者名/発表者名
      Tamaoka A, 10名略, Goto J, Tsuji S, Akiyama H.
    • 雑誌名

      Intern Med. 49

      ページ: 331-334

    • 査読あり
  • [雑誌論文] TRPM7 is not associated with amyotrophic lateral sclerosis-parkinsonism dementia complex in the Kii peninsula of Japan.2010

    • 著者名/発表者名
      Hara K, 6名略, Goto J, Nishizawa M, Kuzuhara S, Tsuji S.
    • 雑誌名

      Am J Med Genet B Neuropsychiatr Genet. 153B

      ページ: 310-313

    • 査読あり
  • [雑誌論文] SNP haplotype mapping in a small ALS family.2009

    • 著者名/発表者名
      Krueger KA, 3名略, Goto J, 5名略, Ranum LP
    • 雑誌名

      PLoS One. 4

      ページ: e5687

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mitochondrial ND3 as the novel causative gene for Leber hereditary optic neuropathy and dystonia.2009

    • 著者名/発表者名
      Wang K, Takahashi Y, 3名略, Goto J, Lou JN, Tsuji S
    • 雑誌名

      Neurogenetics 10

      ページ: 337-345

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mutations for Gaucher disease confer high susceptibility to Parkinson disease.2009

    • 著者名/発表者名
      Mitsui J, 4名略, Goto J, 7名略, Tsuji S
    • 雑誌名

      Arch Neurol 66

      ページ: 571-576

    • 査読あり
  • [雑誌論文] SNP HiTLink : a high-throughput linkage analysis system employing dense SNP data.2009

    • 著者名/発表者名
      Fukuda Y, Nakahara Y, Date H, Takahashi Y, Goto J, 4名略, Tsuji S
    • 雑誌名

      BMC Bioinformatics. 10

      ページ: 121

    • 査読あり
  • [学会発表] A variation database for amyotrophic lateral sclerosis.2009

    • 著者名/発表者名
      Yoshida M, Takahashi Y, Koike A, Fukuda Y, Goto J, Tsuji S
    • 学会等名
      59th Annual Meeting of the American Society of Human Genetics
    • 発表場所
      Honolulu, Hawaii, USA
    • 年月日
      2009-10-23
  • [学会発表] Mutational analysis FUS/TLS in familial and sporadic amyotrophic lateral sclrerosis in the Japanese population.2009

    • 著者名/発表者名
      Takahashi Y, Goto J, Tsuji S
    • 学会等名
      59th Annual Meeting of the American Society of Human Genetics
    • 発表場所
      Honolulu, Hawaii, USA
    • 年月日
      2009-10-22
  • [学会発表] Adult-onset leuloencephalopathies with vanishing white matter with novel missense mutations in EIF2B2 and EIF2B5 and decreased eIF2B activity2009

    • 著者名/発表者名
      Matsukawa T, 9名略, Goto J, Proud CG, Tsuji S
    • 学会等名
      59th Annual Meeting of the American Society of Human Genetics
    • 発表場所
      Honolulu, Hawaii, USA
    • 年月日
      2009-10-21
  • [学会発表] Molecular epidemiology of spinocerebellar ataxias in Japanese population.2009

    • 著者名/発表者名
      Ichikawa Y, Tsuji S, Goto J
    • 学会等名
      59th Annual Meeting of the American Society of Human Genetics
    • 発表場所
      Honolulu, Hawaii, USA
    • 年月日
      2009-10-21
  • [学会発表] A comprehensive diagnostic system for hereditary spastic paraplegia employing resequencing microarray, Snager sequencing and comparative genomic hybridization array allows efficient identification of various types of mutations in the causative genes.2009

    • 著者名/発表者名
      Ishiura H, Takahashi Y, Goto J, Tsuji S
    • 学会等名
      59th Annual Meeting of the American Society of Human Genetics
    • 発表場所
      Honolulu, Hawaii, USA
    • 年月日
      2009-10-21
  • [学会発表] Multiplexed resequencing analysis to identify rare variants in pooled DNA of barcode-indexed DNAs2009

    • 著者名/発表者名
      Mitsui J, 4名略, Goto J, Tsuji S
    • 学会等名
      59th Annual Meeting of the American Society of Human Genetics
    • 発表場所
      Honolulu, Hawaii, USA
    • 年月日
      2009-10-21

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公開日: 2011-06-16   更新日: 2016-04-21  

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