小分子RNAを含むリボヌクレオプロテイン複合体の機能の構造基盤の解明

2010 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 20770079
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 構造生物化学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 西増 弘志 東京大学, 大学院・理学系研究科, 特任助教 (00467044)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2010
• キーワード: タンパク質 / 核酸 / 結晶構造

研究概要

高度好熱菌Thermus thermophilusに由来するtRNAメチル化酵素TrmFOの結晶構造を決定し,TrmFOが葉酸/FAD依存的にtRNA U54をメチル化する反応メカニズムを解明した.好熱性古細菌Pyrocuccus horikoshiiとMehtanococcus jannaschiiに由来するtRNA修飾酵素TYW2の結晶構造を決定し,TYW2がS-アデノシルメチオニンのα-アミノα-カルボキシプロピル基をtRNA imG-14に転移する反応メカニズムを解明した.

研究成果

• [雑誌論文] Crystal structure of autotaxin and insight into GPCR activation by lipid mediators (2011)
  • 著者名/発表者名: H.Nishimasu, S.Okudaira, K.Hama, E.Mihara, N.Dohmae, A.Inoue, R.Ishitani, J.Takagi, J.Aoki, O.Nureki.
  • 雑誌名: Nat Struct Mol Biol 18 ページ: 205-212
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structure of a PFU-PUL domain pair of Saccharomyces cerevisiae Doa1/Ufd3R. (2010)
  • 著者名/発表者名: Nishimasu, H.Komori, Y.Higuchi, H.Nishimasu, H.Hiroaki.
  • 雑誌名: Kobe J Med Sci 56 ページ: 125-139
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural basis of novel interactions between the small-GTPase and GDI-like domains in prokaryotic FeoB iron transporter (2009)
  • 著者名/発表者名: M.Hattori, Y.Jin, H.Nishimasu, Y.Tanaka, M.Mochizuki, T.Uchiumi, R.Ishitani, K.Ito, O.Nureki.
  • 雑誌名: Structure 17 ページ: 1345-1355
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural basis of AdoMet-dependent aminocarboxypropyl transfer reaction catalyzed by tRNA-wybutosine synthesizing enzyme, TYW2 (2009)
  • 著者名/発表者名: M.Umitsu, H.Nishimasu, A.Noma, T.Suzuki, R.Ishitani, O.Nureki.
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci USA 106 ページ: 15616-15621
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of the truncated cytosolic domain of the iron transporter FeoB (2009)
  • 著者名/発表者名: Y.Jin, M.Hattori, H.Nishimasu, R.Ishitani, O.Nureki.
  • 雑誌名: Acta Crystallogr F 65 ページ: 784-787
  • 査読あり
• [雑誌論文] Atomic structure of a folate/FAD-dependent tRNA T54 methyltransferase (2009)
  • 著者名/発表者名: H.Nishimasu, R.Ishitani, K.Yamashita, C.Iwashita, A.Hirata, H.Hori, O.Nureki.
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci USA 106 ページ: 8180-8185
  • 査読あり
• [学会発表] Structural basis of AdoMet-dependent aminocarboxypropyl transfer reaction catalyzed by tRNA-wybutosine synthesizing enzyme, TYW2 (2010)
  • 著者名/発表者名: 西増弘志
  • 学会等名: BMB2010
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2010-12-08
• [学会発表] Atomic structure of a folate/FAD-dependent tRNA T54 methyltransferase (2010)
  • 著者名/発表者名: Hiroshi Nishimasu
  • 学会等名: 23rd tRNA workshop
  • 発表場所: ポルトガル,アヴェイロ
  • 年月日: 2010-01-29
• [学会発表] 葉酸/FAD依存性tRNA U54メチル化酵素TrmFOの機能と構造 (2009)
  • 著者名/発表者名: 西増弘志
  • 学会等名: 第11回RNAミーティング
  • 発表場所: 新潟朱鷺メッセ
  • 年月日: 2009-07-28
• [学会発表] 1.0-A resolution structure of a new RNA modification enzyme (2009)
  • 著者名/発表者名: Hiroshi Nishimasu
  • 学会等名: Gordon Research Conferences (RNA editing)
  • 発表場所: アメリカ,テキサス
  • 年月日: 2009-01-12
• [図書] 実験医学増刊 拡大・進展を続けるRNA研究の最先端 (2010)
  • 著者名/発表者名: 西増弘志, 濡木理
  • 総ページ数: 207(107-113)
  • 出版者: 羊土社