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2010 年度 研究成果報告書

新型パルス中性子回折計を利用した次世代構造生物学

研究課題

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研究課題/領域番号 20612002
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 量子ビーム
研究機関茨城大学

研究代表者

田中 伊知朗  茨城大学, 工学部, 准教授 (20354889)

研究分担者 友寄 克亮  茨城大学, フロンティア応用原子科学研究センター, 産学官連携研究員 (10455909)
山田 太郎  茨城大学, フロンティア応用原子科学研究センター, 助教 (40455910)
日下 勝弘  茨城大学, フロンティア応用原子科学研究センター, 准教授 (10414591)
大西 裕季  茨城大学, 工学部, 産学官連携研究員 (50455911)
連携研究者 新村 信雄  茨城大学, フロンティア応用原子科学研究センター, 特任教授 (50004453)
研究期間 (年度) 2008 – 2010
キーワードJ-PARC / 生体高分子用中性子回折計(iBIX) / 中性子結晶解析 / 水素 / 水素結合 / タンパク質 / 水和水
研究概要

J-PARCの次世代中性子源において、新型生体高分子用回折計(iBIX)が完成し、2008年末より稼働が始まった。様々な調整の後、初めてのタンパク質として、リボヌクレアーゼAの測定が、加速器出力120kW、体積約5mm3で10日余りでデータ収集できた。構造解析の結果、目的の水素位置および水の向きまで確認できたことから、1mm3の結晶があれば、J-PARCが1MW、検出器が予定の30台に整備されたときには3日程度で測定が完了できることが確認できた。

  • 研究成果

    (29件)

すべて 2011 2010 2009 2008 その他

すべて 雑誌論文 (13件) (うち査読あり 13件) 学会発表 (12件) 備考 (4件)

  • [雑誌論文] X-ray and neutron protein crystallographic analysis of the trypsin-BPTI complex2011

    • 著者名/発表者名
      K.Kawamura, I.Tanaka, 他
    • 雑誌名

      Acta Cryst D vol.67

      ページ: 140-148

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 茨城県生命物質構造解析装置(iBIX)による水素・水和水の構造研究/産業利用2011

    • 著者名/発表者名
      田中伊知朗, 他
    • 雑誌名

      RADIOISOTOPES 60巻

      ページ: 89-97

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 供用を開始したJ-PARCの新しい生物用中性子回折装置(iBIX)2010

    • 著者名/発表者名
      田中伊知朗, 他
    • 雑誌名

      薬学雑誌 130巻

      ページ: 665-670

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Neutron Structure Analysis by IBARAKI Biological Crystal Diffractometer (iBIX) in J-PARC2010

    • 著者名/発表者名
      田中伊知朗, 他
    • 雑誌名

      Acta Cryst D vol.66

      ページ: 1194-1197

    • 査読あり
  • [雑誌論文] BLO3茨城県生命物質構造解析装置(iBIX)2010

    • 著者名/発表者名
      田中伊知朗、日下勝弘, 他
    • 雑誌名

      日本中性子科学会誌「波紋」 20巻

      ページ: 16-20

    • 査読あり
  • [雑誌論文] A neutron crystallographic analysis of a 'phosphate-free' ribonuclease A at 1.7A resolution2009

    • 著者名/発表者名
      D.Yagi, T.Yamada, I.Tanaka, 他
    • 雑誌名

      Acta Cryst D vol.65

      ページ: 892-899

    • 査読あり
  • [雑誌論文] A neutron crystallographic analysis of T6 porcine insulin at a 2.1A resolution2009

    • 著者名/発表者名
      W.Iwai, T.Yamada, I.Tanaka, 他
    • 雑誌名

      Acta Cryst D vol.65

      ページ: 1042-1050

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 生物用単結晶構造解析装置2009

    • 著者名/発表者名
      田中伊知朗
    • 雑誌名

      日本金属学会誌「まてりあ」 48巻

      ページ: 369-371

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Methyl group conformation and hydrogen bonds in proteins determined by neutron protein crystallography2009

    • 著者名/発表者名
      Atsushi Yamaguchi, Ichiro Tanaka, 他
    • 雑誌名

      Nucl.Instr.Meth.A vol.600

      ページ: 275-278

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Overview of a New Biological Neutron Diffractometer (iBIX) in J-PARC2009

    • 著者名/発表者名
      田中伊知朗, 他
    • 雑誌名

      Nucl.Instr.Meth.A vol.600

      ページ: 161-163

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and evaluation of hen egg-white lysozyme crystals for protein pH titration in the crystalline state2008

    • 著者名/発表者名
      Wakari Iwai, Ichiro Tanaka, 他
    • 雑誌名

      Journal of Synchrotron Radiation vol.15

      ページ: 312-315

    • 査読あり
  • [雑誌論文] New sources and instrumentation for neutrons in biology2008

    • 著者名/発表者名
      S.C.M.Teixeira, I.Tanaka, 他
    • 雑誌名

      Chemical Physics vol.345

      ページ: 133-151

    • 査読あり
  • [雑誌論文] A neutron crystallographic analysis of a cubic porcine insulin at pD6.62008

    • 著者名/発表者名
      Takuya Ishikawa, Ichiro Tanaka, 他
    • 雑誌名

      Chemical Physics vol.345

      ページ: 152-158

    • 査読あり
  • [学会発表] リボヌクレアーゼAの構造解析2011

    • 著者名/発表者名
      日下勝弘
    • 学会等名
      第2回MLFシンポジウム
    • 発表場所
      高エネルギー加速器研究機構KEK(茨城県つくば市)(招待講演)
    • 年月日
      2011-01-17
  • [学会発表] 茨城県生命物質構造解析装置iBIXによる初タンパク質構造解析2010

    • 著者名/発表者名
      日下勝弘
    • 学会等名
      日本中性子科学会第10回年会
    • 発表場所
      東北大学(宮城県仙台市)(招待講演)
    • 年月日
      2010-12-09
  • [学会発表] J-PARC茨城県生命物質構造解析装置(iBIX)による初のタンパク質中性子構造解析2010

    • 著者名/発表者名
      日下勝弘
    • 学会等名
      平成22年度日本結晶学会年会
    • 発表場所
      大阪大学(大阪府吹田市)(招待講演)
    • 年月日
      2010-12-03
  • [学会発表] Neutrons in diffraction structural biology making the best use of neutrons2010

    • 著者名/発表者名
      田中伊知朗
    • 学会等名
      3rd International Symposium on Diffraction Structural Biology (ISDSB2010)
    • 発表場所
      パリ第11大学(Orsay, France)(招待(基調)講演)
    • 年月日
      2010-05-28
  • [学会発表] 茨城県生命物質構造解析装置iBIXの概要20092009

    • 著者名/発表者名
      田中伊知朗
    • 学会等名
      日本中性子科学会第9回年会
    • 発表場所
      茨城県東海村(招待講演)
    • 年月日
      2009-12-10
  • [学会発表] Overview of IBARAKI Biological Crystal Diffractometer (iBIX)2009

    • 著者名/発表者名
      田中伊知朗
    • 学会等名
      Neutrons in Biology 2009
    • 発表場所
      Santa Fe, NM, USA(invited)
    • 年月日
      2009-10-26
  • [学会発表] Initial Neutron Protein Diffraction Results at iBIX in J-PARC2009

    • 著者名/発表者名
      田中伊知朗
    • 学会等名
      International Conference on Neutron Scattering 2009
    • 発表場所
      Knoxville, TN, USA(invited)
    • 年月日
      2009-05-05
  • [学会発表] 供用開始に際したJ-PARCの新しい生物用中性子回折装置(iBIX)2009

    • 著者名/発表者名
      田中伊知朗
    • 学会等名
      日本薬学会 第129年会
    • 発表場所
      京都市(招待講演)
    • 年月日
      2009-03-27
  • [学会発表] Introduction of a New Neutron Diffractometer Installed at J-PARC2009

    • 著者名/発表者名
      田中伊知朗
    • 学会等名
      ATI international Forum 2009
    • 発表場所
      茨城県東海村
    • 年月日
      2009-03-10
  • [学会発表] A new biological neutron diffractometer (iBIX) in J-PARC2008

    • 著者名/発表者名
      田中伊知朗
    • 学会等名
      IUCr2008 0saka
    • 発表場所
      大阪市(poster)
    • 年月日
      20080828-20080829
  • [学会発表] A Neutron Crystallographic Analysis of a Bovine Ribonuclease A at 1.4 A Resolution2008

    • 著者名/発表者名
      Yagi D., Yamada T.
    • 学会等名
      ASIA SCIENCE SEMINAR ON "Frontier Science at High-Intensity Proton Accelerators"
    • 発表場所
      Beijing, China
    • 年月日
      2008-10-27
  • [学会発表] Outline of a New Biological Neutron Diffactometer(iBIX) in J-PARC2008

    • 著者名/発表者名
      田中伊知朗
    • 学会等名
      IUCr2008 Osaka, Satellite Meeting in Tokai, Ibaraki, Symposium on Neutron Protein Crystallography (NPC)
    • 発表場所
      東海村
    • 年月日
      2008-08-21
  • [備考] ホームページ

    • URL

      http://info.ibaraki.ac.jp/Profiles/7/0000696/profile.html

  • [備考] プレス発表

    • URL

      http://www.fas.ibaraki.ac.jp/?page_id=103

  • [備考] 茨城県、茨城大学、日本原子力研究開発機構、J-PARCセンター、茨城県生命物質構造解析装置(iBIX)においてタンパク質結晶の構造解析に成功、茨城県政記者クラブにてプレス発表、2010年10月13日、茨城県庁、茨城県水戸市

    • URL

      http://nsb.mat.ibaraki.ac.jp/index.html

  • [備考] 2010年10月14日 日本経済新聞、茨城新聞、読売新聞の3新聞に10/13プレス発表内容が掲載

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公開日: 2012-01-26   更新日: 2018-06-25  

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