In vivoセレクション法によるゲノムワイドなリボザイム探索

2009 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 20710167
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生物分子科学
• 研究機関: 大阪大学
• 研究代表者: 萩原 正規 大阪大学, 産業科学研究所, 助教 (40403000)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2009
• キーワード: リボザイム / in vivoセレクション / ゲノム

研究概要

研究提案「In vivoセレクション法によるゲノムワイドなリボザイム探索」では、機能性RNAのうち自己切断型リボザイムの探索を目標に設定し、ゲノムから転写されるRNAを網羅的にライブラリー化した「ゲノムRNAライブラリー」から、大腸菌を用いたin vivoセレクション法による効率的なスクリーニング系を用いて、リボザイムなどの機能性RNAの探索を行った。

研究成果

• [雑誌論文] Secondary Structure-Inducible Ligand Fluorescence Coupled with PCR (2009)
  • 著者名/発表者名: Fumie Takei, Masako Igarashi, Masaki Hagihara, Yoshimi Oka, Yoshihiro Soya, Kazuhiko Nakatani
  • 雑誌名: Angewandte Chemie International Edition 4 ページ: 7822-7824
  • 査読あり
• [雑誌論文] Small Molecule Affecting the Replication of Trinucleotide Repeat d(GAA)n (2009)
  • 著者名/発表者名: Hanping He, Masaki Hagihara, Kazuhiko Nakatani
  • 雑誌名: Chemistry A European Journal 15 ページ: 10641-10648
  • 査読あり
• [雑誌論文] Unstable Tandem Repeats in Promoters Confer Transcriptional Evolvability (2009)
  • 著者名/発表者名: Marcelo D. Vinces, Matthieu Legendre, Marina Caldara, Masaki Hagihara, Kevin J. Verstrepen
  • 雑誌名: Science 324 ページ: 1213-1216
  • 査読あり
• [雑誌論文] RNA aptamers that reversibly bind photoresponsive azobenzene-containing peptides (2009)
  • 著者名/発表者名: Hayashi, Gosuke, Hagihara Masaki, Nakatani Kazuhiko
  • 雑誌名: Chemistry A European Journal 15 ページ: 424-432
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ligand Binding to Tandem G-quadruplexes from Human Telomeric DNA (2008)
  • 著者名/発表者名: Li-Ping Bai, Masaki Hagihara, Zhi-Hong Jiang, Kazuhiko Nakatani
  • 雑誌名: ChemBioChem 9 ページ: 2583-2587
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genotyping by allele-specific l-DNA-tagged PCR (2008)
  • 著者名/発表者名: Hayashi, Gosuke, Hagihara, Masaki; Nakatani, Kazuhiko
  • 雑誌名: Journal of Biotechnology 135 ページ: 157-160
  • 査読あり
• [雑誌論文] Context-dependent fluorescence detection of a phosphorylated tyrosine residue by a ribonucleopeptide (2008)
  • 著者名/発表者名: Hasegawa, Tetsuya; Hagihara, Masaki; Fukuda, Masatora; Nakano, Shun; Fujieda, Nobutaka; Morii, Takashi
  • 雑誌名: Journal of the American Chemical Society 130 ページ: 8804-8812
  • 査読あり
• [雑誌論文] DNA Labeling by Ligand Inducible Secondary Structure (2008)
  • 著者名/発表者名: Peng, Tao; He, Hanping; Hagihra, Masaki; Nakatani, Kazuhiko
  • 雑誌名: ChemBioChem 9 ページ: 1893-1897
  • 査読あり
• [学会発表] RNA四重鎖構造を介した遺伝子発現制御 (2010)
  • 著者名/発表者名: 萩原正規、中谷和彦
  • 学会等名: 日本化学会第90春季年会
  • 発表場所: 近畿大学(大阪府)
  • 年月日: 2010-03-27
• [学会発表] mRNAの非翻訳領域に存在する四重鎖構造 (2009)
  • 著者名/発表者名: 萩原正規、中谷和彦
  • 学会等名: 日本ケミカルバイオロジー研究会第4回年会
  • 発表場所: 神戸市産業振興センター(兵庫県)
  • 年月日: 2009-05-19
• [学会発表] (3)萩原正規、中谷和彦、グアニンリッチRNA配列に構造変化を誘起する小分子化合物 (2008)
  • 著者名/発表者名: 萩原正規、中谷和彦
  • 学会等名: 第3回バイオ関連化学合同シンポジウム2008
  • 発表場所: 東京工業大学すずかけ台キャンパス(神奈川県)
  • 年月日: 20080918-20080920
• [備考]
  • URL: http://www.sanken.osaka-u.ac.jp/labs/rbc/member/hagihara.html