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2009 年度 実績報告書

全ゲノムを対象とした網膜格子状変性感受性遺伝子のマイクロサテライトマッピング

研究課題

研究課題/領域番号 20592052
研究機関横浜市立大学

研究代表者

飯島 康仁  横浜市立大学, 附属病院, 准教授 (40315784)

研究分担者 水木 信久  横浜市立大学, 医学研究科, 教授 (90336579)
伊藤 典彦  横浜市立大学, 医学部, 助教 (80264654)
キーワードゲノムワイド / マイクロサテライト / 網膜格子状変性
研究概要

本研究は、ゲノム内に散在する数塩基単位の反復配列であるマイクロサテライトマーカーを用いて全染色体を網羅的にスクリーニングすることにより、網膜格子状変性の疾患感受性遺伝子および疾患特異的遺伝変異を網羅的に同定することを目的としている。本研究では、3段階のマイクロサテライトスクリーニングにより疾患感受性領域を絞り込んだのち、絞り込まれた領域を対象に詳細なマイクロサテライト多型解析およびSNP(一塩基多型:single nucleotide polymorphism)解析を行い、網膜格子状変性感受性遺伝子および特異的遺伝変異の排他的な同定を試みる。
日本人網膜格子状変性患者400検体および日本人健常者300検体を対象として、全染色体を網羅する23,465個のマイクロサテライトマーカーを用いた遺伝子スクリーニングを行い、網膜格子状変性の疾患感受性候補を絞り込んでいる。平成21年度までに、絞り込まれた候補領域を対象とした詳細なマイクロサテライト多型解析およびSNP解析を行い、1領域において網膜格子状変性と有意な相関を確認している。平成22年度は、平成21年度に引き続き、疾患感受性候補領域を網羅するように設定したSNPを用いて相関解析を遂行する。得られる遺伝情報をもとに、遺伝子領域内の連鎖不平衡解析、ハプロタイプ解析を実施し、疾患感受性遺伝変異(SNP)を明らかにする。本研究の遺伝情報は、網膜格子状変性発症のメカニズム解明の一助になると考えられる。

  • 研究成果

    (16件)

すべて 2010 2009

すべて 雑誌論文 (16件) (うち査読あり 16件)

  • [雑誌論文] Genome-wide association study of normal tension glaucoma : common variants in SRBD1 and ELOVL5 contribute to disease susceptibility2010

    • 著者名/発表者名
      The NTG Genetic Study Group of Japan Glaucoma Society
    • 雑誌名

      Ophthalmology (in press)

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genetics of Behcet's disease inside and outside the MHC2010

    • 著者名/発表者名
      Meguro A
    • 雑誌名

      Ann Rheum Dis 69

      ページ: 747-754

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Analysis of microsatellite polymorphisms within the GLC1F locus in Japanese patients with normal tension glaucoma2010

    • 著者名/発表者名
      Murakami K
    • 雑誌名

      Mol Vis 16

      ページ: 462-466

    • 査読あり
  • [雑誌論文] P1 and P2 components of human visual evoked potentials are modulated by depth perception of 3-dimensional images2010

    • 著者名/発表者名
      Omoto S
    • 雑誌名

      Clin Neurophysiol 121

      ページ: 386-391

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Alternatively spliced vascular endothelial growth factor receptor-2 is an essential endogenous inhibitor of lymphatic vessel growth2009

    • 著者名/発表者名
      Albuquerque RJ
    • 雑誌名

      Nature Medicine 15

      ページ: 1023-1030

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Investigation of the association between TLR2 gene polymorphisms and Behcet's disease in Japanese patients2009

    • 著者名/発表者名
      Tomiyama R
    • 雑誌名

      Human Immunol 70

      ページ: 41-44

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Association of toll-like receptor 2 gene polymorphisms with normal tension glaucoma2009

    • 著者名/発表者名
      Nakamura J
    • 雑誌名

      Mol Vis 15

      ページ: 2905-2910

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Lack of association between toll-like receptor 4 gene polymorphisms and sarcoidosis-related uveitis in Japan2009

    • 著者名/発表者名
      Asukata Y
    • 雑誌名

      Mol Vis 15

      ページ: 2673-2682

    • 査読あり
  • [雑誌論文] New susceptibility locus for high myopia is linked to the uromodulin-like 1(UMODL1)gene region on chromosome 21q22.32009

    • 著者名/発表者名
      Nishizaki R
    • 雑誌名

      Eye 23

      ページ: 222-229

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Association of TLR4 polymorphisms with Behcet's disease in a Korean population2009

    • 著者名/発表者名
      Horie Y
    • 雑誌名

      Human Immunol 70

      ページ: 41-44

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Association of toll-like receptor 2 gene polymorphisms with normal tension glaucoma2009

    • 著者名/発表者名
      Nakamura J
    • 雑誌名

      Rheumatology 48

      ページ: 638-642

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Investigation of the association between the GLC3A locus and normal tension glaucoma in Japanese patients by microsatellite analysis2009

    • 著者名/発表者名
      Kamio Y
    • 雑誌名

      Clinical Ophthalmol 3

      ページ: 183-188

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Association of microsatellite polymorphisms of the GPDS1 locus with normal tension glaucoma in the Japanese population2009

    • 著者名/発表者名
      Nakamura K
    • 雑誌名

      Clinical Ophthalmol 3

      ページ: 307-312

    • 査読あり
  • [雑誌論文] New technique for inserting 27-gauge twinlight chandelier illumination fibers into the eye using intravenous cannula2009

    • 著者名/発表者名
      Uemoto R
    • 雑誌名

      Retina 29

      ページ: 1040-1042

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Evaluation of PTPN22 polymorphisms and Vogt-Koyanagi-Harada disease in Japanese patients2009

    • 著者名/発表者名
      Horie Y
    • 雑誌名

      Mol Vis 15

      ページ: 1115-1119

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Immunologic mechanisms of corneal allografts reconstituted from cultured allogeneic endothelial cells in an immune-privileged site2009

    • 著者名/発表者名
      Hayashi T
    • 雑誌名

      Invest Ophthalmol Vis Sci 50

      ページ: 3151-3158

    • 査読あり

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公開日: 2011-06-16   更新日: 2016-04-21  

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