RNAの単分子発現解析をめざしたナノ構造体の構築とAFM観察

2009 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 20750126
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生体関連化学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 葛谷 明紀 東京大学, 大学院・工学系研究科, 助教 (00456154)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2009
• キーワード: DNA / ナノ構造体 / タンパク / ナノアレイ / ストレプトアビジン / ナノテクノロジー

研究概要

長鎖の一本鎖DNAを折りたたんで自在な二次元ナノ構造体を作成するDNA Origamiの技術を応用し、ナノメートルサイズのウェルが複数組み込まれた200nm x 35nmの棒状ナノ構造体の作成を行った。ウェルの中にビオチンを2分子修飾することで、構造体内の全てのウェルを区別しながら、望みの位置、数のウェルのみにストレプトアビジンを取り込み、従来にない精密、かつ強固なタンパクナノアレイの作成に成功した。

研究成果

• [雑誌論文] DNA Origami: Fold, Stick, and Beyond (2010)
  • 著者名/発表者名: Akinori Kuzuya, Makoto Komiyama
  • 雑誌名: Nanoscale 2 ページ: 310-322
  • 査読あり
• [雑誌論文] Precise Site-Selective Termination of DNA Replication by Caging The 3-Position of Thymidine and Its Application to Polymerase Chain Reaction (2009)
  • 著者名/発表者名: Akinori Kuzuya, Fuminori Okada, Makoto Komiyama
  • 雑誌名: Bioconjugate Chem. 20 ページ: 1924-1929
  • 査読あり
• [雑誌論文] Design and Construction of a Box-Shaped 3D-DNA Origami (2009)
  • 著者名/発表者名: Akinori Kuzuya, Makoto Komiyama
  • 雑誌名: Chem. Commun. ページ: 4182-4184
  • 査読あり
• [雑誌論文] Precisely Programmed and Robust 2D Streptavidin Nanoarray Using Periodical Nanometer-Scale Wells in DNA Origami Assembly (2009)
  • 著者名/発表者名: Akinori Kuzuya, Mayumi Kimura, Kentaro Numajiri, Naohiro Koshi, Toshiyuki Ohnishi, Fuminori Okada, Makoto Komiyama
  • 雑誌名: ChemBioChem 10 ページ: 1811-1815
  • 査読あり
• [雑誌論文] Efficient Site-selective RNA Activation and Scission Achieved by Geometry Control of Acridine Intercalation in RNA/DNA Heteroduplex (2009)
  • 著者名/発表者名: Akinori Kuzuya, Yun Shi, Keita Tanaka, Kenzo Machida, Makoto Komiyama
  • 雑誌名: Chem. Lett. 38 ページ: 432-433
  • 査読あり
• [雑誌論文] Single-Molecule Accommodation of Streptavidin in Nanometer-Scale Wells Formed in DNA Nanostructures (2008)
  • 著者名/発表者名: Akinori Kuzuya, Kentaro Numajiri, Mayumi Kimura, Makoto Komiyama
  • 雑誌名: Nucleic Acids Symp. Ser. 52 ページ: 681-682
  • 査読あり
• [学会発表] DNA Origamiによる箱形三次元ナノ構造体の作成 (2010)
  • 著者名/発表者名: 葛谷, 明紀
  • 学会等名: 日本化学会第90春季年会
  • 発表場所: 近畿大学
  • 年月日: 2010-03-29
• [学会発表] DNA origamiを足場にした機能性ナノマテリアルの選択的固定化 (2009)
  • 著者名/発表者名: 葛谷, 明紀
  • 学会等名: 計測自動制御学会システム・情報部門学術講演会2009
  • 発表場所: 東京工業大学
  • 年月日: 2009-11-26
• [学会発表] DNAナノ構造体に組み込んだナノメートルサイズのウェルへのゲスト分子の選択的取り込み (2009)
  • 著者名/発表者名: 葛谷, 明紀
  • 学会等名: 第58回高分子討論会
  • 発表場所: 熊本大学
  • 年月日: 2009-09-18
• [学会発表] DNA origamiによるナノメートルサイズの箱の作製 (2009)
  • 著者名/発表者名: 葛谷, 明紀
  • 学会等名: 第24回生体機能関連化学シンポジウム
  • 発表場所: 九州大学
  • 年月日: 2009-09-14
• [学会発表] ナノメートルサイズのウェルを組み込んだDNA origamiの構築とゲスト分子のサイズ選択的取り込み (2009)
  • 著者名/発表者名: 葛谷, 明紀
  • 学会等名: 第24回生体機能関連化学シンポジウム
  • 発表場所: 九州大学
  • 年月日: 2009-09-13
• [学会発表] Streptavidin nanoarray formed on a tape-like DNA nanostructure equipped with nanometer-sized wells (2009)
  • 著者名/発表者名: KUZUYA, Akinori
  • 学会等名: FNANO2010
  • 発表場所: Snowbird, Utah, USA
  • 年月日: 2009-04-22
• [学会発表] DNAで作ったナノメートル空間内におけるストレプトアビジンの選択的DNA修飾 (2008)
  • 著者名/発表者名: 沼尻, 健太郎
  • 学会等名: 日本化学会第89春季年会
  • 発表場所: 日本大学理工学部
  • 年月日: 2008-03-30
• [学会発表] ナノメートルサイズのウェルを複数組み込んだDNA Origamiの構築とタンパクナノアレイ作成への応用 (2008)
  • 著者名/発表者名: 葛谷, 明紀
  • 学会等名: 日本化学会第89春季年会
  • 発表場所: 日本大学理工学部
  • 年月日: 2008-03-30
• [備考]
  • URL: http://www.mkomi.rcast.u-tokyo.ac.jp/member/kuzuya.htm