環境微生物の機能解明に不可欠なシングルセルレベルでの視覚的な遺伝子検出技術の開発

2009 年度 研究成果報告書

• 研究課題/領域番号: 20860009
• 研究種目: 若手研究(スタートアップ)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 土木環境システム
• 研究機関: 東北大学
• 研究代表者: 久保田 健吾 東北大学, 大学院・工学研究科, 助教 (80455807)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2009
• キーワード: FISH法 / 遺伝子 / 環境微生物

研究概要

微生物の機能遺伝子を細胞を破壊せず視覚的に検出可能な技術を開発することを目的とした。その結果、我々が開発したtwo-pass TSA-FISH法とオリゴヌクレオチドプローブあるいはポリヌクレオチドプローブを用いて、検出可能な技術を開発した。技術の特異性など様々な特徴を調査した。また環境サンプルに適用することで、技術の将来性を示すことが出来た。

研究成果

• [雑誌論文] Detection of single copy genes by two-pass tyramide signal amplification fluorescence in situ hybridization (two-pass TSA-FISH) with single oligonucleotide probes (2010)
  • 著者名/発表者名: Kawakami, S., K. Kubota, H. Imachi, T. Yamaguchi, H. Harada, A. Ohashi
  • 雑誌名: Microbes and Environments 25 ページ: 15-21
  • 査読あり
• [雑誌論文] 機能遺伝子を標的とした two-pass TSA-FISH法による環境中未培養微生物の機能推定 (2009)
  • 著者名/発表者名: 長谷川拓也, 川上周司, 久保田健吾, 井町寛之, 大橋晶良, 原田秀樹
  • 雑誌名: 環境工学研究論文集 46 ページ: 537-544
  • 査読あり
• [学会発表] TSA-FISH法を用いた機能遺伝子に基づいた微生物の視覚的検出技術の開発と適用 (2010)
  • 著者名/発表者名: 川上周司, 久保田健吾, 長谷川拓也, 松浦哲久, 大矢明子, 井町寛之, 山口隆司, 原田秀樹, 大橋晶良
  • 学会等名: 第44回日本水環境学会
  • 発表場所: 福岡大学
  • 年月日: 2010-03-17
• [学会発表] 機能遺伝子を標的とした two-pass TSA-FISH法による環境中未培養微生物の機能推定 (2009)
  • 著者名/発表者名: 長谷川拓也, 川上周司, 久保田健吾, 井町寛之, 大橋晶良, 原田秀樹
  • 学会等名: 第46回環境工学研究フォーラム
  • 発表場所: 新島学園短期大学
  • 年月日: 2009-11-29
• [学会発表] 機能遺伝子を標的とした two-pass TSA-FISH法による環境中未培養微生物の検出 (2009)
  • 著者名/発表者名: 長谷川拓也, 川上周司, 久保田健吾, 井町寛之, 大橋晶良, 原田秀樹
  • 学会等名: 第25回日本微生物生態学会大会
  • 発表場所: 広島大学
  • 年月日: 2009-11-21
• [学会発表] Gene FISHによる環境中未培養微生物の機能同定 (2009)
  • 著者名/発表者名: 長谷川拓也, 川上周司, 久保田健吾, 井町寛之, 大橋晶良, 原田秀樹
  • 学会等名: 平成21年度土木学会全国大会
  • 発表場所: 福岡大学
  • 年月日: 2009-09-04
• [学会発表] ポリプローブを用いた two-pass TSA-FISH法による微生物の機能遺伝子の特異的検出 (2009)
  • 著者名/発表者名: 長谷川拓也, 川上周司, 久保田健吾, 井町寛之, 山口隆司, 大橋晶良, 原田秀樹
  • 学会等名: 水環境学会
  • 発表場所: 山口大学
  • 年月日: 2009-03-16
• [学会発表] シングルセルレベルでの微生物の機能遺伝子の特異的検出 (2009)
  • 著者名/発表者名: 長谷川拓也, 川上周司, 久保田健吾, 井町寛之, 山口隆司, 大橋晶良, 原田秀樹
  • 学会等名: 土木学会 東北支部
  • 発表場所: 東北学院大学
  • 年月日: 2009-03-07