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2008 年度 実績報告書

地球上の重要生産者である珪藻類の動態はウイルス感染の影響をどの程度受けるか

研究課題

研究課題/領域番号 20780149
研究機関独立行政法人水産総合研究センター

研究代表者

外丸 裕司  独立行政法人水産総合研究センター, 瀬戸内海区水産研究所・赤潮環境部, 研究員 (10416042)

キーワード珪藻 / ウイルス / 生態 / 水産学
研究概要

珪藻ウイルスの現場動態をMPN法(限界希釈法)により広島湾で測定した結果,ウイルス出現量に季節的変動が認められた.しかしながら,とくにキートセロス属の種判別は困難であったため,宿主動態との関係にはさらなる検討が必要と思われた.この問題を解決するため,様々な珪藻種を分離培養し,各種遺伝子を標的とした塩基配列解析を行い,客観的な分子定量技術を開発するための基盤整備を行った.
沿岸域ブルーム原因珪藻キートセロス・テヌイッシマス14株と同種感染性ウイルス9株との間で交差試験を行った.その結果,9株のウイルスの内2株が明らかに他ウイルス株と異なる宿主株感染特異性を示した.このことは本種個体群とウイルス個体群との間に複雑な感染-被感染性の関係を示すものと思われた.また感染特異性の異なる2株のウイルスは,いずれもDNAウイルスであることが明らかになった.その内1株を珪藻ウイルスCtenDNAV(粒径37±2nm)と命名しさらなる解析を行った結果,本ウイルスは38.5kDaの主要タンパク質を持つ環状1本鎖DNAウイルスであることが明らかになった.共通の珪藻宿主を持つゲノムタイプの異なるウイルス(RNA,DNA)の分離に成功したのは,本研究が初めてである.
これまでに性状が明らかにされている珪藻感染性1本鎖RNAウイルス3種(CtenRNAV,RsRNAV,CsfrRNAV)のRNA依存性RNAポリメラーゼドメインを対象としたNJ法による系統学的解析を行った結果,それらは明らかな単系統を形成し,また塩基配列を用いたBLASTによる相同性解析でも,それらがお互いにきわめて近しい関係にあることが示された.以上の結果により,海洋環境中に進化的に近しい珪藻感染性ssRNAウイルスグループが存在するものと推定された.

  • 研究成果

    (14件)

すべて 2009 2008 その他

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (10件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Characterization of the Chaetoceros salsugineum nuclear inclusion virus coat protein gene.2009

    • 著者名/発表者名
      Park, Y., Jung, S. -E., Tomaru, Y., Choi, W. -B., Mizumoto, H., Nagasaki, K., Choi, T. -J.
    • 雑誌名

      Virus Research (印刷中)

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Isolation and characterization of a single-stranded RNA virus infecting the bloom forming diatom Chaetoceros socialis.2009

    • 著者名/発表者名
      Tomaru, Y., Takao, Y., Suzuki, H., Nagumo, T., Nagasaki, K.
    • 雑誌名

      Appl. Environ. Microbiol. (印刷中)

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Isolation and characterization of a single-stranded RNA virus infecting the marine planktonic diatom Chaetoceros tenuissmus Meunier.2008

    • 著者名/発表者名
      Shirai, Y., Tomaru, Y., Takao, Y., Suzuki, H., Nagumo, T., Nagasaki, K.
    • 雑誌名

      Appl. Environ. Microbiol. 74

      ページ: 4022-4027

    • 査読あり
  • [学会発表] 珪藻に感染するウイルス-これまでの研究と今後の展望-2009

    • 著者名/発表者名
      外丸裕司,豊田健介,白井葉子,高尾祥丈,水本祐之,鈴木秀和,南雲保,長崎慶三
    • 学会等名
      日本藻類学会第33回大会講演要旨集
    • 発表場所
      沖縄県(琉球大学)
    • 年月日
      2009-03-27
  • [学会発表] 海産浮遊性珪藻類の分子生物学的手法による種識別・検出・定量解析について2009

    • 著者名/発表者名
      豊田健介,長崎慶三,外丸裕司
    • 学会等名
      日本藻類学会第33回大会講演要旨集
    • 発表場所
      沖縄県(琉球大学)
    • 年月日
      2009-03-27
  • [学会発表] ガラス質の鎧を纏う珪藻類もウイルスの攻撃を受ける2008

    • 著者名/発表者名
      長崎慶三,豊田健介,白井葉子,外丸裕司
    • 学会等名
      第56回日本ウイルス学会学術集会抄録集
    • 発表場所
      岡山県(岡山コンベンションセンター)
    • 年月日
      2008-10-27
  • [学会発表] 海産珪藻Chaetoceros socialis f. radiansに感染するRNAウイルスの基本性状.2008

    • 著者名/発表者名
      外丸裕司,高尾祥丈,鈴木秀和,南雲保,長崎慶三
    • 学会等名
      日本珪藻学会第28回研究集会講演要旨集
    • 発表場所
      山梨県(富士桜山荘)
    • 年月日
      2008-10-25
  • [学会発表] 珪藻Chaetoceros socialisに感染するRNAウイルス(CsfrRNAV)の生理・生態・遺伝学的性状.2008

    • 著者名/発表者名
      外丸裕司,高尾祥丈,鈴木秀和,南雲保,長崎慶三
    • 学会等名
      2008年度日本海洋学会秋季大会講演要旨集
    • 発表場所
      広島県(広島国際大学)
    • 年月日
      2008-09-27
  • [学会発表] Diatom viruses infectious to genera Rhizosolenia and Chaetoceros.2008

    • 著者名/発表者名
      Tomaru, Y., Shirai, Y., Takao, Y., Suzuki, H., Nagumo, T., Nagasaki, K.
    • 学会等名
      20th International Diatom Symposium 2008
    • 発表場所
      クロアチア(ドブロブニク)
    • 年月日
      2008-09-09
  • [学会発表] 珪藻類のリアルタイムPCR法による検出・定量解析の試み.2008

    • 著者名/発表者名
      豊田健介,長崎慶三,外丸裕司
    • 学会等名
      2008年日本プランクトン学会・日本ベントス学会合同大会in熊本講演要旨集
    • 発表場所
      熊本県(熊本県立大学)
    • 年月日
      2008-09-06
  • [学会発表] Identification and characterization of the putative coat protein gene in Chaetoceros salsugineum nuclear inclusion virus.2008

    • 著者名/発表者名
      Park, Y., Tomaru, Y., Lee, K., Nagasaki, K., Choi, T.
    • 学会等名
      Abstracts of The 5th Aquatic Virus Workshop
    • 発表場所
      カナダ(バンクーバー)
    • 年月日
      2008-07-08
  • [学会発表] Fateful encounter of virology and diatomology.2008

    • 著者名/発表者名
      Tomaru, Y., Shirai, Y., Takao, Y., Mizumoto, H., Suzuki, H., Nagumo, T., Toyoda, K., Nagasaki, K.
    • 学会等名
      Abstracts of The 5th Aquatic Virus Workshop
    • 発表場所
      カナダ(バンクーバー)
    • 年月日
      2008-07-08
  • [学会発表] ガラスの鎧を持つ珪藻類はウイルスに感染するか?2008

    • 著者名/発表者名
      長崎慶三,豊田健介,白井葉子,外丸裕司
    • 学会等名
      第7回GS特別研究プロジェクト公開シンポジウム講演要旨集
    • 発表場所
      高知県(高知大学)
    • 年月日
      2008-05-23
  • [備考]

    • URL

      http://feis.fra.affrc.go.jp/cgi-bin/htmlgen/htmllab.cgi?seigyo

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公開日: 2010-06-11   更新日: 2016-04-21  

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