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2010 年度 実績報告書

ゲノム・エピゲノム異常領域を指標とし肺癌治療を目指した新規標的遺伝子の同定と解析

研究課題

研究課題/領域番号 20591664
研究機関千葉県がんセンター(研究所)

研究代表者

横井 左奈  千葉県がんセンター研究所, がんゲノムセンター, 部長 (30372452)

キーワード肺がん / ゲノム / DNAコピー数
研究概要

1.肺小細胞癌における1番染色体の新規増幅領域の標的として同定したTRIM33に関し、トランスジェニックベクターを作成し、TRIM33のトランスジェニックマウスの作成を進めている。
2.非小細胞肺癌手術検体を用いたアレイCGH解析から3q26にlog2ratio 3.9の増幅を検出し、発生時や幹細胞において働くSOX2が、増幅に伴う発現亢進をしていることを確認した。肺腺癌120症例につき既知の分子マーカー(EGFR変異、KRAS変異、p53変異)の評価を行い、他の臨床病理学的因子を含めてSOX2発現レベルとの関連を調べたが、有意差は認められなかった。次に、縦隔リンパ節転移を認める肺癌手術症例から肺原発巣およびリンパ節転移巣を採取し、アレイCGHによりゲノムコピー数変化を比較した。その結果、リンパ節転移巣におけるゲノム変化は、原発巣の変化を非常に良く反映していることが確認できた。そこで、超音波気管支鏡下に未治療の肺小細胞癌リンパ節転移検体を採取し、アレイCGHによりゲノムコピー数解析を行った。その結果、1p,1q,3q,5p,6p,6q,8q,12q,17q,18q,19pに高頻度のコピー数増加を認めた。また、3p,4q,5q,10q,13q,15q,16p,16q,17p,22qに高頻度のコピー数減少を認めた。これらの結果は、以前行った肺小細胞癌細胞株での解析結果と良く一致していた。また、新規の増幅およびホモ欠失領域も検出され、標的となる遺伝子の同定を進めている。
3.当院における2007年から2009年までの非小細胞癌手術症例および気管支鏡生検症例404例につきALK免疫染色を行った結果、15例が陽性であった。そのうち10症例につきアレイCGHによりゲノムコピー数解析を行った。その結果、コピー数変化を認めた染色体領域数は0~20であった。ALK阻害薬の効果に関わる遺伝子の同定を進めている。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2011 2010

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] Genome-wide DNA methylation profiles in renal tumors of various histological subtypes and non-tumorous renal tissues.2011

    • 著者名/発表者名
      Arai E
    • 雑誌名

      Pathobiology

      巻: 78 ページ: 1-9

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Diagnosis and prognostication of ductal adenocarcinomas of the pancreas based on genome-wide DNA methylation profiling by bacterial artificial chromosome array-based methylated CpG island amplification.2011

    • 著者名/発表者名
      Gotoh M
    • 雑誌名

      J Biomed Biotechnol

      巻: 201 ページ: 780836

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Copy number alterations in urothelial carcinomas : Their clinicopathological significance and correlation with DNA methylation alterations.2011

    • 著者名/発表者名
      Nishiyama N
    • 雑誌名

      Carcinogenesis

      巻: 32 ページ: 462-469

    • 査読あり
  • [学会発表] EGFR, K-ras, p53 gene mutation analysis in NSCLC using microsamples obtained by EBUS-TBNA2010

    • 著者名/発表者名
      Nakajima T
    • 学会等名
      CHEST
    • 発表場所
      バンクーバー、カナダ
    • 年月日
      20101100

URL: 

公開日: 2012-07-19  

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